应《网络安全法》要求，自2017年10月1日起，未进行实名认证将不得使用互联网跟帖服务。为保障您的帐号能够正常使用，请尽快对帐号进行手机号验证，感谢您的理解与支持！

24小时热门版块排行榜    

小木虫论坛-学术科研互动平台 » 计算模拟区 » 分子模拟 » DS/Sybyl/Autodock » Autodock分子对接问题请教
51/1返回列表
查看: 1026  |  回复: 5
只看楼主 @他人 存档 新回复提醒 (忽略) 收藏    在APP中查看
当前只显示满足指定条件的回帖，点击这里查看本话题的所有回帖

hjun79

木虫 (小有名气)

[求助] Autodock分子对接问题请教

要对接的蛋白质含有辅酶磷酸吡哆醛（PLP），首先需要PLP与蛋白质中的lys180残基形成共价键，然后再和底物对接，请教在autodock中该怎样设定，比如怎样使lys与PLP形成共价键？谢谢！
回复此楼

» 猜你喜欢

» 本主题相关商家推荐: (我也要在这里推广)

» 本主题相关价值贴推荐，对您同样有帮助:
1楼 2016-02-17 18:20:37
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

jjlex

木虫 (正式写手)
打错了，不是"格式状态"，是"合适状态"

发自小木虫IOS客户端
赞一下(1人) 回复此楼
4楼2016-02-17 18:39:29
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
查看全部 6 个回答

jjlex

木虫 (正式写手)
把辅酶放到口袋里作为receptor的一部分，再与底物对接

发自小木虫IOS客户端
赞一下 回复此楼

» 本帖已获得的红花（最新10朵）

hjun79
2楼2016-02-17 18:35:36
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

jjlex

木虫 (正式写手)
如果晶体结构没有辅酶的结构，则需要先构建含辅酶的受体结构，然后md得到格式状态后再对接底物

发自小木虫IOS客户端
赞一下(1人) 回复此楼
3楼2016-02-17 18:38:10
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

hjun79

木虫 (小有名气)
送红花一朵
引用回帖:
2楼: Originally posted by jjlex at 2016-02-17 18:35:36
把辅酶放到口袋里作为receptor的一部分，再与底物对接

请问构建含的受体结构时，辅酶和蛋白通过共价键连接怎样设定

发自小木虫IOS客户端
赞一下 回复此楼
5楼2016-02-18 07:24:53
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
查看全部 6 个回答
普通表情 龙 兔 虎 猫
信息提示
关闭
请填处理意见
关闭