应《网络安全法》要求，自2017年10月1日起，未进行实名认证将不得使用互联网跟帖服务。为保障您的帐号能够正常使用，请尽快对帐号进行手机号验证，感谢您的理解与支持！

24小时热门版块排行榜    

小木虫论坛-学术科研互动平台 » 计算模拟区 » 分子模拟 » LAMMPS/DL_POLY » Lammps read data后给原子分组的问题
91/1返回列表
查看: 2230  |  回复: 8
只看楼主 @他人 存档 新回复提醒 (忽略) 收藏    在APP中查看

pxjdal

新虫 (小有名气)

[求助] Lammps read data后给原子分组的问题 已有1人参与

请教大家一个问题，我看lammps例句大多数是直接建结构，然后根据region block来分区域，分group。我想问如果是read data得到初始结构，怎么根据region来分区域，分group呢？我在手册上看到group 可以是id< number.来分。可以根据x坐标的大小来分吗？如果我想将读出来的结构x小于A分一组，大于等于A分一组要如何写in文件呢？
回复此楼

» 猜你喜欢

» 本主题相关价值贴推荐，对您同样有帮助:
1楼 2016-01-24 13:56:13
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

zhuuyaoo

金虫 (著名写手)
祝好

发自小木虫Android客户端
回复此楼

» 本帖已获得的红花（最新10朵）

pxjdal
2楼2016-01-24 14:43:50
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

lx_PICO

铁虫 (正式写手)

【答案】应助回帖

★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★
感谢参与，应助指数 +1
pxjdal: 金币+20, ★★★很有帮助 2016-01-24 21:39:22
读了data后再分组不是一样的么？也是先region在group啊
赞一下 回复此楼
3楼2016-01-24 18:18:44
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

pxjdal

新虫 (小有名气)
引用回帖:
3楼: Originally posted by lx_PICO at 2016-01-24 18:18:44
读了data后再分组不是一样的么？也是先region在group啊

再请教一下，我用read_data读入坐标后，用region分组，输入指令为：
region 1 block INF -55 INF INF INF INF
region 2 block -54 INF INF INF INF INF

结果报错 ERROR: Use of region with undefined lattice.
这是为什么呢？
赞一下 回复此楼
4楼2016-01-24 21:57:52
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

pxjdal

新虫 (小有名气)
送红花一朵
引用回帖:
2楼: Originally posted by zhuuyaoo at 2016-01-24 14:43:50
祝好

谢谢
回复此楼
5楼2016-01-24 21:58:19
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

lx_PICO

铁虫 (正式写手)
引用回帖:
4楼: Originally posted by pxjdal at 2016-01-24 21:57:52
再请教一下，我用read_data读入坐标后，用region分组，输入指令为：
region 1 block INF -55 INF INF INF INF
region 2 block -54 INF INF INF INF INF

结果报错 ERROR: Use of region with undefined lattic ...

read data以后还要从新设置一遍lattice参数的。
赞一下 回复此楼
6楼2016-01-25 14:27:06
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

leijincheng

金虫 (小有名气)
只需要在region 1 block INF -55 INF INF INF INF后面加上units box这个keyword和value就好了。
region这个命令默认是拥有  units lattice，因为你没有设置lattice parameter所以会报错。默认情况下你这里的-55指的是-55*lattice constant，而不是绝对坐标-55.0 angstrom。
当然用了units box后你这里边的-55就指的是绝对坐标了。
赞一下 回复此楼
一起面对？
7楼2016-01-27 23:26:30
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

匿名

用户注销 (小有名气)
本帖仅楼主可见
赞一下
8楼2016-11-10 00:44:11
已阅   申请模拟EPI   回复此楼   编辑   查看我的主页

elmer123

禁虫 (初入文坛)
本帖内容被屏蔽
9楼2016-11-19 10:05:30
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
相关版块跳转 我要订阅楼主 pxjdal 的主题更新
91/1返回列表
普通表情 龙 兔 虎 猫
最具人气热帖推荐 [查看全部] 作者 回/看 最后发表
[考研] 293求调剂 +12 zjl的号 2026-03-16 17/850 2026-03-22 16:51 by i_cooler
[考研] 一志愿中南化学（0703）总分337求调剂 +9 niko- 2026-03-19 10/500 2026-03-22 16:08 by ColorlessPI
[考研] 一志愿070300浙大化学358分，求调剂！ +3 酥酥鱼.. 2026-03-21 3/150 2026-03-22 11:31 by 杨杨杨紫
[考研] 材料学硕301分求调剂 +7 Liyouyumairs 2026-03-21 7/350 2026-03-21 22:31 by peike
[考研] 306求0703调剂一志愿华中师范 +5 纸鱼ly 2026-03-21 5/250 2026-03-21 17:11 by 学员8dgXkO
[考研] 22 350 本科985求调剂，求老登收留 +3 李轶男003 2026-03-20 3/150 2026-03-21 13:28 by 搏击518
[考研] 初始318分求调剂（有工作经验） +3 1911236844 2026-03-17 3/150 2026-03-21 02:33 by JourneyLucky
[考研] 材料专业求调剂 +6 hanamiko 2026-03-18 6/300 2026-03-21 00:24 by JourneyLucky
[考研] 330求调剂 +4 小材化本科 2026-03-18 4/200 2026-03-20 23:13 by JourneyLucky
[考研] 药学383 求调剂 +3 药学chy 2026-03-15 5/250 2026-03-20 22:11 by 云游重阳
[考研] 350求调剂 +5 weudhdk 2026-03-19 5/250 2026-03-20 22:04 by luoyongfeng
[考研] 290求调剂 +7 ^O^乜 2026-03-19 7/350 2026-03-20 21:43 by JourneyLucky
[考研] 0703化学调剂 +4 18889395102 2026-03-18 4/200 2026-03-19 16:13 by 30660438
[考研] 286求调剂 +6 lemonzzn 2026-03-16 10/500 2026-03-19 14:31 by lemonzzn
[考研] 0703化学调剂 +5 pupcoco 2026-03-17 8/400 2026-03-19 13:58 by houyaoxu
[考研] 344求调剂 +6 knight344 2026-03-16 7/350 2026-03-18 20:13 by walc
[考研] 334求调剂 +3 志存高远意在机� 2026-03-16 3/150 2026-03-18 08:34 by lm4875102
[考研] 290求调剂 +3 p asserby. 2026-03-15 4/200 2026-03-17 16:35 by wangkm
[考研] [导师推荐]西南科技大学国防/材料导师推荐 +3 尖角小荷 2026-03-16 6/300 2026-03-16 23:21 by 尖角小荷
[考研] 中科院材料273求调剂 +4 yzydy 2026-03-15 4/200 2026-03-16 15:59 by Gaodh_82
信息提示
关闭
请填处理意见
关闭