应《网络安全法》要求，自2017年10月1日起，未进行实名认证将不得使用互联网跟帖服务。为保障您的帐号能够正常使用，请尽快对帐号进行手机号验证，感谢您的理解与支持！

24小时热门版块排行榜    

小木虫论坛-学术科研互动平台 » 生物医药区 » 分子生物 » 生物信息 » 为什么我在一个ORF里发现了十几个终止密码子？
232/3返回列表上一页123下一页
查看: 4956  |  回复: 22
只看楼主 @他人 存档 新回复提醒 (忽略) 收藏    在APP中查看

我爱chi辣椒

木虫 (正式写手)
★
小木虫: 金币+0.5, 给个红包，谢谢回帖
一，你的orf开头不是真正的起始密码子，因为一段序列有三种方式。二，也有可能你的序列内部缺失或者插入了一个或者两个碱基。你可以先进NCBI blast一下，看看是不是完整的ORF。

发自小木虫IOS客户端
赞一下 回复此楼
A right way maybe not a good way！
11楼2016-03-22 01:19:08
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

我爱chi辣椒

木虫 (正式写手)
引用回帖:
11楼: Originally posted by 我爱chi辣椒 at 2016-03-22 01:19:08
一，你的orf开头不是真正的起始密码子，因为一段序列有三种方式。二，也有可能你的序列内部缺失或者插入了一个或者两个碱基。你可以先进NCBI blast一下，看看是不是完整的ORF。
...

三种阅读方式

发自小木虫IOS客户端
回复此楼
A right way maybe not a good way！
12楼2016-03-22 01:19:44
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

prthefu

木虫 (著名写手)
引用回帖:
12楼: Originally posted by 我爱chi辣椒 at 2016-03-22 01:19:44
三种阅读方式
...

请问，怎么去NCBI中进行BLAST？
赞一下 回复此楼
nothing is impossible in this world，if you have the will to win，you can achieve anything
13楼2016-03-22 08:04:08
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

Sunshine092

木虫 (小有名气)
★
小木虫: 金币+0.5, 给个红包，谢谢回帖
http://www.ncbi.nlm.nih.gov/gorf/gorf.html 用这个在线软件看分析一下 找到最长的那个开放阅读框。。。
赞一下 回复此楼
14楼2016-03-22 12:10:18
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

远望集团

金虫 (正式写手)
★
小木虫: 金币+0.5, 给个红包，谢谢回帖
楼上正解，先用ORF Finder看看，然后才好进一步分析。
赞一下 回复此楼
只要努力，一切皆有可能！更美的风景在那片更高的天空。。。
15楼2016-03-22 12:55:05
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

prthefu

木虫 (著名写手)
引用回帖:
14楼: Originally posted by Sunshine092 at 2016-03-22 12:10:18
http://www.ncbi.nlm.nih.gov/gorf/gorf.html 用这个在线软件看分析一下 找到最长的那个开放阅读框。。。

我在ORF Finder中找到一个最长的ORF,但是，我看下面翻译氨基酸，为什么是反向互补序列翻的氨基酸啊·····
下面链接是ORF Finder的结果：
http://muchong.com/bbs/viewthread.php?tid=10135250
赞一下 回复此楼
nothing is impossible in this world，if you have the will to win，you can achieve anything
16楼2016-03-23 19:46:18
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

haijun海军11

新虫 (小有名气)
是否有启动子？

发自小木虫Android客户端
回复此楼
大家一起加油
17楼2016-03-24 00:12:40
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

张凡云

至尊木虫 (职业作家)
★
小木虫: 金币+0.5, 给个红包，谢谢回帖
引用回帖:
16楼: Originally posted by prthefu at 2016-03-23 19:46:18
我在ORF Finder中找到一个最长的ORF,但是，我看下面翻译氨基酸，为什么是反向互补序列翻的氨基酸啊·····
下面链接是ORF Finder的结果：
http://muchong.com/bbs/viewthread.php?tid=10135250...

反向互补是正常的，因为基因转录，不一定是转录你DNA53方向的那一段，也可能是互补序列，而且你那个ORF里面木有终止密码子啊。建议你直接把序列放到blast里面去核苷酸比对一下，看是哪一个基因再说吧。

发自小木虫IOS客户端
赞一下 回复此楼
18楼2016-03-24 07:46:12
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

willzhuu

铁虫 (著名写手)
★
小木虫: 金币+0.5, 给个红包，谢谢回帖
引用回帖:
5楼: Originally posted by prthefu at 2016-03-21 16:37:54
我手上的这个ORF,是以ATG开始、TGA结尾的，但是我把这一段整体翻成氨基酸的时候，中间就出现了十几个终止密码子，像TAG、TGA这两种。
不知道这到底是怎么回事。按道理说ORF应只有两段有起始密码子，或者的多几个A ...

不是说所有的atg都是起始密码子，只有开始翻译的那个才是。你看看有没gccaccatgg这段kozak序列？如果有，那么这里的atg才是起始密码子。

发自小木虫Android客户端
赞一下 回复此楼
不求一鸣惊人，但求抛砖引玉。
19楼2016-03-24 08:16:20
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

prthefu

木虫 (著名写手)
引用回帖:
19楼: Originally posted by willzhuu at 2016-03-24 08:16:20
不是说所有的atg都是起始密码子，只有开始翻译的那个才是。你看看有没gccaccatgg这段kozak序列？如果有，那么这里的atg才是起始密码子。
...

kozak序列？？？为什么我在网上长的kozak序列，不是你说的gccaccatgg，我看百科中解释的是：：：：
1.Kozak序列是位于真核生物mRNA 5'端帽子结构后面的一段核酸序列，通常是ACCACCAUGG，它可以与翻译起始因子结合而介导含有5'帽子结构的mRNA翻译起始。对应于原核生物的SD序列。
2.真核生物基因中起始密码子上下游的最佳序列为，-3位为嘌呤碱基;+4位为G，起始密码子AUG中的A处于+1位。A/GCCAUGG被称为kozak序列或扫描序列。
为什么上面这两个kozak序列还不一样呢？？
求解·······
赞一下 回复此楼
nothing is impossible in this world，if you have the will to win，you can achieve anything
20楼2016-03-24 17:15:48
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
相关版块跳转 我要订阅楼主 prthefu 的主题更新
232/3返回列表上一页123下一页
普通表情 龙 兔 虎 猫 高级回复 (可上传附件)
最具人气热帖推荐 [查看全部] 作者 回/看 最后发表
[基金申请] 国社科又开始会评了，不知道这次命运如何 +5 雨打竹帘 2026-08-30 9/450 2026-08-30 22:23 by 余韵清
[基金申请] 有没有仍没收到信息的 +7 德尚中行 2026-08-27 8/400 2026-08-30 20:52 by purplejack
[考博] 售SCI一区文章，我:8O5.5.1.O5.4,科目全,可伽急 +3 4FFAWE8HcgUD 2026-08-29 4/200 2026-08-30 20:40 by hZiFeudZyoGR
[公派出国] 售SCI一区文章，我:8.O.55.1.O.54,科目齐全,可伽急 +3 4FFAWE8HcgUD 2026-08-29 4/200 2026-08-30 20:21 by hZiFeudZyoGR
[论文投稿] 售SCI一区文章，我:8O5.5.1.O5.4,科目全,可伽急 +3 zICmwzsBXjbN 2026-08-29 5/250 2026-08-30 20:08 by hZiFeudZyoGR
[博后之家] 售SCI一区T0P文章，我:8.O.55.1.O.54,科目齐全,可+急 +4 jCd0dEvKHShX 2026-08-29 5/250 2026-08-30 19:46 by hZiFeudZyoGR
[找工作] 售SCI一区T0P文章，我:8.O55.1.O.54,科目全,可十急 +3 jCd0dEvKHShX 2026-08-29 4/200 2026-08-30 19:35 by hZiFeudZyoGR
[公派出国] 售SCI一区T0P文章，我:8O.55.1.O.5.4,科目齐全,可+急 +3 jCd0dEvKHShX 2026-08-29 4/200 2026-08-30 19:34 by hZiFeudZyoGR
[考博] 售SCI一区T0P文章，我:8.O.55.1.O.5.4,科目全,可+急 +3 jCd0dEvKHShX 2026-08-29 3/150 2026-08-30 19:26 by hZiFeudZyoGR
[考研] 售SCI一区T0P文章，我:8O.55.1.O.54,科目全,可伽急 +3 G6APbkg8SA6w 2026-08-29 5/250 2026-08-30 18:40 by hZiFeudZyoGR
[论文投稿] 售SCI一区T0P文章，我:8O.55.1.O.5.4,科目齐全,可+急 +6 gy1nBQXYQJqL 2026-08-29 7/350 2026-08-30 18:18 by hZiFeudZyoGR
[考研] 售SCI一区文章，我:8.O.551.O.5.4,科目全,可伽急 +4 gy1nBQXYQJqL 2026-08-29 6/300 2026-08-30 17:47 by hZiFeudZyoGR
[找工作] 售SCI一区T0P文章，我:8O.55.1.O.54,科目全,可伽急 +4 gy1nBQXYQJqL 2026-08-29 8/400 2026-08-30 12:03 by l0VvVHGBGRLv
[基金申请] 我就是申请一个面上项目而已，这评审意见是按照杰青的条件评的吧？ +6 gouxfjh 2026-08-28 11/550 2026-08-30 07:57 by gouxfjh
[基金申请] 国自然面上复盘~欢迎讨论 (金币+15) +15 晴天加油 2026-08-26 16/800 2026-08-29 18:28 by symmetry
[基金申请] 国自然评审意见 +13 wangmingqi 2026-08-28 19/950 2026-08-29 10:22 by Poppy1104
[基金申请] 系统查不到 +11 董八千 2026-08-26 11/550 2026-08-28 18:06 by Leogzhya
[基金申请] 哪位高人中了，把查询到的截图贴出来让我看看，让我长长见识 +5 yuleib84 2026-08-26 6/300 2026-08-28 00:02 by yudaoqian88
[基金申请] 出来了 +9 trojank 2026-08-26 9/450 2026-08-26 14:25 by 宝贝虫子
[基金申请] 今天务委会开完了，明天出结果吗 +19 angus9576 2026-08-25 23/1150 2026-08-26 10:03 by zp519
信息提示
关闭
请填处理意见
关闭