应《网络安全法》要求，自2017年10月1日起，未进行实名认证将不得使用互联网跟帖服务。为保障您的帐号能够正常使用，请尽快对帐号进行手机号验证，感谢您的理解与支持！

24小时热门版块排行榜    

小木虫论坛-学术科研互动平台 » 生物医药区 » 分子生物 » DNA重组 » 测序最前面一段基因测不出来，无法判断重组质粒是否正确
111/2返回列表12下一页
查看: 1857  |  回复: 10
只看楼主 @他人 存档 新回复提醒 (忽略) 收藏    在APP中查看

日落沙发

新虫 (小有名气)

[求助] 测序最前面一段基因测不出来，无法判断重组质粒是否正确 已有3人参与

上面一排是正确的从ncbi上查到的目的序列，下面一排是测序的未知序列。
根据比对结果看出，未知序列的1位对应目的序列的47位，那是不是意味着未知序列上没有目的序列的前47位？
求解。

测序最前面一段基因测不出来，无法判断重组质粒是否正确


发自小木虫IOS客户端
回复此楼

» 猜你喜欢
1楼 2016-01-29 14:14:10
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

thinka

铜虫 (著名写手)

【答案】应助回帖

★ ★
感谢参与，应助指数 +1
西门吹雪170: 金币+2, 鼓励回帖交流 2016-03-23 07:16:46
首先你的测序引物离下边一行第一个碱基的预测距离是多少？
其次，如果不是测序引物的问题，那测序的原始文件你有么，有些公司测得不太好会在你引物下游20多 和100多碱基处产生两个染料和试剂峰，他们在处理的时候会给你截掉，实际是测出来了。拿到原始.ab1文件就知道了。
赞一下 回复此楼

» 本帖已获得的红花（最新10朵）

日落沙发
2楼2016-01-29 16:46:43
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

日落沙发

新虫 (小有名气)
送红花一朵
引用回帖:
2楼: Originally posted by thinka at 2016-01-29 16:46:43
首先你的测序引物离下边一行第一个碱基的预测距离是多少？
其次，如果不是测序引物的问题，那测序的原始文件你有么，有些公司测得不太好会在你引物下游20多 和100多碱基处产生两个染料和试剂峰，他们在处理的时候会 ...

首先，引物距离下面一行第一个有30左右，这应该不算是引物的问题吧，测序应该测出引物后面所有的碱基序列。
第二，你的意思是引物没问题，实际上公司也测出了那一部分，但可信度不高，所以没有以拼接序列的形式给我，对吧

发自小木虫IOS客户端
赞一下 回复此楼
3楼2016-01-29 20:55:01
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

sloop112

禁虫 (小有名气)
★ ★
西门吹雪170: 金币+2, 鼓励回帖交流 2016-03-23 07:17:05
本帖内容被屏蔽
4楼2016-02-02 08:28:20
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

1272356152

新虫 (正式写手)
这个是准确的

发自小木虫Android客户端
回复此楼
5楼2016-02-02 11:44:41
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

日落沙发

新虫 (小有名气)
引用回帖:
4楼: Originally posted by sloop112 at 2016-02-02 08:28:20
LZ，你的比对情况并不是说明未知序列上没有目的序列的前47位，序列比对软件会尽可能显示高配率的，反而说明测出来的序列是与NCBI的数据吻合的，你只需要查看你目的基因与测序列比对数据即可

谢谢~~~~

发自小木虫IOS客户端
回复此楼
6楼2016-02-02 18:37:53
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

日落沙发

新虫 (小有名气)
引用回帖:
5楼: Originally posted by 1272356152 at 2016-02-02 11:44:41
这个是准确的

谢谢~~~~

发自小木虫IOS客户端
回复此楼
7楼2016-02-02 18:38:06
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

zjrzj520

新虫 (小有名气)
★ ★
西门吹雪170: 金币+2, 鼓励回帖交流 2016-03-23 07:17:32
首先，你需要比对的序列是测序所得的结果，与NCBI进行比对，未知序列的1位对应目的序列的47位只能说明一个情况：就是你已测的序列与目标序列的47位匹配。表明你的未知序列可能并没完全测通
如果没有测通的话，可以让测序公司根据的你的已知序列进行引物合成，病进行反向测序。

希望对你有帮助
赞一下 回复此楼
坚持
8楼2016-02-02 23:50:39
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

zjrzj520

新虫 (小有名气)

【答案】应助回帖

首先，你需要比对的序列是测序所得的结果，与NCBI进行比对，未知序列的1位对应目的序列的47位只能说明一个情况：就是你已测的序列与目标序列的47位匹配。表明你的未知序列可能并没完全测通
如果没有测通的话，可以让测序公司根据的你的已知序列进行引物合成，病进行反向测序。

希望对你有帮助
赞一下 回复此楼
坚持
9楼2016-02-02 23:51:05
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

1272356152

新虫 (正式写手)
加我扣扣我帮你判读

发自小木虫Android客户端
赞一下 回复此楼
10楼2016-02-02 23:57:44
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
相关版块跳转 我要订阅楼主 日落沙发 的主题更新
111/2返回列表12下一页
普通表情 龙 兔 虎 猫
最具人气热帖推荐 [查看全部] 作者 回/看 最后发表
[考研] 284求调剂 +8 天下熯 2026-02-28 8/400 2026-03-02 00:15 by 暮雨星晴
[考研] 材料复试调剂 +3 学材料的点 2026-03-01 4/200 2026-03-02 00:07 by ccp273206157
[基金申请] 本子写完了，给DS兄弟看了，得了92分 +3 Doma 2026-03-01 7/350 2026-03-02 00:00 by jnzsy
[考研] 材料学硕318求调剂 +11 February_Feb 2026-03-01 13/650 2026-03-01 23:53 by ccp273206157
[考研] 一志愿郑大材料学硕298分，求调剂 +5 wsl111 2026-03-01 5/250 2026-03-01 23:45 by 暮雨星晴
[考研] 材料学硕318求调剂 +5 February_Feb 2026-03-01 5/250 2026-03-01 23:31 by L135790
[考研] 275求调剂 +3 明远求学 2026-03-01 3/150 2026-03-01 22:29 by 刘兵
[硕博家园] 博士自荐 +7 科研狗111 2026-02-26 11/550 2026-03-01 22:24 by 哲平L
[考研] 0856求调剂285 +10 吕仔龙 2026-02-28 10/500 2026-03-01 21:37 by 公瑾逍遥
[考研] 高分子化学与物理调剂 +6 好好好1233 2026-02-28 12/600 2026-03-01 19:48 by 好好好1233
[考研] 0856化工专硕求调剂 +12 董boxing 2026-03-01 12/600 2026-03-01 19:45 by 材子momo
[考研] 291分工科求调剂 +9 science饿饿 2026-03-01 10/500 2026-03-01 18:55 by 18137688336
[考研] 化工专硕342，一志愿大连理工大学，求调剂 +3 kyf化工 2026-02-28 4/200 2026-03-01 16:49 by yywzz
[考研] 285求调剂 +8 满头大汗的学生 2026-02-28 8/400 2026-03-01 16:47 by caszguilin
[考研] 313求调剂 +3 水流年lc 2026-02-28 3/150 2026-03-01 16:01 by 新能源达人
[考研] 311求调剂 +6 亭亭亭01 2026-03-01 6/300 2026-03-01 15:41 by 324616
[考研] 寻找调剂 +4 LYidhsjabdj 2026-02-28 4/200 2026-03-01 10:56 by sunny81
[论文投稿] 求助coordination chemistry reviews 的写作模板 10+3 ljplijiapeng 2026-02-27 4/200 2026-03-01 09:07 by babero
[考研] 307求调剂 +4 73372112 2026-02-28 6/300 2026-03-01 00:04 by ll247
[考研] 304求调剂 +3 52hz~~ 2026-02-28 5/250 2026-03-01 00:00 by 52hz~~
信息提示
关闭
请填处理意见
关闭