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关于用lammps的compute 命令计算原子位移 已有2人参与
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我想要计算原子的位移，使用的是compute dis all displace/atom，但是计算出现错误。ERROR: Dump custom compute does not calculate per-atom vector 部分输入文件如下： fix 1 all npt temp 300.0 300.1 1.0 x 0.0 0.0 3000 y 0.0 0.0 3000 z 0.0 0.0 3000 fix 2 all temp/rescale 1 300 300.1 0.05 1.0 compute s all stress/atom NULL compute strea all reduce sum c_s[1] variable stressa equal c_strea/vol compute streb all reduce sum c_s[2] variable stressb equal c_streb/vol compute strec all reduce sum c_s[3] variable stressc equal c_strec/vol compute epot all pe/atom compute csym all centro/atom 4 compute coord all coord/atom 2.0 compute 1 all pe/atom compute 2 all ke/atom compute dis all displace/atom thermo_style custom step temp etotal press v_stressa v_stressb v_stressc vol lx ly lz dump 2 all custom 1000 dump.2 id type xu yu zu c_1 c_2 c_dis run 200000 |
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5楼2016-05-03 20:56:41
6楼2016-05-04 10:32:46
4楼2016-05-03 20:55:03
abinitio
版主 (著名写手)
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2楼2016-05-03 15:50:51
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7楼2016-05-06 08:55:08
8楼2016-05-06 08:56:03
LAMMPS没有那么智能，自己把dump的数据处理一下，用tecplot显示矢量 9楼2016-05-06 10:00:25
10楼2016-05-06 10:09:26