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小木虫论坛-学术科研互动平台 » 生物医药区 » 分子生物 » 生物信息 » 急急急，序列比对
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心中的四月

新虫 (小有名气)

[求助] 急急急，序列比对 已有2人参与

本人菜鸟一个，DNA测序结果出来了，老师让自己比对一下，但是不知道和什么比对，怎么比对，求助大神！急急急

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1楼 2016-05-07 15:38:03
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卡维斯

金虫 (正式写手)

【答案】应助回帖

感谢参与，应助指数 +1
用简单的DNAMAN即可，上网自己下载一个就可以。
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心中的四月
2楼2016-05-07 16:43:19
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大怪兽带匕首

新虫 (初入文坛)
楼主会了吗？我们老师也交给我们这样的作业，交流一下？

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3楼2016-05-07 18:05:17
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心中的四月

新虫 (小有名气)
引用回帖:
3楼: Originally posted by 大怪兽带匕首 at 2016-05-07 18:05:17
楼主会了吗？我们老师也交给我们这样的作业，交流一下？

不会呢

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4楼2016-05-07 20:57:34
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心中的四月

新虫 (小有名气)
送红花一朵
引用回帖:
2楼: Originally posted by 卡维斯 at 2016-05-07 16:43:19
用简单的DNAMAN即可，上网自己下载一个就可以。

好的，谢谢！

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5楼2016-05-07 20:58:03
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stone2239

铁杆木虫 (著名写手)

【答案】应助回帖

感谢参与，应助指数 +1
可以先在NCBI网站上做blast比对。
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6楼2016-05-07 22:40:05
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心中的四月

新虫 (小有名气)
引用回帖:
6楼: Originally posted by stone2239 at 2016-05-07 22:40:05
可以先在NCBI网站上做blast比对。

比对之后出现很多结果，应该怎么看结果？

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7楼2016-05-08 07:42:08
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stone2239

铁杆木虫 (著名写手)

【答案】应助回帖

引用回帖:
7楼: Originally posted by 心中的四月 at 2016-05-08 07:42:08
比对之后出现很多结果，应该怎么看结果？
...

你扩增的是已知序列还是未知序列？你比对的目的是什么呢？如果是看扩增结果正确与否，那就看你的序列是否和数据库中你的目标序列一致。如果是未知序列，根据blast结果可以判断你扩增得到的是什么基因，有什么功能等。
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8楼2016-05-08 10:49:28
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心中的四月

新虫 (小有名气)
引用回帖:
8楼: Originally posted by stone2239 at 2016-05-08 10:49:28
你扩增的是已知序列还是未知序列？你比对的目的是什么呢？如果是看扩增结果正确与否，那就看你的序列是否和数据库中你的目标序列一致。如果是未知序列，根据blast结果可以判断你扩增得到的是什么基因，有什么功能等 ...

我扩增的是未知序列

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9楼2016-05-08 10:50:20
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心中的四月

新虫 (小有名气)
怎么判断我扩增的是什么基因？非常谢谢

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10楼2016-05-08 10:52:33
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