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wukangming

银虫 (小有名气)

[交流] 感谢当时莫名其妙的机会 已有8人参与

刚开始做科研的时候,是老师觉得我的头像很特别(特朗普的),然后就叫我去谈一谈
已经跟老师做文章快一年了,总结一下学到的东西,也向大家分享一下本科生的科研经验和学到的内容
1. PCR与引物设计  qRT-PCR、DIP-qPCR和Bisulfite  还有其他很多引物和类似引物设计的 如 甲基化引物(MSP)、siRNA、sgRNA等。在做这类实验前的设计一般只要选好软件基本都不会有问题,我用的是Oligo7和PP5,MSP的设计是用Methyl Primer Express v1.0  其他的引物设计网站也行,如Primer-BLAST。在设计时,一定要和文献上有的引物比对,当然最好是直接拿来用。有需要引物设计的可以私聊我 qwq
2. 专利和综述的撰写  写过五篇专利  都是在Soopat上找已有的和类似的,结合外国专利,一点一点模仿拼图,最后还真的被老师录用了。至于综述,老实说刚开始的时候老师说至少要看40-50篇Paper(英文的)才能写出,这没错,但不是全看50篇,而是找一些代表性的来看10-20篇左右吧,然后剩下的看摘要就行。
3. 质谱蛋白定量  刚开始的时候我是做这方面的,文章也看了不少,东西也买齐了,然而连protocol都做完准备做实验时,发现学校的液质坏了,当时真的是觉得坑,所以当老师都放弃这方面的时候,我自己一个人摆弄那坏掉的液质,最后还偷偷把它拆0_0了,生动形象地给自己上了一门仪器课,当寒假和老师去别的实验室时,除了故障处理方面我玩的液质已经很溜了。
4. 生物信息学做热图  可能我在这方面真的没天赋,只会做火山图和芯片图,那种很炫的R语言作图对于我这个计算机语言盲来说无异于天书。
5. RNAi与Crispr/cas  只能说浅尝辄止
6. 蛋白高效表达与质粒的构建  千万千万要用SimVector 4来做质粒图。具体实验还没操作。
7. 环境样品前处理  买了一个寒假的东西,这学期实验做到一半就被老师赶去做生物方面的实验了。觉得瓶瓶罐罐好奇怪,最后只剩下一堆小细胞瓶的样品去上机,有种不真实的感觉。最坑的是索氏抽提,真的是三天三夜啊!!好在老师提点了一下 用超声萃取
整理了一遍,发现最遗憾的是杂而不精,我有一个同组的哥们,他一开始就是做分子对接、分子动力学模拟和高斯计算,现在已经是一个小神了。
不要觉得看英文文章是浪费时间,虽然它的性价比在开始的时候是最低的,但我们可以从里面得到指数般增长的益处。了解作者的思路、应用的技术,发现自身的不足,就会主动地去学习和改进。
纪念2017.7--现在的我,感觉曾经的星耀(王者荣耀)已经再也回不来了
共勉
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静水流深
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wukangming

银虫 (小有名气)

引用回帖:
8楼: Originally posted by 侯木虫 at 2018-07-05 13:40:11
想请教分子对接软件怎么用?下了autodock tool一头雾水。

原理我不清楚。但关于软件使用去网上百度一下有一大堆教程,特别是Autodock最多,你可以找一找。找篇文章参考,看看做出来的和你自己做的,做错就给作者发个email问问

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静水流深
9楼2018-07-05 17:31:11
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眯眯metoo

新虫 (初入文坛)


小木虫: 金币+0.5, 给个红包,谢谢回帖
自学生物信息学难吗
5楼2018-06-11 11:45:04
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普通回帖

匿名

用户注销 (著名写手)

本帖仅楼主可见
2楼2018-06-02 11:48:12
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透明琉璃

新虫 (小有名气)

幸福是自找的
3楼2018-06-05 22:26:25
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陈少甫

新虫 (初入文坛)


小木虫: 金币+0.5, 给个红包,谢谢回帖
请问一下,如果DNA中蛋白质含量过高,会不会影响PCR

发自小木虫Android客户端
4楼2018-06-10 16:47:12
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wukangming

银虫 (小有名气)

引用回帖:
4楼: Originally posted by 陈少甫 at 2018-06-10 16:47:12
请问一下,如果DNA中蛋白质含量过高,会不会影响PCR

肯定的

发自小木虫Android客户端
静水流深
6楼2018-06-11 19:16:02
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wukangming

银虫 (小有名气)

引用回帖:
5楼: Originally posted by 眯眯metoo at 2018-06-11 11:45:04
自学生物信息学难吗

看你要做到哪种程度。
如果仅仅是引物设计 通路等的话 不难  就几个网站和软件的是,我个人觉得  肿瘤结合生信分析以及数据处理、作图(R语言)才是难的。当然那些分子对接 和分子动力学计算还有高斯软件计算另当别论  这几个方向也很难,一个都要人命了  没一年以上的苦功夫也只能做到表面的事情,想要发一篇5的文章至少要深入了解肿瘤与生信三四年左右的学习

发自小木虫Android客户端
静水流深
7楼2018-06-11 19:24:17
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侯木虫

新虫 (小有名气)


小木虫: 金币+0.5, 给个红包,谢谢回帖
想请教分子对接软件怎么用?下了autodock tool一头雾水。

发自小木虫Android客户端
8楼2018-07-05 13:40:11
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gangziccc

银虫 (小有名气)

多谢楼主,谢谢
10楼2018-08-23 02:44:42
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