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小木虫论坛-学术科研互动平台 » 计算模拟区 » 分子模拟 » LAMMPS/DL_POLY » Lammps read data后给原子分组的问题
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pxjdal

新虫 (小有名气)

[求助] Lammps read data后给原子分组的问题 已有1人参与

请教大家一个问题，我看lammps例句大多数是直接建结构，然后根据region block来分区域，分group。我想问如果是read data得到初始结构，怎么根据region来分区域，分group呢？我在手册上看到group 可以是id< number.来分。可以根据x坐标的大小来分吗？如果我想将读出来的结构x小于A分一组，大于等于A分一组要如何写in文件呢？
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1楼 2016-01-24 13:56:13
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lx_PICO

铁虫 (正式写手)
引用回帖:
4楼: Originally posted by pxjdal at 2016-01-24 21:57:52
再请教一下，我用read_data读入坐标后，用region分组，输入指令为：
region 1 block INF -55 INF INF INF INF
region 2 block -54 INF INF INF INF INF

结果报错 ERROR: Use of region with undefined lattic ...

read data以后还要从新设置一遍lattice参数的。
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6楼2016-01-25 14:27:06
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zhuuyaoo

金虫 (著名写手)
祝好

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pxjdal
2楼2016-01-24 14:43:50
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lx_PICO

铁虫 (正式写手)

【答案】应助回帖

★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★
感谢参与，应助指数 +1
pxjdal: 金币+20, ★★★很有帮助 2016-01-24 21:39:22
读了data后再分组不是一样的么？也是先region在group啊
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3楼2016-01-24 18:18:44
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pxjdal

新虫 (小有名气)
引用回帖:
3楼: Originally posted by lx_PICO at 2016-01-24 18:18:44
读了data后再分组不是一样的么？也是先region在group啊

再请教一下，我用read_data读入坐标后，用region分组，输入指令为：
region 1 block INF -55 INF INF INF INF
region 2 block -54 INF INF INF INF INF

结果报错 ERROR: Use of region with undefined lattice.
这是为什么呢？
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4楼2016-01-24 21:57:52
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