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求助从两个不同表型找差异基因的方法
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soutree
木虫
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应助: 1
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帖子: 369
在线: 88.1小时
虫号: 947440
[交流]
求助从两个不同表型找差异基因的方法
如题,目前手头有两个表型不一样的拟南芥植株,我们想从两者中找到影响表型变化的差异基因,不知道用什么方法靠谱一些。
求大神给些提示,做哪些会有帮助?
初步想做RNA-seq,不知道哪个公司做的好一点?
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1楼
2016-03-08 12:00:20
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KOP利
新虫
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帖子: 92
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虫号: 4255798
★
soutree(金币+1): 谢谢参与
你这标题说的不是很明确。你确定是基因的差异表达还是基因突变造成的表型区别吗?如果不确定的话,只知道有基因差异表达了,那确实可以用转录组测序去验证一下。不过我提示你:如果用转录组测序做出来的结果,可能有差异表达的基因相当多。得到这么多的差异基因,下一步怎么研究你也会不知所措吧。还有就是,现在做转录组测序不是看哪个公司的质量好,现在测序的价格都降下来了,哪个公司都能保证质量的前提下做一套转录组测序实验,关键是看怎样找到那些既价格低廉又用心做数据分析服务的公司。明天我师姐回来,我给你问问之前老板让她跟合作做micro RNA测序的公司是哪家。到时候给你建议下
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soutree
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22楼
2016-03-08 16:00:26
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fengyuran
新虫
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帖子: 679
在线: 120.9小时
虫号: 2368769
★
soutree(金币+1): 谢谢参与
你确定不同表型是SNP造成的吗?
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7楼
2016-03-08 13:37:06
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这只是暂时的
5楼
2016-03-08 13:20
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soutree(金币+1): 谢谢参与
祝福
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