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更恋秋风

铁杆木虫 (小有名气)

[求助] Gibson Assembly 一直做不出来,好伤心已有2人参与

我的片段大小:
片段1:6823bp
片段2:499bp
片段3:400bp

片段浓度:
片段1:112.5ng/ul
片段2:126.2ng/ul
片段3:113.3ng/ul

我的mix之前用的NEB mix ,今天又重新配了一次。

之前的体系
片段1:6ul
片段2:0.35ul
片段3:0.35ul
mix:6.65ul
50度1小时。
不行。

今天我做了一个体系:
片段1:2ul
片段2:1.2ul
片段3:1.2ul
mix:4.4ul



片段1:1.5ul
片段2:1.8ul
片段3:1.8ul
mix:5.1ul


还有一个
片段1:1.5ul
片段2:1.8ul
片段3:1.8ul
mix:5.1ul
ddH2O:4.9ul

请大神帮忙看看
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redking2012

木虫 (正式写手)

如果是质粒的话,四段一起连,然后直接做转化,不要跑电泳鉴定。如果连接产物是片段,连接完了直接取一微升做模版进行pcr

发自小木虫IOS客户端
9楼2016-02-27 23:00:48
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kaka369

新虫 (小有名气)

【答案】应助回帖

★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★
感谢参与,应助指数 +1
西门吹雪170: 金币+3, 鼓励回帖交流 2016-02-27 16:43:05
更恋秋风: 金币+35, ★★★很有帮助, 感谢层主,有用,我正在试试先连上小的,后加大的。 2016-02-27 21:04:28
我最近刚做了一个IN-FUSION跟你的差不多原理,我把我的经验告诉你一下,三个片段同时连接效率很低的,我是把三个片段同时插入到质粒中,片段大小分别是:2.3kb, 1kb, 700bp。我挑了40个班,大约一半的克隆能连进2.3kb的大片段,只有1个克隆三个片段同时插入的。推荐你用高保真酶来扩增你的片段。我们用的NEBQ5 high fidelity, 非常的不错,测序之后没有一个突变。 我看到你有一个6.8kb, 这样效率会很小的,,所以建议你先把大的插进去,在解决那两个小的。别瞎折腾了,这些同时插入的盒子没有说的那么牛,遇到大片段的时候,效率会很低的,建议分布做,这些是个人经验之谈,
6楼2016-02-27 12:42:21
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普通回帖

更恋秋风

铁杆木虫 (小有名气)

2楼2016-02-27 09:24:16
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更恋秋风

铁杆木虫 (小有名气)

3楼2016-02-27 09:24:29
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biosci

捐助贵宾 (职业作家)


4楼2016-02-27 10:31:55
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更恋秋风

铁杆木虫 (小有名气)

引用回帖:
4楼: Originally posted by biosci at 2016-02-27 10:31:55
可以分两步来做

两段两段连

发自小木虫Android客户端
5楼2016-02-27 11:10:36
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更恋秋风

铁杆木虫 (小有名气)

引用回帖:
6楼: Originally posted by kaka369 at 2016-02-27 12:42:21
我最近刚做了一个IN-FUSION跟你的差不多原理,我把我的经验告诉你一下,三个片段同时连接效率很低的,我是把三个片段同时插入到质粒中,片段大小分别是:2.3kb, 1kb, 700bp。我挑了40个班,大约一半的克隆能连进2.3 ...

嗯嗯,好呢,多谢

发自小木虫Android客户端
7楼2016-02-27 21:03:36
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fudan671

木虫 (著名写手)

8楼2016-02-27 21:37:53
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更恋秋风

铁杆木虫 (小有名气)

引用回帖:
9楼: Originally posted by redking2012 at 2016-02-27 23:00:48
如果是质粒的话,四段一起连,然后直接做转化,不要跑电泳鉴定。如果连接产物是片段,连接完了直接取一微升做模版进行pcr

我没有跑电泳
10楼2016-02-28 11:58:36
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