| 查看: 5348 | 回复: 11 | ||
| 当前只显示满足指定条件的回帖，点击这里查看本话题的所有回帖 | ||
[求助]
关于用lammps的compute 命令计算原子位移 已有2人参与
|
||
|
我想要计算原子的位移，使用的是compute dis all displace/atom，但是计算出现错误。ERROR: Dump custom compute does not calculate per-atom vector 部分输入文件如下： fix 1 all npt temp 300.0 300.1 1.0 x 0.0 0.0 3000 y 0.0 0.0 3000 z 0.0 0.0 3000 fix 2 all temp/rescale 1 300 300.1 0.05 1.0 compute s all stress/atom NULL compute strea all reduce sum c_s[1] variable stressa equal c_strea/vol compute streb all reduce sum c_s[2] variable stressb equal c_streb/vol compute strec all reduce sum c_s[3] variable stressc equal c_strec/vol compute epot all pe/atom compute csym all centro/atom 4 compute coord all coord/atom 2.0 compute 1 all pe/atom compute 2 all ke/atom compute dis all displace/atom thermo_style custom step temp etotal press v_stressa v_stressb v_stressc vol lx ly lz dump 2 all custom 1000 dump.2 id type xu yu zu c_1 c_2 c_dis run 200000 |
回复此楼» 猜你喜欢
售SCI一区T0P文章，我:8O.55.1.O.54,科目全,可伽急
已经有12人回复
-
售SCI一区T0P文章，我:8.O.55.1.O54,科目全,可伽急
已经有5人回复
-
科研人应该花精力去思考如何解决问题，而不是去凝练问题
已经有16人回复
-
初秋的晨风
已经有3人回复
-
面上没中，邀请各位路过的虫友分析一下分数
已经有11人回复
-
Ei源刊怎么投
已经有4人回复
-
广西大学-广州大学招聘博士后 欢迎广大优秀人才！！！
已经有6人回复
-
两块石头
已经有5人回复
-
哈尔滨工业大学韩晓军教授课题组招收2027年硕士推免生及博士研究生
已经有3人回复
-
找导师
已经有8人回复
12楼2016-05-06 14:34:54
abinitio
版主 (著名写手)
- 模拟EPI: 2
- 应助: 221 (大学生)
- 贵宾: 0.093
- 金币: 7365.2
- 散金: 3917
- 红花: 57
- 帖子: 1317
- 在线: 485.2小时
- 虫号: 368545
- 注册: 2007-05-11
- 性别: GG
- 专业: 凝聚态物性I:结构、力学和
- 管辖: 分子模拟
2楼2016-05-03 15:50:51
3楼2016-05-03 15:54:37
4楼2016-05-03 20:55:03