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小木虫论坛-学术科研互动平台 » 生物医药区 » 分子生物 » 生物信息 » 为什么我在一个ORF里发现了十几个终止密码子？
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prthefu

木虫 (著名写手)

[交流] 为什么我在一个ORF里发现了十几个终止密码子？ 已有10人参与

接手师兄的实验来做，他说给我一个完整的ORF，共就九百多。但为什么在翻成蛋白的时候，居然出现了十几个点，也就是终止密码子，这是问什么
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nothing is impossible in this world，if you have the will to win，you can achieve anything
1楼 2016-03-21 11:21:24
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prthefu

木虫 (著名写手)
引用回帖:
19楼: Originally posted by willzhuu at 2016-03-24 08:16:20
不是说所有的atg都是起始密码子，只有开始翻译的那个才是。你看看有没gccaccatgg这段kozak序列？如果有，那么这里的atg才是起始密码子。
...

kozak序列？？？为什么我在网上长的kozak序列，不是你说的gccaccatgg，我看百科中解释的是：：：：
1.Kozak序列是位于真核生物mRNA 5'端帽子结构后面的一段核酸序列，通常是ACCACCAUGG，它可以与翻译起始因子结合而介导含有5'帽子结构的mRNA翻译起始。对应于原核生物的SD序列。
2.真核生物基因中起始密码子上下游的最佳序列为，-3位为嘌呤碱基;+4位为G，起始密码子AUG中的A处于+1位。A/GCCAUGG被称为kozak序列或扫描序列。
为什么上面这两个kozak序列还不一样呢？？
求解·······
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20楼2016-03-24 17:15:48
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原海亮

木虫 (著名写手)
★ ★
小木虫: 金币+0.5, 给个红包，谢谢回帖
西门吹雪170: 金币+1, 鼓励回帖交流 2016-03-24 07:33:49
不同的阅读框吧，看看按你的起始密码子的阅读框顺序，有几个终止密码子？

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天空才是极限，我有信心飞的更高！
2楼2016-03-21 12:04:41
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prthefu

木虫 (著名写手)
引用回帖:
2楼: Originally posted by 原海亮 at 2016-03-21 12:04:41
不同的阅读框吧，看看按你的起始密码子的阅读框顺序，有几个终止密码子？

额，我不太明白你的意思。
一个师兄说他给我的是一个完整的ORF，但是，我整个翻译成氨基酸的时候，发现翻出来有好多位置出现的是点“·”，对应着终止子，但，这不应该啊，既然是一个完整的ORF,就应该只有一个终止子啊
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nothing is impossible in this world，if you have the will to win，you can achieve anything
3楼2016-03-21 15:06:06
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原海亮

木虫 (著名写手)
★ ★ ★
小木虫: 金币+0.5, 给个红包，谢谢回帖
西门吹雪170: 金币+2, 鼓励回帖交流 2016-03-24 07:34:14
引用回帖:
3楼: Originally posted by prthefu at 2016-03-21 15:06:06
额，我不太明白你的意思。
一个师兄说他给我的是一个完整的ORF，但是，我整个翻译成氨基酸的时候，发现翻出来有好多位置出现的是点“·”，对应着终止子，但，这不应该啊，既然是一个完整的ORF,就应该只有一个终止 ...

给你的orf开始和结尾的三个碱基分别是起始密码子和终止密码子么？一段序列内，如果不按一定的阅读框，是会有好几个终止密码子的，你就按最开始的ATG（也可能其他起始密码子），三个碱基一组往下读，看看有几个终止密码子。

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天空才是极限，我有信心飞的更高！
4楼2016-03-21 16:29:55
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