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新虫 (初入文坛)

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[求助] md 分子动力学模拟已有1人参与

如图的公式，u为系统总势能。i代表每一个分子。又总势能的梯度能够计算每个分子的受力。那么公式里的ijk和x1 y1 z1是什么，怎么确定的？本人初学者，希望大家能多多帮助。

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1楼 2016-04-11 00:40:30

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abinitio

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【答案】应助回帖

感谢参与，应助指数 +1

你的工程比较浩大。建议你系统的看一下 The art of molecular dynamic simulation这本书，里面有c语言的源程序，会详细讲解从势、周期性边界条件、算法、系综等每一步。否则，每一个方向你都这样问下去，呵呵呵呵，很难。

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2楼2016-04-11 15:25:05

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abinitio

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引用回帖:

2楼: Originally posted by abinitio at 2016-04-11 15:25:05
你的工程比较浩大。建议你系统的看一下 The art of molecular dynamic simulation这本书，里面有c语言的源程序，会详细讲解从势、周期性边界条件、算法、系综等每一步。否则，每一个方向你都这样问下去，呵呵呵呵， ...

这本书连同源程序，木虫能下到，自己搜

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3楼2016-04-11 15:25:54

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