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soutree

木虫 (正式写手)


[交流] 求助从两个不同表型找差异基因的方法

如题,目前手头有两个表型不一样的拟南芥植株,我们想从两者中找到影响表型变化的差异基因,不知道用什么方法靠谱一些。
求大神给些提示,做哪些会有帮助?

初步想做RNA-seq,不知道哪个公司做的好一点?
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KOP利

新虫 (小有名气)



soutree(金币+1): 谢谢参与
你这标题说的不是很明确。你确定是基因的差异表达还是基因突变造成的表型区别吗?如果不确定的话,只知道有基因差异表达了,那确实可以用转录组测序去验证一下。不过我提示你:如果用转录组测序做出来的结果,可能有差异表达的基因相当多。得到这么多的差异基因,下一步怎么研究你也会不知所措吧。还有就是,现在做转录组测序不是看哪个公司的质量好,现在测序的价格都降下来了,哪个公司都能保证质量的前提下做一套转录组测序实验,关键是看怎样找到那些既价格低廉又用心做数据分析服务的公司。明天我师姐回来,我给你问问之前老板让她跟合作做micro RNA测序的公司是哪家。到时候给你建议下

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22楼2016-03-08 16:00:26
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fengyuran

新虫 (正式写手)



soutree(金币+1): 谢谢参与
你确定不同表型是SNP造成的吗?

发自小木虫IOS客户端
7楼2016-03-08 13:37:06
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2016-03-08 13:20   回复  
soutree(金币+1): 谢谢参与
祝福 发自小木虫Android客户端
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