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硕博家园
引物设计
为什么我用ncbi设计的引物再拿回去
primer-blast
检查引物特异性的时候并没有
blast
到我想要的那个基因?(已经检查过Tm值物种选择等参数设计)
a-lily
2024-06-27 02:12
分子生物
简并引物的特异性
之前看的帖子都是用
primer-blast
,我把primer里所有的简并碱基都换成N之后试了一下,匹配不出来,没有任何结果。求助一下大佬,这样的结果是不是说明我的primer特异性不行?有没有什么网站...
hqyqh1314
2022-08-31 06:54
分子生物
NCBI引物设计提示‘模板低于5个有效碱基’字样是怎么回事
想设计一个物种的18SrDNA引物,用NCBI的
primer-blast
设计报错,提示‘模板低于5个有效碱基’,如图。但我模板栏里填的是Access号啊,是什么情况呢。微信图片_20210531151242.png
xbwwsq
2021-05-31 07:12
分子生物
分子克隆实验指南4-分章节版 已将每一章节单独分出来
RACE416方案11使用PCR筛选克隆422信息栏424第8章生物信息学431导言432方案1使用ucsc基因组浏览器将基因组注释可视化434方案2使用
BLAST
和ClustalW进行序列比对和同源性检索444方案3使用...
轩辕漪
2019-07-17 11:35
分子生物
感谢当时莫名其妙的机会
在做这类实验前的设计一般只要选好软件基本都不会有问题,我用的是Oligo7和PP5,MSP的设计是用MethylPrimerExpressv1.0其他的引物设计网站也行,如
Primer-BLAST
。在设计时,一定要和文献上...
wukangming
2018-06-01 10:33
分子生物
primer-blast
怎么用啊
有没有人知道
primer-blast
怎么用阿、为啥我的老显示Exceptionerror:Noaliasorindexfilefoundfornucleotidedatabase[refseq_rna]insearchpathexport/home/service/grid_nodes/primertool:/...
liufengq
2017-04-18 05:13
文献求助
Length Ribosome Gene TA-Cloning and
Primer-
Blast
to Dete
[info2]EmploymentofNearFull-LengthRibosomeGeneTA-Cloningand
Primer-Blast
toDetectMultipleSpeciesinaNaturalComplexMicrobialCommunityUsingSpecies-Specific...
周博博
2016-11-13 04:46
分子生物
求助如何确定酶切产物片段大小
文献中有详细的PCR和酶切体系,但是结果未给出凝胶电泳图,也没有写酶切产物片段大校我自己在
Primer-BLAST
里查到了PCR产物的大小,但是不知道如何查酶切产物大校请问如何才能确定酶切产物...
烟熏色夜太美
2016-10-14 03:36
分子生物
如何评价引物的特异性?
已经使用oligo进行打分,筛选出的引物并不能肯定是针对特定基因扩增,然后用
primer-blast
分析引物,跑出的结果并没有我想要的物种,请问该如何确定手上的引物特异性好?
大东红日
2016-07-19 02:39
分子生物
体液直接PCR产生引物二聚体,小老板拒绝承认是
Primer
dimer
下面我打算用大肠试一下,看看是否会和我用的人类的引物反应(我感觉根本就是放屁,都用
primer-blast
查过的)不然就只能测序了想请问各位老师,您们认为这是引物二聚体吗?另外有什么办法...
ttt7788
2016-05-25 02:06
分子生物
求高手看
primer-Blast
结果
求大神看看为什么没有结果?小弟菜鸟一枚2ME(0FKVR_[6[Q}C~6~)936.png
阿泰哥
2015-12-03 08:58
分子生物
求问NCBI
Primer-Blast
出错问题
请问引物设计用
Primer-Blast
出现Exceptionerror:CFastaOstream:locationoutofrange:lcl|Query_1:1-1009.请问是什么错误
克拉克肯特
2015-10-14 08:09
分子生物
求大神
Primer-Blast
问题
这几天想设计几对引物,于是用到了
Primer-Blast
。越做疑问越多,请大神看下我上传的那张图片在得到结果后,我想知道最上面标记方向的红条和黑条分别代表什么?我设计的引物产物落在黑条范围...
lidajiu
2015-06-01 02:35
分子生物
ncbi引物设计问题
出现了下面网页出现的现状,我怎么选择埃请大家指教'http://www.ncbi.nlm.nih.gov/tools/
primer-blast
/primertool.cgi?ctg_time=1420514985&job_key=FA__5JLuO8oAcgR8ZVI2An5_BBNtYBkW'
mtyx
2015-01-06 03:07
分子生物
用过NCBI里面
Primer-blast
的大神们进来看一下
第一步要输入模板我找到的模板是基因组,输入的基因组的Accession总是出来如图2说没有这些序列,这是怎么回事呢?基因组的所有序列的Accessionnumber应该怎么获得啊?496B1211-ED69-4F6B-...
shellyxss
2014-11-18 10:32
论文投稿
纪念SCI诞生50周年的百大高引论文榜单
BLAST
:Anewgenerationofproteindatabasesearchprograms....withoutuseofpreparativeultracentrifuge.1546963
Primer-
directedenzymaticamplificationofDNAwithathermostableDNApolymerase....
MySCI365
2014-11-03 06:01
分子生物
请教realtime qPCR跨内含子引物使用
primer-blast
设计后,检查其...
要做singlecellqPCR,要设计90多个引物,现在使用NCBI的
PRIMER-blast
设计的primer,两个引物分别在两个exon上,
primer-blast
给出了一些跨内含子的引物,并且有同源对比之类的,但是这些引物...
注册疲倦
2014-09-18 09:43
生物科学
求助!使用G418筛选突变体及检测
问题2:因为转化植物时用到的载体标志基因是nptII,我在NCBI上查到了该标志基因的序列,然后用
primer
5设计出序列进行PCR检测,结果...我也
Blast
了nptII与该植物的序列,发现两者序列很少重合,...
丫头小盆子
2014-04-26 04:47
分子生物
设计检测时Graphical view of
primer
pairs 显示不正常
如题,鄙人设计检测时用NCBI/
Primer-BLAST
,结果显示Graphicalviewofprimerpairs这一栏,显示Unabletoregistertracks:notracksregistered。这是怎么回事,不知道是哪里条件选错了。半年前...
胡雅彬
2014-01-08 02:56
分子生物
我想进行引物的特异性检验,进入
primer-blast
,怎么设置一些相关...
我想进行引物的特异性检验,进入
primer-blast
,怎么设置一些参数?结果如何分析?直接在序列框中输入上空格分开下游引物
blast
的结果有其他的菌,但是分值低,有些是单条匹配,能说明特异性...
yuren2009
2013-10-26 02:00
分子生物
构建质粒-PCR
各位前辈,我在构建质粒时遇到了难事,最初设计一对基因全长
primer
,在组织cDNA中PCR验证引物好用,电泳明确见两个条带(该基因...测序结果
BLAST
后与NCBI上两个viarant一致,可后来构建质粒后...
phdandmd
2013-10-25 05:38
医学
IFN-γ的PCR扩不出来,连梯度都做不出来
引物一共是3对,都没有弄出来,图上的是优化后的引物(用
primer
5设计的...PCR图.PNG2.PNG3.PNGIFN-γ-1.PNGIFN-γ-1
BLAST
.PNGIFN-γ-2
BLAST
.PNG[Lasteditedby喵了个咪yayaon2013-7-17at15:18]
喵了个咪yaya
2013-07-17 07:48
分子生物
荧光定量特异引物的验证
小弟最近要做荧光定量,设计了几对引物,为了验证引物的特异性,用
primer-blast
检测,结果如图所示,第一个为我设计用的基因序列,后面两个说明什么,是不是特异性不好?这几个基因使一个...
帝封天下
2013-05-14 10:31
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