应《网络安全法》要求，自2017年10月1日起，未进行实名认证将不得使用互联网跟帖服务。为保障您的帐号能够正常使用，请尽快对帐号进行手机号验证，感谢您的理解与支持！

24小时热门版块排行榜    

小木虫论坛-学术科研互动平台 » 计算模拟区 » 分子模拟 » 其他 » md 分子动力学模拟
81/1返回列表
查看: 2659  |  回复: 7
只看楼主 @他人 存档 新回复提醒 (忽略) 收藏    在APP中查看

Masterarbeit

新虫 (初入文坛)

[求助] md 分子动力学模拟 已有1人参与

如图的公式，u为系统总势能。i代表每一个分子。又总势能的梯度能够计算每个分子的受力。那么公式里的ijk和x1 y1 z1是什么，怎么确定的？本人初学者，希望大家能多多帮助。

md 分子动力学模拟


发自小木虫IOS客户端
回复此楼

» 猜你喜欢

» 本主题相关商家推荐: (我也要在这里推广)

» 本主题相关价值贴推荐，对您同样有帮助:
1楼 2016-04-11 00:40:30
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

abinitio

版主 (著名写手)

【答案】应助回帖

感谢参与，应助指数 +1
你的工程比较浩大。建议你系统的看一下 The art of molecular dynamic simulation这本书，里面有c语言的源程序，会详细讲解从势、周期性边界条件、算法、系综等每一步。否则，每一个方向你都这样问下去，呵呵呵呵，很难。
赞一下 回复此楼
2楼2016-04-11 15:25:05
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

abinitio

版主 (著名写手)

【答案】应助回帖

引用回帖:
2楼: Originally posted by abinitio at 2016-04-11 15:25:05
你的工程比较浩大。建议你系统的看一下 The art of molecular dynamic simulation这本书，里面有c语言的源程序，会详细讲解从势、周期性边界条件、算法、系综等每一步。否则，每一个方向你都这样问下去，呵呵呵呵， ...

这本书连同源程序，木虫能下到，自己搜
赞一下 回复此楼
3楼2016-04-11 15:25:54
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

大懒猫王浩

金虫 (著名写手)

学渣
╮(╯_╰)╭那是梯度公式，你的任务将的确巨大。。。你这个看的应该是分子动力学里面的算法介绍。。。。=_=前路漫漫。。

发自小木虫Android客户端
赞一下 回复此楼
一步一步往上走，，，，
4楼2016-04-12 20:30:16
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

dgwfly

新虫 (正式写手)
引用回帖:
3楼: Originally posted by abinitio at 2016-04-11 15:25:54
这本书连同源程序，木虫能下到，自己搜...

有没有包含FORTRAN源程序的MD教材啊，也是初学者，求推荐下(?? . ??)

发自小木虫Android客户端
赞一下 回复此楼
5楼2016-04-12 23:08:25
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

abinitio

版主 (著名写手)
引用回帖:
5楼: Originally posted by dgwfly at 2016-04-12 23:08:25
有没有包含FORTRAN源程序的MD教材啊，也是初学者，求推荐下(?? . ??)
...

如果我没记错，understanding molecular simulations这本书里的源程序是for的
赞一下 回复此楼
6楼2016-04-13 11:14:53
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

ruby521521

新虫 (小有名气)
同方向，一起努力，三维方向上的受力求合力

发自小木虫Android客户端
赞一下 回复此楼
7楼2016-04-13 14:54:10
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

dgwfly

新虫 (正式写手)
引用回帖:
6楼: Originally posted by abinitio at 2016-04-13 11:14:53
如果我没记错，understanding molecular simulations这本书里的源程序是for的...

(⊙o⊙)哦谢谢

发自小木虫Android客户端
回复此楼
8楼2016-04-13 17:21:52
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
相关版块跳转 我要订阅楼主 Masterarbeit 的主题更新
81/1返回列表
普通表情 龙 兔 虎 猫
最具人气热帖推荐 [查看全部] 作者 回/看 最后发表
[公派出国] 售SCI文章，我:8O.5.5.1O.54,科目全,可十急 +3 ASdOkHsho7FD 2026-08-28 5/250 2026-08-29 14:23 by jCd0dEvKHShX
[硕博家园] 售SCI一区T0P文章，我:8.O55.1.O.54,科目全,可十急 +3 ASdOkHsho7FD 2026-08-28 9/450 2026-08-29 13:41 by jCd0dEvKHShX
[教师之家] 售SCI一区T0P文章，我:8.O.55.1.O54,科目全,可伽急 +4 ASdOkHsho7FD 2026-08-28 5/250 2026-08-29 11:49 by jCd0dEvKHShX
[基金申请] 投票:  有多少人是今天查系统知道结果的？ +16 爱看书的可乐 2026-08-26 18/900 2026-08-29 10:18 by winsaint
[基金申请] 我就是申请一个面上项目而已，这评审意见是按照杰青的条件评的吧？ +6 gouxfjh 2026-08-28 9/450 2026-08-29 09:59 by jklily
[基金申请] 为什么资助数各大高校都创新高，自己申请怎么就这么难 +12 Kittylucky 2026-08-27 13/650 2026-08-29 00:04 by superceng
[基金申请] 系统查不到 +11 董八千 2026-08-26 11/550 2026-08-28 18:06 by Leogzhya
[基金申请] 有没有仍没收到信息的 +3 德尚中行 2026-08-27 3/150 2026-08-28 15:24 by rongshuxia
[教师之家] 导师吐槽：我怎么摊上了这么个极品研究生！ +8 苏东坡二世 2026-08-23 8/400 2026-08-28 14:41 by lkforward
[基金申请] 哪位高人中了，把查询到的截图贴出来让我看看，让我长长见识 +5 yuleib84 2026-08-26 6/300 2026-08-28 00:02 by yudaoqian88
[基金申请] 申请删除本帖 +6 lyz123lyz 2026-08-27 7/350 2026-08-27 17:31 by 宁静致远sy
[基金申请] 看板上这么多中的，有点像50人群里49个人都是骗子的那种感觉…… +5 a089 2026-08-26 6/300 2026-08-27 14:05 by jonewore
[基金申请] 怎么看青基中了没有啊 +5 叶九微 2026-08-26 5/250 2026-08-27 10:35 by l_zh2008
[基金申请] 能否退出参与的面上项目解除限项 +23 koalala 2026-08-24 26/1300 2026-08-26 14:29 by 宝贝虫子
[基金申请] 出来了 +9 trojank 2026-08-26 9/450 2026-08-26 14:25 by 宝贝虫子
[基金申请] 今天务委会开完了，明天出结果吗 +19 angus9576 2026-08-25 23/1150 2026-08-26 10:03 by zp519
[基金申请] 牛来！米来！面来！ +8 beefly 2026-08-26 8/400 2026-08-26 08:37 by xuzhipiao
[基金申请] 明天应该可查了！？ +6 chengyan1220 2026-08-23 6/300 2026-08-25 19:45 by zfd97
[基金申请] 某些机构，以效率低为荣，以效率低作为存在感 +9 yuleib84 2026-08-25 10/500 2026-08-25 17:14 by alexon
[基金申请] 没有任何消息-是不是就凉了 +9 图啦图啦 2026-08-24 10/500 2026-08-25 11:59 by 南海小哥
信息提示
关闭
请填处理意见
关闭