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硕博家园 引物设计
为什么我用ncbi设计的引物再拿回去primer-blast检查引物特异性的时候并没有blast到我想要的那个基因?(已经检查过Tm值物种选择等参数设计)
a-lily 2024-06-27 02:12
分子生物 简并引物的特异性
之前看的帖子都是用primer-blast,我把primer里所有的简并碱基都换成N之后试了一下,匹配不出来,没有任何结果。求助一下大佬,这样的结果是不是说明我的primer特异性不行?有没有什么网站...
hqyqh1314 2022-08-31 06:54
分子生物 NCBI引物设计提示‘模板低于5个有效碱基’字样是怎么回事
想设计一个物种的18SrDNA引物,用NCBI的primer-blast设计报错,提示‘模板低于5个有效碱基’,如图。但我模板栏里填的是Access号啊,是什么情况呢。微信图片_20210531151242.png
xbwwsq 2021-05-31 07:12
分子生物 分子克隆实验指南4-分章节版 已将每一章节单独分出来
RACE416方案11使用PCR筛选克隆422信息栏424第8章生物信息学431导言432方案1使用ucsc基因组浏览器将基因组注释可视化434方案2使用BLAST和ClustalW进行序列比对和同源性检索444方案3使用...
轩辕漪 2019-07-17 11:35
分子生物 荧光定量引物设计用NCBI里面的primer blast
请问,荧光定量引物设计,可以用NCBI中的primerblast吗?从网上搜到一个用这个设计荧光定量引物的视频,感觉讲的很好,而且NCBI中的primerblast设计的引物,会排好序,从上到下,按照引物...
无奈被逼科研 2019-05-06 02:06
分子生物 lncRNA设计引物需要进行primer blast吗?
如题,如果需要的话,在primerblast模板应该选择哪个?我自己已经按照上面的想法尝试了,但是没有完全匹配到自己的lncRNA。
xiangh0608 2019-03-24 02:26
生物科学 这其实是一个实验室小白关于PCR的问题
然后我们以此origin序列用NCBI上的blast得到了一些primer组,并自己选了其中的一组作为引物。到实验室后,我们拿到了提取的自己所负责的细胞DNA,然后以20ul的体系(10ul酶,4ul水,1ul引物...
ATOY 2018-09-08 12:54
生物科学 怎样提高5race的成功几率
RNA质量应该没问题,pcr体系应该也没问题,师哥师姐都是用这套程序做出来的……每次测序回来blast都是和别的基因相似度特别高,但是不是自己的基因……是不是引物设计有问题呢,除了primer5...
342667457 2018-07-17 02:30
分子生物 primer dimer检测
我设计了几组不同亚型病毒的引物,现需要blast引物间是否有primerdimer的产生,可以用什么软件或者是网站比对,谢谢
虎虎lucky 2018-06-12 03:08
分子生物 感谢当时莫名其妙的机会
在做这类实验前的设计一般只要选好软件基本都不会有问题,我用的是Oligo7和PP5,MSP的设计是用MethylPrimerExpressv1.0其他的引物设计网站也行,如Primer-BLAST。在设计时,一定要和文献上...
wukangming 2018-06-01 10:33
硕博家园 有没有大神帮帮我,关于设计引物的!急急急!
最近一直在设计引物,在primer5里设计好之后去NCBI进行blast,我所设计的这几个基因的引物结果都没有,每次都是错误,如下图,这到底是为什么?求帮助!
张姓研究生 2017-12-25 02:49
分子生物 primer blast
前辈们大家好。这样的,我在做PCR的时候遇到这样一个问题:之前设计的引物不能用,再重新设计基因A的引物时候,我发现在primerblast的结果上会有很多的类始于目的基因的产物出现,比如说A1...
爱做实验学霸 2017-06-28 05:06
分子生物 primer-blast怎么用啊
有没有人知道primer-blast怎么用阿、为啥我的老显示Exceptionerror:Noaliasorindexfilefoundfornucleotidedatabase[refseq_rna]insearchpathexport/home/service/grid_nodes/primertool:/...
liufengq 2017-04-18 05:13
文献求助 Employment of Near Full-Length Ribosome Gene TA...Blast to Dete
[info2]EmploymentofNearFull-LengthRibosomeGeneTA-CloningandPrimer-BlasttoDetectMultipleSpeciesinaNaturalComplexMicrobialCommunityUsingSpecies-Specific...
周博博 2016-11-13 04:46
分子生物 求助如何确定酶切产物片段大小
文献中有详细的PCR和酶切体系,但是结果未给出凝胶电泳图,也没有写酶切产物片段大校我自己在Primer-BLAST里查到了PCR产物的大小,但是不知道如何查酶切产物大校请问如何才能确定酶切产物...
烟熏色夜太美 2016-10-14 03:36
分子生物 如何评价引物的特异性?
已经使用oligo进行打分,筛选出的引物并不能肯定是针对特定基因扩增,然后用primerblast分析引物,跑出的结果并没有我想要的物种,请问该如何确定手上的引物特异性好?
大东红日 2016-07-19 02:39
分子生物 体液直接PCR产生引物二聚体,小老板拒绝承认是Primer dimer
下面我打算用大肠试一下,看看是否会和我用的人类的引物反应(我感觉根本就是放屁,都用primer-blast查过的)不然就只能测序了想请问各位老师,您们认为这是引物二聚体吗?另外有什么办法...
ttt7788 2016-05-25 02:06
分子生物 求高手看primer-Blast结果
求大神看看为什么没有结果?小弟菜鸟一枚2ME(0FKVR_[6[Q}C~6~)936.png
阿泰哥 2015-12-03 08:58
分子生物 求大神看看这是为何?
前段时间根据HY序列设计一对引物(引物信息及blast结果...引物primer5的信息图.PNG引物blast结果1.PNG引物blast结果2第二个是我参考的序列.PNGp得片段blast的结果1.PNGp的片段blast的结果2.PNG
林之子云 2015-12-02 03:37
分子生物 求问NCBI Primer-Blast出错问题
请问引物设计用Primer-Blast出现Exceptionerror:CFastaOstream:locationoutofrange:lcl|Query_1:1-1009.请问是什么错误
克拉克肯特 2015-10-14 08:09
分子生物 PCR扩增基因问题,求助于大家
我要做基因克隆,可现在卡在PCR这里了…第一个基因我用primer5设计的引物,P出来应该是373bp,可总是出来很多别的条带,blast引物,是特异性的。第二个基因应该是354bp,可出来的条带总在...
295109862wd 2015-07-31 11:48
分子生物 求大神Primer-Blast问题
这几天想设计几对引物,于是用到了Primer-Blast。越做疑问越多,请大神看下我上传的那张图片在得到结果后,我想知道最上面标记方向的红条和黑条分别代表什么?我设计的引物产物落在黑条范围...
lidajiu 2015-06-01 02:35
硕博家园 探针设计
我想利用探针法荧光定量来扩增样品。现在有sybr法的引物,然后我利用这对引物在blast里找到对应的序列,在通过primer3设计探针,但是一直出现这样的情况是怎么回事呢?捕获.JPG
15952724150 2015-05-26 01:49