应《网络安全法》要求，自2017年10月1日起，未进行实名认证将不得使用互联网跟帖服务。为保障您的帐号能够正常使用，请尽快对帐号进行手机号验证，感谢您的理解与支持！

24小时热门版块排行榜    

小木虫论坛-学术科研互动平台 » 计算模拟区 » 计算模拟 » 如何确定H原子坐标
41/1返回列表
查看: 760  |  回复: 3
只看楼主 @他人 存档 新回复提醒 (忽略) 收藏    在APP中查看

悄悄66

新虫 (小有名气)

[求助] 如何确定H原子坐标 已有1人参与

求助，我现在要对Ca5（AsO4)3OH,Sr（AsO4)3OH在MS中建模，可是文献中查不到H的原子坐标，我要如何确定氢原子的坐标呢，这个问题很棘手，各位路过的有经验的前辈指导指导，不胜感激！先谢谢啦！
回复此楼

» 猜你喜欢

» 本主题相关价值贴推荐，对您同样有帮助:
1楼 2016-04-14 22:45:26
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

月只蓝

主管区长 (职业作家)

【答案】应助回帖

感谢参与，应助指数 +1
H原子太轻，普通的XRD技术往往捕捉不到H原子的位置，所以文献中往往没有给出H原子的坐标。
此时，有两个办法，一个办法是自己培养所需晶体的单晶，然后做单晶衍射，解晶体，获得H原子的坐标，这个办法有实验数据，更能得到同行评审的认可。
另一个办法就是根据氢氧键的长度，手动添加H原子，然后做几何优化，以几何优化后确定的H原子坐标为准。
赞一下(1人) 回复此楼

» 本帖已获得的红花（最新10朵）

悄悄66
MATLAB、MS小问题、普通问题请发帖求助！时间精力有限，恕不接受无偿私信求助。
2楼2016-04-15 09:30:00
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

悄悄66

新虫 (小有名气)
送红花一朵
引用回帖:
2楼: Originally posted by 月只蓝 at 2016-04-15 09:30:00
H原子太轻，普通的XRD技术往往捕捉不到H原子的位置，所以文献中往往没有给出H原子的坐标。
此时，有两个办法，一个办法是自己培养所需晶体的单晶，然后做单晶衍射，解晶体，获得H原子的坐标，这个办法有实验数据， ...

谢谢您的指导，我这边的资源实现不了第一种办法，第二种办法中的O-H键的长度文献中也没有给出，现在我能找到和它同构的Ca5(PO4)3OH的H原子坐标，我可以拿来用吗？再次谢谢老师的耐心解答.
赞一下 回复此楼
3楼2016-04-15 10:41:19
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

月只蓝

主管区长 (职业作家)
引用回帖:
3楼: Originally posted by 悄悄66 at 2016-04-15 10:41:19
谢谢您的指导，我这边的资源实现不了第一种办法，第二种办法中的O-H键的长度文献中也没有给出，现在我能找到和它同构的Ca5(PO4)3OH的H原子坐标，我可以拿来用吗？再次谢谢老师的耐心解答....

两种晶体只是在结构上相似，不是完全相同，晶体中的原子坐标不一定完全相同。
除非能确定两种晶体中所有原子坐标完全相同。
赞一下 回复此楼
MATLAB、MS小问题、普通问题请发帖求助！时间精力有限，恕不接受无偿私信求助。
4楼2016-04-15 10:44:21
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
相关版块跳转 我要订阅楼主 悄悄66 的主题更新
41/1返回列表
普通表情 龙 兔 虎 猫
最具人气热帖推荐 [查看全部] 作者 回/看 最后发表
[教师之家] 售SCI一区T0P文章，我:8O.55.1.O.5.4,科目齐全,可+急 +4 7lpolszZVXgi 2026-08-14 4/200 2026-08-15 01:08 by 4wMiSEwB6436
[考研] 售SCI一区T0P文章，我:8.O55.1.O.54,科目全,可十急 +3 HFw0lei2R37i 2026-08-14 7/350 2026-08-15 00:40 by 4wMiSEwB6436
[论文投稿] 售SCI一区文章，我:8O5.5.1.O5.4,科目全,可伽急 +3 HFw0lei2R37i 2026-08-14 5/250 2026-08-15 00:16 by 4wMiSEwB6436
[基金申请] 咱们一起用铁证分析2026国家社科基金中标与否 +7 启萌科技 2026-08-12 22/1100 2026-08-14 23:45 by Noways
[基金申请] 是这周出结果还是下周出结果？ +4 yuleib84 2026-08-11 4/200 2026-08-14 23:05 by lfy8008
[教师之家] 售SCI一区文章，我:8.O.55.1.O.54,科目齐全,可伽急 +3 HFw0lei2R37i 2026-08-14 5/250 2026-08-14 22:32 by 4wMiSEwB6436
[基金申请] 奇怪，两个人的filecode固定段从头到尾一模一样 +8 布布和一二 2026-08-10 11/550 2026-08-14 14:58 by Equinoxhua
[基金申请] 有时候，自然基金真的不能太认真 （我的申报经验） +6 majunge000 2026-08-11 8/400 2026-08-14 14:44 by 医学老男孩
[基金申请] 应该是93bebmhtak前后十一个字符比较关键 +23 Lanmanbaby 2026-08-09 37/1850 2026-08-14 13:40 by Equinoxhua
[基金申请] 好奇怪的filecode +6 布布和一二 2026-08-08 7/350 2026-08-14 13:38 by Equinoxhua
[基金申请] 小木虫上这么多卖论文的，真有人买论文么？感觉没必要啊 +10 Tide man 2026-08-10 11/550 2026-08-14 10:30 by 沁言学术
[基金申请] filecode +15 documentary 2026-08-10 17/850 2026-08-14 10:08 by kissu88
[基金申请] 重要来源：本周末出结果 +10 瞬息宇宙 2026-08-12 10/500 2026-08-13 15:46 by likettle
[基金申请] 分享一下我之前已中青C的计划书的filecode +4 布布和一二 2026-08-11 5/250 2026-08-13 12:56 by cratir
[基金申请] 2019年青年基金涵评意见，大家看看几个A，几个B? +11 Tide man 2026-08-11 11/550 2026-08-13 07:35 by 撸猫猫
[基金申请] 综述论文作为代表作会不会影响评审专家的印象分？ +11 yufeiwaner 2026-08-09 13/650 2026-08-12 08:17 by yufeiwaner
[基金申请] 为什么网上很多人说本周 12号出结果 +6 瞬息宇宙 2026-08-10 7/350 2026-08-11 19:25 by Tide man
[基金申请] 什么时候出结果，有咨询渠道？？？ +3 Tide man 2026-08-11 3/150 2026-08-11 17:54 by kudofaye
[基金申请] 确定了，国自然21号放榜 +6 布布和一二 2026-08-10 7/350 2026-08-10 19:15 by 2000zf36392
[基金申请] 面上项目filecode邪修 +5 西山十月 2026-08-09 7/350 2026-08-10 07:32 by 仁砚薪传
信息提示
关闭
请填处理意见
关闭