24小时热门版块排行榜    

查看: 2995  |  回复: 11
当前只显示满足指定条件的回帖,点击这里查看本话题的所有回帖

若无敌12138

银虫 (正式写手)

[求助] CDS序列扩增条带暗,求解,急!急!急!! 已有2人参与

最近在做基因表达,扩CDS全长, 片段900左右,从CDS序列头尾上设计的引物,用基因组不保险,所以用的Q5高保真酶扩的cDNA,但条带一直都一直不是很亮,RNA反转录成cDNA这一步没问题,都测过浓度的,并且cDNA稀释了50倍扩的。后面要做片段融合,试过切胶回收,PCR产物直接回收浓度都非常低,没法做下一步,怎么破?CDS的GC含量不高,51%,引物Tm值相差大概3度,GC没问题,见下图左边较暗的4条带

1.确定cDNA没问题
2.酶没问题
3.引物的话,是头尾确定的吧

如果是体系的话,退火温度已经调到很低了,从65,63,60都试过,条带也不亮,切胶基本没有,AXYGEN、QUIGEN的都用过,不纯化吧,对后续实验可能会有影响,有人碰到类似的情况吗??

CDS序列扩增条带暗,求解,急!急!急!!
P60321-222820.jpg
回复此楼
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

若无敌12138

银虫 (正式写手)

引用回帖:
9楼: Originally posted by geneyhh at 2016-03-25 17:34:07
我遇到这种情况会最三管pcr,共150ul,然后一起回收,得到的会多一些目的产物,不影响后面的连接。

谢谢,已经做出来了,二次PCR的
10楼2016-03-25 18:36:56
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
查看全部 12 个回答

卡维斯

金虫 (正式写手)

【答案】应助回帖

★ ★ ★
感谢参与,应助指数 +1
若无敌12138: 金币+3, 有帮助 2016-03-23 12:57:54
增加下模板浓度,稀释到10倍。程序上尝试下touchdown程序
2楼2016-03-23 11:31:04
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

zhijiangli

金虫 (正式写手)

【答案】应助回帖

★ ★ ★
感谢参与,应助指数 +1
若无敌12138: 金币+3 2016-03-23 12:58:06
用pcr产物为模板扩增,循环数降低10-15个。试试
缘分这东西O(∩_∩)O~
3楼2016-03-23 11:38:14
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

若无敌12138

银虫 (正式写手)

引用回帖:
2楼: Originally posted by 卡维斯 at 2016-03-23 11:31:04
增加下模板浓度,稀释到10倍。程序上尝试下touchdown程序

谢谢建议,最先用的就是touchdown,从65,63到62 30s,从62,60到58 30s也试过,总共30个循环,更暗,后来一次性退火,还亮一点点,并不是非特异性扩增的问题
4楼2016-03-23 12:56:09
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
最具人气热帖推荐 [查看全部] 作者 回/看 最后发表
[基金申请] 2019年青年基金涵评意见,大家看看几个A,几个B? +5 Tide man 2026-08-11 5/250 2026-08-12 09:24 by kangban
[基金申请] 应该是93bebmhtak前后十一个字符比较关键 +18 Lanmanbaby 2026-08-09 30/1500 2026-08-12 09:10 by xandria
[基金申请] 是这周出结果还是下周出结果? +3 yuleib84 2026-08-11 3/150 2026-08-11 21:53 by jnhyjjm
[基金申请] 小木虫上这么多卖论文的,真有人买论文么?感觉没必要啊 +8 Tide man 2026-08-10 9/450 2026-08-11 20:39 by beefly
[基金申请] 帮忙看看fileCode +7 wwncly 2026-08-10 13/650 2026-08-11 19:36 by 冰心玉壶晴
[硕博家园] 读博的好处 +3 lnee 2026-08-11 3/150 2026-08-11 18:10 by 希望我好好的
[基金申请] 什么时候出结果,有咨询渠道??? +3 Tide man 2026-08-11 3/150 2026-08-11 17:54 by kudofaye
[基金申请] 分享一下我之前已中青C的计划书的filecode +3 布布和一二 2026-08-11 4/200 2026-08-11 15:20 by aasahr
[基金申请] 听说今天filecode变了 +26 布布和一二 2026-08-06 49/2450 2026-08-11 13:18 by WH3796
[基金申请] 基金中了 +15 laoda193707 2026-08-06 15/750 2026-08-11 00:11 by jiafei2190
[基金申请] 确定了,国自然21号放榜 +6 布布和一二 2026-08-10 7/350 2026-08-10 19:15 by 2000zf36392
[基金申请] 静等基金结果 +5 gjjjzhong 2026-08-10 16/800 2026-08-10 17:19 by Tide man
[基金申请] 国自然结果 +4 Vierhys 2026-08-10 8/400 2026-08-10 15:06 by Vierhys
[基金申请] 好奇怪的filecode +4 布布和一二 2026-08-08 5/250 2026-08-10 14:20 by 冰心玉壶晴
[基金申请] 据悉今年马上要出结果了 +7 瞬息宇宙 2026-08-10 8/400 2026-08-10 12:42 by Vivilian
[基金申请] filecode与中标关系的预测 +5 布布和一二 2026-08-07 5/250 2026-08-09 16:15 by 袁向阳007
[基金申请] 关于filecode +4 布布和一二 2026-08-07 7/350 2026-08-07 22:55 by zhanghaozhu
[基金申请] 大家散了吧,后缀研究没有意义,别浪费时间了,过好目前的每一天,不要焦虑 +5 Tide man 2026-08-06 7/350 2026-08-07 13:11 by 医学老男孩
[基金申请] 影响面上的因素 +8 布布和一二 2026-08-05 11/550 2026-08-06 10:41 by 宝贝虫子
[基金申请] 好消息?这个有何含义??? +8 Tide man 2026-08-05 10/500 2026-08-05 16:14 by xmuxiaoyu
信息提示
请填处理意见