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xpw2010

木虫 (小有名气)

[求助] 文章投稿请教...已有2人参与

如题,在一个患者DNA中,对已知致病基因进行测序,发现一个疑是致病位点(未见文献报道及数据库收录),通过提取RNA,反转录对cDNA测序,发现基因组在转录过程中发生插入序列,导致移码突变。这个家系中来了10来个人,只要是患者就有这种突变,表型正常人没有这种突变。这种可以发什么样的杂志?录过程中发生插入序列,导致移码突变。这个家系中来了10来个人,只要是患者就有这种突变,表型正常人没有这种突变。这种可以发什么样的杂志?
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charlie9

金虫 (正式写手)

【答案】应助回帖

感谢参与,应助指数 +1
你目前发现的就是一个现像。由于这些患者都来是同一个家庭,具有很多相似的遗传背景,相同的移码突变是很自然的事,但不一定就是导致疾病发生的原因。你如果就以这个现象发出去,发不了好文章,而且人家还不一定接收,因为样本量明显太少。实际上,你所说的所有患者都有这个突变,完全有可能是这个家系的某一个染色体出现问题,而这个突变位点又正好是在那个染色体上,这就很自然地形成了高度的关联。如果这样,除了这个基因本身以外,你还要关注这个基因所在染色体上的全部基因,而且你要证明你找到的这些基因是该疾病的致病因子。这基本上是可以上Nature的文章了。这确实是一个很好的现象,就这样发出去,太可惜了,还望楼主三思。如果楼主没有条件做,我可以帮你。
11楼2016-03-02 19:48:07
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普通回帖

cloud1986zcy

新虫 (小有名气)

2楼2016-03-01 00:48:28
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cloud1986zcy

新虫 (小有名气)

张学军,这个医生,发了很多类似的文章,你可以去看看,

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3楼2016-03-01 00:52:27
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cloud1986zcy

新虫 (小有名气)

发文章的好坏,和该疾病的影响及有关系,看看大家关不关注

发自小木虫Android客户端
4楼2016-03-01 00:53:29
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cloud1986zcy

新虫 (小有名气)

我觉得你的序列和表型之间的关联不是很大,应该进一步确认

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» 本帖已获得的红花(最新10朵)

5楼2016-03-01 00:54:41
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xpw2010

木虫 (小有名气)

送红花一朵
引用回帖:
5楼: Originally posted by cloud1986zcy at 2016-03-01 00:54:41
我觉得你的序列和表型之间的关联不是很大,应该进一步确认

您好,谢谢您的回复,我检测到的是多囊肾病的典型致病基因,序列变化导致蛋白编码的错误吧
6楼2016-03-01 15:22:38
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cloud1986zcy

新虫 (小有名气)

引用回帖:
6楼: Originally posted by xpw2010 at 2016-03-01 15:22:38
您好,谢谢您的回复,我检测到的是多囊肾病的典型致病基因,序列变化导致蛋白编码的错误吧...

嗯,这个患病个
体是个突变个体喽

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7楼2016-03-01 18:29:05
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jms_guan

专家顾问 (著名写手)

【答案】应助回帖

★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★
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xpw2010: 金币+10, ★★★很有帮助 2016-03-02 13:21:56
你可以这样,再找一个这样的家系或者患者群去验证一下这个位点,如果有突变那么你在看看这个突变是不是引起蛋白质的结构改变,如果蛋白质也改变,那应该可以发一个很不错的杂志
正在学习搞科研
8楼2016-03-02 13:08:21
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xpw2010

木虫 (小有名气)

引用回帖:
8楼: Originally posted by jms_guan at 2016-03-02 13:08:21
你可以这样,再找一个这样的家系或者患者群去验证一下这个位点,如果有突变那么你在看看这个突变是不是引起蛋白质的结构改变,如果蛋白质也改变,那应该可以发一个很不错的杂志

这个家系来了12个人,五个患病的都有这个点突变,表型正常人没有这个突变,通过提取RNA进行反转录成cDNA,扩增测序得到cDNA中出现了8个碱基的插入,对改变后的cDNA序列进行翻译(通过NCBI上的一个工具),发现其提前终止。请问这种可以发个什么样的杂志,有推荐的吗?谢谢!
9楼2016-03-02 13:20:50
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jms_guan

专家顾问 (著名写手)

【答案】应助回帖

引用回帖:
9楼: Originally posted by xpw2010 at 2016-03-02 13:20:50
这个家系来了12个人,五个患病的都有这个点突变,表型正常人没有这个突变,通过提取RNA进行反转录成cDNA,扩增测序得到cDNA中出现了8个碱基的插入,对改变后的cDNA序列进行翻译(通过NCBI上的一个工具),发现其提 ...

如果只做这些那应该不会很高,但是如果你再找一个人群验证的话估计会发一个不错的文章,具体几分要看你的验证部分,如果其他人群也出现了那估计10分应该也不是不能!如果蛋白质的部分再做就更好了。
正在学习搞科研
10楼2016-03-02 19:02:36
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