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爱做实验学霸

新虫 (初入文坛)

[交流] primer blast 已有1人参与

前辈们大家好。这样的,我在做PCR的时候遇到这样一个问题:之前设计的引物不能用,再重新设计基因A的引物时候,我发现在primer blast的结果上会有很多的类始于目的基因的产物出现,比如说A1、A2、A3.........。它们类始于一个基因家族吧,但是因为我接下来的实验目的,我只想这条引物的产物只有A。想请教大家有没有遇到过这样的问题,跪求大神给点宝贵的意见。。。。还有有什么比较好的设计引物的方法给推荐一下,,,,不胜感激。谢谢
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伤何处

木虫 (正式写手)

★
小木虫: 金币+0.5, 给个红包,谢谢回帖
首先你确定是一个基因家族而不是不同转录本。还有就是blast的时候是否选择本物种。
如果是本物种的基因家族。那你就把这个家族成员的cDNA序列都调出来,然后进行blast,选择基因A的特异性区段进行引物设计。
对也罢,错也罢;正也罢,逆也罢;通途也好,崎岖无妨……但问,吾心坚否?若坚,纵使歧路,以铁心,贯穿而过,亦为大道!不坚,便是坦途,也难登临绝顶,观险峰
2楼2017-06-28 15:42:40
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