| 查看: 419 | 回复: 0 | ||
[求助]
求大神看看这是为何？
|
前段时间根据HY序列设计一对引物（引物信息及blast结果下附。），进行跑胶，只看到一条带，然后就胶回收测序，结果测序结果不理想（找不到下游引物）。就又进行连接转化，又一次测序，结果得到一542bp的片段（根据我参考的序列，引物可以p的理论目的片段应该是429bp），进行blast，结果如下图。我是第一次见到这样的blast结果。前面的这十几个物种都是和我参考HY序列设计引物的这个物种亲缘关系近的。我有两个疑问：第一，为什么会出现这样的断断续续的blast结果，是我的下游引物不特异出现了错配，还是genebank里没这种亲缘关系近的序列。第二：理论的片段比实际p的大了100多bp，是怎么回事？好像总结起来就是有两方面的原因，一是我设计的引物特异性不够，而是genebank未收录这种亲缘关系近的片段。求大神给个建议，不胜感激。 引物primer5的信息图.PNG  引物blast结果1.PNG  引物blast结果2 第二个是我参考的序列.PNG  p得片段blast的结果1.PNG  p的片段blast的结果2.PNG |
回复此楼» 猜你喜欢
筑牢营养安全线：以精准检测，护健康基石
已经有0人回复
-
推荐一些20种氨基酸检测的实际应用案例
已经有0人回复
-
化学工程及工业化学论文润色/翻译怎么收费?
已经有86人回复
-
不合理蛙科研实验中的趣事：实验器材的 “乌龙”
已经有0人回复
-
不合理蛙科研实验中的趣事：和实验材料的 “斗智斗勇”
已经有0人回复
-
蛋白质检测：精准分析，解锁生物分子的密码
已经有0人回复
-
不合理蛙科研实验之小鼠实验：严谨设计，解析生命机制的重要载体
已经有0人回复
-
不合理蛙科研实验之重金属检测：精准筛查，守护健康与环境的防线
已经有0人回复
-
不合理蛙科研实验之“蛙测重金属我背锅三千”
已经有0人回复
-
不合理蛙科研实验之“鼠逃三次我发三篇SCI”
已经有0人回复