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ATOY

新虫 (初入文坛)

[求助] 这其实是一个实验室小白关于PCR的问题

(第一次在小木虫发帖,也没找到合适的tag,见谅)
事情是这样子的:
实验总目的,是为了验证某个组织细胞有特定的蛋白。而因为抗体昂贵所以先确定一下细胞中是不是有此mra。
分工:每人负责两种组织细胞的检测。
过程:我们在NCBI上找到了对应蛋白,然后找到了它的mRNA, 点开得到了origin序列。
然后我们以此origin序列用NCBI上的blast得到了一些primer组,并自己选了其中的一组作为引物。
到实验室后,我们拿到了提取的自己所负责的细胞DNA,然后以20ul的体系(10ul酶,4ul水,1ul引物,5ul细胞DNA)做PCR混合体系,再放入pcr仪1小时48分钟(pcr这些退火温度,时间等没有问题)。
结果:我们跑的是1.5%的琼脂电泳,marker用的2000的,最终结果是,除了marker有清晰条带,其他的都没有条带,即PCR失败。

请问这是什么原因呢,引物设计是出了什么问题吗,,
(我们的确有想过可能用RNA的引物去P DNA这个不太对,但是后来我们用肺的cDNA做实验也得到不太满意的结果,两管肺细胞cDNA,一个正常的、一个癌细胞的,但只跑出一管的条带,且大小与预计大小相差甚远)

求助 ,我们的目的是鉴定细胞中确实有某种rna特异性表达,应该从哪里下手呢?

@gyesang 发自小木虫Android客户端
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