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小木虫论坛-学术科研互动平台 » 生物医药区 » 分子生物 » 生物信息 » 为什么我在一个ORF里发现了十几个终止密码子？
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prthefu

木虫 (著名写手)

[交流] 为什么我在一个ORF里发现了十几个终止密码子？ 已有10人参与

接手师兄的实验来做，他说给我一个完整的ORF，共就九百多。但为什么在翻成蛋白的时候，居然出现了十几个点，也就是终止密码子，这是问什么
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nothing is impossible in this world，if you have the will to win，you can achieve anything
1楼 2016-03-21 11:21:24
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回帖支持 ( 显示支持度最高的前 50 名 )

jjg0912

木虫 (正式写手)
★
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去NCBI 上blast ORF .然后截图上传给大家。有图才有真相

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6楼2016-03-21 16:40:28
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hdzhonghai

铁虫 (初入文坛)
★ ★
小木虫: 金币+0.5, 给个红包，谢谢回帖
西门吹雪170: 金币+1, 鼓励回帖交流 2016-03-24 07:34:39
翻译的终止不是简单的三个碱基决定的，还和周边的序列有关，刚看过《分子生物学》里面有介绍，你具体看一下
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9楼2016-03-21 23:05:02
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普通回帖

原海亮

木虫 (著名写手)
★ ★
小木虫: 金币+0.5, 给个红包，谢谢回帖
西门吹雪170: 金币+1, 鼓励回帖交流 2016-03-24 07:33:49
不同的阅读框吧，看看按你的起始密码子的阅读框顺序，有几个终止密码子？

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天空才是极限，我有信心飞的更高！
2楼2016-03-21 12:04:41
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prthefu

木虫 (著名写手)
引用回帖:
2楼: Originally posted by 原海亮 at 2016-03-21 12:04:41
不同的阅读框吧，看看按你的起始密码子的阅读框顺序，有几个终止密码子？

额，我不太明白你的意思。
一个师兄说他给我的是一个完整的ORF，但是，我整个翻译成氨基酸的时候，发现翻出来有好多位置出现的是点“·”，对应着终止子，但，这不应该啊，既然是一个完整的ORF,就应该只有一个终止子啊
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3楼2016-03-21 15:06:06
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原海亮

木虫 (著名写手)
★ ★ ★
小木虫: 金币+0.5, 给个红包，谢谢回帖
西门吹雪170: 金币+2, 鼓励回帖交流 2016-03-24 07:34:14
引用回帖:
3楼: Originally posted by prthefu at 2016-03-21 15:06:06
额，我不太明白你的意思。
一个师兄说他给我的是一个完整的ORF，但是，我整个翻译成氨基酸的时候，发现翻出来有好多位置出现的是点“·”，对应着终止子，但，这不应该啊，既然是一个完整的ORF,就应该只有一个终止 ...

给你的orf开始和结尾的三个碱基分别是起始密码子和终止密码子么？一段序列内，如果不按一定的阅读框，是会有好几个终止密码子的，你就按最开始的ATG（也可能其他起始密码子），三个碱基一组往下读，看看有几个终止密码子。

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天空才是极限，我有信心飞的更高！
4楼2016-03-21 16:29:55
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prthefu

木虫 (著名写手)
引用回帖:
4楼: Originally posted by 原海亮 at 2016-03-21 16:29:55
给你的orf开始和结尾的三个碱基分别是起始密码子和终止密码子么？一段序列内，如果不按一定的阅读框，是会有好几个终止密码子的，你就按最开始的ATG（也可能其他起始密码子），三个碱基一组往下读，看看有几个终止 ...

我手上的这个ORF,是以ATG开始、TGA结尾的，但是我把这一段整体翻成氨基酸的时候，中间就出现了十几个终止密码子，像TAG、TGA这两种。
不知道这到底是怎么回事。按道理说ORF应只有两段有起始密码子，或者的多几个ATG，但不应该出现多个终止密码子吧·····
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nothing is impossible in this world，if you have the will to win，you can achieve anything
5楼2016-03-21 16:37:54
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jjg0912

木虫 (正式写手)
★
小木虫: 金币+0.5, 给个红包，谢谢回帖
最直接的。问你师兄如果方便。

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7楼2016-03-21 16:47:02
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prthefu

木虫 (著名写手)
引用回帖:
7楼: Originally posted by jjg0912 at 2016-03-21 16:47:02
最直接的。问你师兄如果方便。

如果方便，我就不会在这里问了·····
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8楼2016-03-21 22:03:45
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丝竹睛明

新虫 (小有名气)
★
小木虫: 金币+0.5, 给个红包，谢谢回帖
从新设计引物扩下就好了

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10楼2016-03-21 23:15:05
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