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小木虫论坛-学术科研互动平台 » 生物医药区 » 分子生物 » 生物信息 » 为什么我在一个ORF里发现了十几个终止密码子？
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prthefu

木虫 (著名写手)

[交流] 为什么我在一个ORF里发现了十几个终止密码子？ 已有10人参与

接手师兄的实验来做，他说给我一个完整的ORF，共就九百多。但为什么在翻成蛋白的时候，居然出现了十几个点，也就是终止密码子，这是问什么
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1楼 2016-03-21 11:21:24
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张凡云

至尊木虫 (职业作家)
★
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引用回帖:
16楼: Originally posted by prthefu at 2016-03-23 19:46:18
我在ORF Finder中找到一个最长的ORF,但是，我看下面翻译氨基酸，为什么是反向互补序列翻的氨基酸啊·····
下面链接是ORF Finder的结果：
http://muchong.com/bbs/viewthread.php?tid=10135250...

反向互补是正常的，因为基因转录，不一定是转录你DNA53方向的那一段，也可能是互补序列，而且你那个ORF里面木有终止密码子啊。建议你直接把序列放到blast里面去核苷酸比对一下，看是哪一个基因再说吧。

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18楼2016-03-24 07:46:12
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原海亮

木虫 (著名写手)
★ ★
小木虫: 金币+0.5, 给个红包，谢谢回帖
西门吹雪170: 金币+1, 鼓励回帖交流 2016-03-24 07:33:49
不同的阅读框吧，看看按你的起始密码子的阅读框顺序，有几个终止密码子？

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天空才是极限，我有信心飞的更高！
2楼2016-03-21 12:04:41
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prthefu

木虫 (著名写手)
引用回帖:
2楼: Originally posted by 原海亮 at 2016-03-21 12:04:41
不同的阅读框吧，看看按你的起始密码子的阅读框顺序，有几个终止密码子？

额，我不太明白你的意思。
一个师兄说他给我的是一个完整的ORF，但是，我整个翻译成氨基酸的时候，发现翻出来有好多位置出现的是点“·”，对应着终止子，但，这不应该啊，既然是一个完整的ORF,就应该只有一个终止子啊
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nothing is impossible in this world，if you have the will to win，you can achieve anything
3楼2016-03-21 15:06:06
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原海亮

木虫 (著名写手)
★ ★ ★
小木虫: 金币+0.5, 给个红包，谢谢回帖
西门吹雪170: 金币+2, 鼓励回帖交流 2016-03-24 07:34:14
引用回帖:
3楼: Originally posted by prthefu at 2016-03-21 15:06:06
额，我不太明白你的意思。
一个师兄说他给我的是一个完整的ORF，但是，我整个翻译成氨基酸的时候，发现翻出来有好多位置出现的是点“·”，对应着终止子，但，这不应该啊，既然是一个完整的ORF,就应该只有一个终止 ...

给你的orf开始和结尾的三个碱基分别是起始密码子和终止密码子么？一段序列内，如果不按一定的阅读框，是会有好几个终止密码子的，你就按最开始的ATG（也可能其他起始密码子），三个碱基一组往下读，看看有几个终止密码子。

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天空才是极限，我有信心飞的更高！
4楼2016-03-21 16:29:55
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