| 查看: 5251 | 回复: 11 | ||
[求助]
关于用lammps的compute 命令计算原子位移 已有2人参与
|
||
|
我想要计算原子的位移，使用的是compute dis all displace/atom，但是计算出现错误。ERROR: Dump custom compute does not calculate per-atom vector 部分输入文件如下： fix 1 all npt temp 300.0 300.1 1.0 x 0.0 0.0 3000 y 0.0 0.0 3000 z 0.0 0.0 3000 fix 2 all temp/rescale 1 300 300.1 0.05 1.0 compute s all stress/atom NULL compute strea all reduce sum c_s[1] variable stressa equal c_strea/vol compute streb all reduce sum c_s[2] variable stressb equal c_streb/vol compute strec all reduce sum c_s[3] variable stressc equal c_strec/vol compute epot all pe/atom compute csym all centro/atom 4 compute coord all coord/atom 2.0 compute 1 all pe/atom compute 2 all ke/atom compute dis all displace/atom thermo_style custom step temp etotal press v_stressa v_stressb v_stressc vol lx ly lz dump 2 all custom 1000 dump.2 id type xu yu zu c_1 c_2 c_dis run 200000 |
回复此楼» 猜你喜欢
关于豆爷回答的JTJC与%2F数量
已经有4人回复
-
基金中了
已经有11人回复
-
filecode
已经有18人回复
-
听说今天filecode变了
已经有44人回复
-
固定端突然变了，今天
已经有8人回复
-
filecode
已经有11人回复
-
大家散了吧，后缀研究没有意义，别浪费时间了，过好目前的每一天，不要焦虑
已经有6人回复
-
一个有机合成实验室都需要哪些设备？
已经有12人回复
-
求各位大神看下
已经有33人回复
-
咨询面上基金
已经有7人回复
» 本主题相关价值贴推荐，对您同样有帮助:
- 关于lammps计算裂纹扩展
已经有1人回复
- 关于lammps原子性质计算
已经有5人回复
- 关于lammps输出原子的着色问题
已经有8人回复
- 关于lammps的dump文件的数据处理
已经有0人回复
- 关于体积模量的计算-lammps
已经有2人回复
- 关于复杂分子的lammps坐标问题？
已经有5人回复
- 关于用lammps做气体分子增加导致外围结构变形的问题
已经有0人回复
- 关于用lammps建立无限延伸聚合物晶体模型的问题
已经有2人回复
- 关于使用lammps中的pour功能
已经有0人回复
- 关于LAMMPS的位错建模
已经有9人回复
- 关于lammps力加载
已经有0人回复
- 关于lammps
已经有0人回复
- 关于lammps添加pair作用力
已经有3人回复
- 关于用lammps计算金属表面能的问题
已经有1人回复
- 关于lammps中某种atom个数的统计方法
已经有10人回复
- 关于lammps输出文件坐标的问题
已经有9人回复
- 关于用Lammps模拟Cu熔点的例子问题
已经有7人回复
- 关于lammps中水的tip5p模型
已经有1人回复
- 【分享】LAMMPS的语法中文解释
已经有137人回复
- 【求助】关于LAMMPS 运行的问题
已经有6人回复
5楼2016-05-03 20:56:41
6楼2016-05-04 10:32:46
4楼2016-05-03 20:55:03
abinitio
版主 (著名写手)
- 模拟EPI: 2
- 应助: 221 (大学生)
- 贵宾: 0.093
- 金币: 7365.2
- 散金: 3917
- 红花: 57
- 帖子: 1317
- 在线: 485.2小时
- 虫号: 368545
- 注册: 2007-05-11
- 性别: GG
- 专业: 凝聚态物性I:结构、力学和
- 管辖: 分子模拟
2楼2016-05-03 15:50:51
3楼2016-05-03 15:54:37
7楼2016-05-06 08:55:08
8楼2016-05-06 08:56:03
LAMMPS没有那么智能，自己把dump的数据处理一下，用tecplot显示矢量 9楼2016-05-06 10:00:25
10楼2016-05-06 10:09:26
50