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自伴算子

新虫 (初入文坛)

[求助] lammps模型建立问题求助 已有3人参与

楼主初学lammps,现在能看懂已经有的in文件,但不模仿的话,无法写in文件
现在老师给了一组原子的坐标,如附件,是txt格式,里面部分内容如下:
所有长度单位为埃[10^(-10)m]
  半径为:   3.408722
  长度为:   24.595119
  原子总数为: 210

   坐标 (B和N原子交替排列):
   原子序号      X                 Y                 Z
      1      3.3347790241      0.7061391473      0.0000000000
      2      3.4087216854      0.0000000000      1.2297559977
      3      3.3347790241      0.7061391473      2.4595119953
      4      3.4087216854      0.0000000000      3.6892681122
      5      3.3347790241      0.7061391473      4.9190239906
      6      3.4087216854      0.0000000000      6.1487798691
要根据这组数据建立模型
这是要怎么做呢?
我查阅网上资料,有外部建模的方法,就是用read data,read data能够直接读取里面含有中文的txt文件吗?
不能的话,求一份正确的data文件,我参考仿照写写
还有,read data的正确使用方式是什么?
是直接在ubuntu的终端输入read data?还是写一个in文件,文件中含有read data指令,然后运算in文件?后者的话,求一份这样的in文件参考
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  • 附件 1 : (5,5)BNNT坐标.TXT
  • 2016-02-26 17:37:24, 30.77 K

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gaochen4860

木虫 (小有名气)

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感谢参与,应助指数 +1
将所给坐标信息转换成lammps的data
文件的格式(可利用Excel完成),然后制作data文件,如 la.data  , 然后利用in文件中的read_data  la.data 命令读取data文件。

发自小木虫Android客户端
2楼2016-02-26 18:22:27
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自伴算子

新虫 (初入文坛)

引用回帖:
2楼: Originally posted by gaochen4860 at 2016-02-26 18:22:27
将所给坐标信息转换成lammps的data
文件的格式(可利用Excel完成),然后制作data文件,如 la.data  , 然后利用in文件中的read_data  la.data 命令读取data文件。

额,谢谢回答
你有相关的文件格式参考一下么
还有怎么给你悬赏
3楼2016-02-28 09:01:26
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gaochen4860

木虫 (小有名气)

我这没有相关文件,你可以计算几个lammps自带的例子

发自小木虫Android客户端
4楼2016-02-28 09:34:44
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alundilong

木虫 (正式写手)

【答案】应助回帖

感谢参与,应助指数 +1
5楼2016-02-29 05:39:43
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王小Diao

新虫 (初入文坛)

【答案】应助回帖

lz,请问这个问题你解决了么?
6楼2016-12-07 17:56:57
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