这是input格式..

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41楼2010-03-22 11:57:19

tpp001

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Originally posted by 老虎大王 at 2010-03-17 20:45:05:

我记得VMD好像可以打开DLPOLY的HISTORY文件。由于CONFIG和HISTORY文件很像的，大概也可以打开。另外还有一个软件叫GDIS似乎也可以。但我自己都没有用过。当然，最好还是自己把它写成PDB或者XYZ文件，这样，很 ...

不好意思又打扰您了,我想问一下,dl_poly用类似maillist这样的交流方式吗 ??

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42楼2010-03-22 11:58:42

老虎大王

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ghcacj(金币+1):谢谢 2010-03-22 12:21

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Originally posted by tpp001 at 2010-03-22 11:58:42:

不好意思又打扰您了,我想问一下,dl_poly用类似maillist这样的交流方式吗 ??

不知道，应该是有的吧。你去他的网站上看。

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43楼2010-03-22 12:08:19

tpp001

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引用回帖:

Originally posted by 老虎大王 at 2010-03-22 12:08:19:

不知道，应该是有的吧。你去他的网站上看。

谢谢您的回复,这是论坛的网址
http://www.cse.scitech.ac.uk/disco/forums/ubbthreads.php

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44楼2010-03-22 17:00:53

zyj8119

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Originally posted by tpp001 at 2010-03-22 11:57:19:

什么程序啊?

就是怎么从MS文件生成DLPOLY文件的程序啊？什么语言的都成。

好好学习，天天向上。

45楼2010-03-22 17:30:14

tpp001

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Originally posted by zyj8119 at 2010-03-22 17:30:14:

就是怎么从MS文件生成DLPOLY文件的程序啊？什么语言的都成。

啊，其实我的体系也没有跑成功..我就是把ms生成的pdb 文件经过一系列的处理才生成CONFIG格式文件...其他的我都是自己手写的....没有固定的程序

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46楼2010-03-22 21:33:11

zyj8119

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Originally posted by tpp001 at 2010-03-22 21:33:11:

啊，其实我的体系也没有跑成功..我就是把ms生成的pdb 文件经过一系列的处理才生成CONFIG格式文件...其他的我都是自己手写的....没有固定的程序

你怎么处理的，算法思想是？我也是想这么干，但是程序移植编不好，我用的是FORTRAN

好好学习，天天向上。

47楼2010-03-22 21:34:59

zyj8119

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Originally posted by zyj8119 at 2010-03-22 21:34:59:

你怎么处理的，算法思想是？我也是想这么干，但是程序移植编不好，我用的是FORTRAN

吧你写的实例程序发到这里看看，大家学习学习。。。

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好好学习，天天向上。

48楼2010-03-22 21:37:42

tpp001

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lei0736(金币+3):谢谢 2010-03-23 08:54

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Originally posted by zyj8119 at 2010-03-22 21:37:42:

吧你写的实例程序发到这里看看，大家学习学习。。。

program dlpolyinput
implicit none
integer i, numcoordinate, pbc, numatom
real, PARAMETER :: K=0
character *20 atomname, systemname
real x(200),y(200),z(200), lbox
open(20,file='CONFIG',status='unknown') !打开一个输出文件
open(1,file='input.txt',status='unknown')!打开文件，并读取
read(1,*) systemname
write(20,"(A80)"

systemname
read(1,*) numcoordinate, pbc, numatom
write(20,"(I10,I10,I10)"

numcoordinate, pbc, numatom
read(1,*) lbox
write(20,"(F20.3,F20.3,F20.3)"

lbox, K, K
write(20,"(F20.3,F20.3,F20.3)"

K, lbox, K
write(20,"(F20.3,F20.3,F20.3)"

K, K, lbox
do i=1, 200
read(1,*)atomname,x(i),y(i),z(i)
write(20,"(A8,I10)"

atomname, i
write(20,"(F20.3,F20.3,F20.3)"

x(i), y(i) ,z(i)
end do
end

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49楼2010-03-22 22:18:53

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这是input格式..

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lei0736(金币+1):谢谢 2010-03-23 08:55

input-turn-config
0 1 200
28.850
C1 -7.554 -6.98 -10.036
C2 -8.917 -7.191 -10.626
C2 -8.954 -8.558 -11.308
C2 -10.315 -8.796 -11.93
S14 -7.47 -5.332 -9.259
C1 1.742 -9.347 11.89
C2 2.961 -8.475 11.609
C2 3.55 -7.894 12.896
C2 4.758 -7.009 12.613
S14 1.068 -10.075 10.362
C1 0.999 -2.023 -3.01
C2 -0.235 -2.861 -3.327
C2 -0.654 -2.719 -4.793
C2 -1.898 -3.543 -5.105
S14 1.527 -2.224 -1.278
C1 12.82 8.949 -13.352
C2 12.856 10.457 -13.568
C2 11.448 11.052 -13.642
C2 11.484 12.558 -13.876
S14 14.495 8.247 -13.21

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