应《网络安全法》要求，自2017年10月1日起，未进行实名认证将不得使用互联网跟帖服务。为保障您的帐号能够正常使用，请尽快对帐号进行手机号验证，感谢您的理解与支持！

24小时热门版块排行榜    

小木虫论坛-学术科研互动平台 » 计算模拟区 » 计算模拟 » 如何确定H原子坐标
51/1返回列表
查看: 655  |  回复: 3
只看楼主 @他人 存档 新回复提醒 (忽略) 收藏    在APP中查看
当前只显示满足指定条件的回帖，点击这里查看本话题的所有回帖

悄悄66

新虫 (小有名气)

[求助] 如何确定H原子坐标 已有1人参与

求助，我现在要对Ca5（AsO4)3OH,Sr（AsO4)3OH在MS中建模，可是文献中查不到H的原子坐标，我要如何确定氢原子的坐标呢，这个问题很棘手，各位路过的有经验的前辈指导指导，不胜感激！先谢谢啦！
回复此楼

» 猜你喜欢

» 本主题相关价值贴推荐，对您同样有帮助:
1楼 2016-04-14 22:45:26
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

月只蓝

主管区长 (职业作家)
引用回帖:
3楼: Originally posted by 悄悄66 at 2016-04-15 10:41:19
谢谢您的指导，我这边的资源实现不了第一种办法，第二种办法中的O-H键的长度文献中也没有给出，现在我能找到和它同构的Ca5(PO4)3OH的H原子坐标，我可以拿来用吗？再次谢谢老师的耐心解答....

两种晶体只是在结构上相似，不是完全相同，晶体中的原子坐标不一定完全相同。
除非能确定两种晶体中所有原子坐标完全相同。
赞一下 回复此楼
MATLAB、MS小问题、普通问题请发帖求助！时间精力有限，恕不接受无偿私信求助。
4楼2016-04-15 10:44:21
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
查看全部 4 个回答

月只蓝

主管区长 (职业作家)

【答案】应助回帖

感谢参与，应助指数 +1
H原子太轻，普通的XRD技术往往捕捉不到H原子的位置，所以文献中往往没有给出H原子的坐标。
此时，有两个办法，一个办法是自己培养所需晶体的单晶，然后做单晶衍射，解晶体，获得H原子的坐标，这个办法有实验数据，更能得到同行评审的认可。
另一个办法就是根据氢氧键的长度，手动添加H原子，然后做几何优化，以几何优化后确定的H原子坐标为准。
赞一下(1人) 回复此楼

» 本帖已获得的红花（最新10朵）

悄悄66
MATLAB、MS小问题、普通问题请发帖求助！时间精力有限，恕不接受无偿私信求助。
2楼2016-04-15 09:30:00
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

悄悄66

新虫 (小有名气)
送红花一朵
引用回帖:
2楼: Originally posted by 月只蓝 at 2016-04-15 09:30:00
H原子太轻，普通的XRD技术往往捕捉不到H原子的位置，所以文献中往往没有给出H原子的坐标。
此时，有两个办法，一个办法是自己培养所需晶体的单晶，然后做单晶衍射，解晶体，获得H原子的坐标，这个办法有实验数据， ...

谢谢您的指导，我这边的资源实现不了第一种办法，第二种办法中的O-H键的长度文献中也没有给出，现在我能找到和它同构的Ca5(PO4)3OH的H原子坐标，我可以拿来用吗？再次谢谢老师的耐心解答.
赞一下 回复此楼
3楼2016-04-15 10:41:19
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
查看全部 4 个回答
普通表情 龙 兔 虎 猫
最具人气热帖推荐 [查看全部] 作者 回/看 最后发表
[考研] 305分求调剂（食品工程） +5 Sxy112 2026-03-21 7/350 2026-03-24 12:27 by 544594351
[考研] 0856材料专硕353求调剂 +5 NIFFFfff 2026-03-20 5/250 2026-03-24 11:46 by 544594351
[考研] 一志愿河北工业大学0817化工278分求调剂 +7 jhybd 2026-03-23 12/600 2026-03-24 09:03 by jhybd
[基金申请] 请教下大家 2026年国家基金申请是双盲审吗？ +3 lishucheng1 2026-03-22 5/250 2026-03-24 08:22 by gltch
[考研] 291求调剂 +8 hhhhxn.. 2026-03-23 8/400 2026-03-23 23:15 by peike
[考研] 0854 考研调剂 招生了！AI 方向 +4 pk3725069 2026-03-19 16/800 2026-03-23 23:09 by 汪！？！
[考研] 284求调剂 +3 yanzhixue111 2026-03-23 6/300 2026-03-23 22:58 by pswait
[考研] 材料专硕英一数二306 +8 z1z2z3879 2026-03-18 8/400 2026-03-23 20:49 by baobaoye
[考研] 328求调剂 +4 LHHL66 2026-03-23 4/200 2026-03-23 14:55 by lbsjt
[考研] 一志愿东华大学化学070300，求调剂 +7 2117205181 2026-03-21 8/400 2026-03-22 22:55 by chixmc
[考研] 289材料与化工（085600）B区求调剂 +3 这么名字咋样 2026-03-22 4/200 2026-03-22 17:56 by 云民大李老师
[考研] 306求调剂 +5 来好运来来来 2026-03-22 5/250 2026-03-22 16:17 by BruceLiu320
[考研] 一志愿中南化学（0703）总分337求调剂 +9 niko- 2026-03-19 10/500 2026-03-22 16:08 by ColorlessPI
[考研] 319求调剂 +4 小力气珂珂 2026-03-20 4/200 2026-03-22 15:53 by ColorlessPI
[考研] 一志愿北京化工大学070300 学硕336求调剂 +5 vv迷 2026-03-21 8/400 2026-03-22 14:20 by ColorlessPI
[考研] 0703化学调剂 +4 妮妮ninicgb 2026-03-21 4/200 2026-03-21 18:39 by 学员8dgXkO
[考研] 296求调剂 +4 www_q 2026-03-20 4/200 2026-03-21 17:26 by 学员8dgXkO
[考研] 一志愿重庆大学085700资源与环境总分308求调剂 +7 墨墨漠 2026-03-20 7/350 2026-03-21 16:36 by barlinike
[考研] 一志愿吉林大学材料学硕321求调剂 +11 Ymlll 2026-03-18 15/750 2026-03-20 19:40 by 丁丁*
[考研] 生物学调剂招人！！！ +3 山海天岚 2026-03-17 4/200 2026-03-19 21:34 by 怎么释怀
信息提示
关闭
请填处理意见
关闭