24小时热门版块排行榜    

查看: 2489  |  回复: 8
当前只显示满足指定条件的回帖,点击这里查看本话题的所有回帖

pxjdal

新虫 (小有名气)

[求助] Lammps read data后给原子分组的问题 已有1人参与

请教大家一个问题,我看lammps例句大多数是直接建结构,然后根据region block来分区域,分group。我想问如果是read data得到初始结构,怎么根据region来分区域,分group呢?我在手册上看到group 可以是id< number.来分。可以根据x坐标的大小来分吗?如果我想将读出来的结构x小于A分一组,大于等于A分一组要如何写in文件呢?
回复此楼
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

leijincheng

金虫 (小有名气)

只需要在region 1 block INF -55 INF INF INF INF后面加上units box这个keyword和value就好了。
region这个命令默认是拥有  units lattice,因为你没有设置lattice parameter所以会报错。默认情况下你这里的-55指的是-55*lattice constant,而不是绝对坐标-55.0 angstrom。
当然用了units box后你这里边的-55就指的是绝对坐标了。
一起面对?
7楼2016-01-27 23:26:30
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
查看全部 9 个回答

zhuuyaoo

金虫 (著名写手)

» 本帖已获得的红花(最新10朵)

2楼2016-01-24 14:43:50
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

lx_PICO

铁虫 (正式写手)

【答案】应助回帖

★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★
感谢参与,应助指数 +1
pxjdal: 金币+20, ★★★很有帮助 2016-01-24 21:39:22
读了data后再分组不是一样的么?也是先region在group啊
3楼2016-01-24 18:18:44
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

pxjdal

新虫 (小有名气)

引用回帖:
3楼: Originally posted by lx_PICO at 2016-01-24 18:18:44
读了data后再分组不是一样的么?也是先region在group啊

再请教一下,我用read_data读入坐标后,用region分组,输入指令为:
region 1 block INF -55 INF INF INF INF
region 2 block -54 INF INF INF INF INF

结果报错 ERROR: Use of region with undefined lattice.
这是为什么呢?
4楼2016-01-24 21:57:52
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
最具人气热帖推荐 [查看全部] 作者 回/看 最后发表
[基金申请] 投票:  有多少人是今天查系统知道结果的? +16 爱看书的可乐 2026-08-26 18/900 2026-08-28 05:13 by winsaint
[硕博家园] 售SCI一区文章,我:8O5.5.1.O5.4,科目全,可伽急 +3 XLGfUIdOmEAO 2026-08-27 3/150 2026-08-28 00:49 by 3RAFyYXYSwGS
[基金申请] 哪位高人中了,把查询到的截图贴出来让我看看,让我长长见识 +5 yuleib84 2026-08-26 6/300 2026-08-28 00:02 by yudaoqian88
[教师之家] 售SCI文章,我:8O5.5.1.O.54,科目齐全,可+急 +3 XLGfUIdOmEAO 2026-08-27 4/200 2026-08-27 22:26 by 3RAFyYXYSwGS
[基金申请] 基金不中,共勉 +10 eulota 2026-08-26 10/500 2026-08-27 17:23 by lqllinqiaoli
[基金申请] 基金未中,这种答复是模板吗? +5 zhaosm1982 2026-08-27 6/300 2026-08-27 16:00 by lfy8008
[文学芳草园] 梦想 +3 myrtle 2026-08-26 3/150 2026-08-27 10:01 by angelyueyi
[教师之家] 售SCI一区文章,我:8.O.551.O.5.4,科目全,可伽急 +3 LIbGuocjEEYw 2026-08-26 4/200 2026-08-27 04:33 by Ie9AyIAvGbvs
[基金申请] 我不理解! +15 Edward_pc 2026-08-26 23/1150 2026-08-26 20:34 by zzuzxg
[基金申请] 怎么查啊 +5 huang1991js 2026-08-26 5/250 2026-08-26 16:09 by Equinoxhua
[基金申请] 国合可查了 +3 paperzjh 2026-08-26 3/150 2026-08-26 10:41 by LemmonTr
[基金申请] 今天务委会开完了,明天出结果吗 +19 angus9576 2026-08-25 23/1150 2026-08-26 10:03 by zp519
[基金申请] 国合现在查不到了吗? +10 chengyan1220 2026-08-24 20/1000 2026-08-26 08:57 by peasantsprig
[基金申请] 明天应该可查了!? +6 chengyan1220 2026-08-23 6/300 2026-08-25 19:45 by zfd97
[基金申请] 某些机构,以效率低为荣,以效率低作为存在感 +9 yuleib84 2026-08-25 10/500 2026-08-25 17:14 by alexon
[基金申请] 如果此刻你正在为国基感到焦虑,不妨来听听这首《基金之外》 +8 scalable 2026-08-24 8/400 2026-08-25 12:52 by jnhyjjm
[基金申请] 人气不行了 +11 fansofjerry 2026-08-21 11/550 2026-08-25 11:04 by 孤独的英雄6
[基金申请] 建议基金发布提前给出明确的时间点 +13 kulium 2026-08-21 16/800 2026-08-24 16:27 by superceng
[教师之家] 跳槽后在研项目怎么办? +5 简单化xn 2026-08-22 10/500 2026-08-23 12:38 by 简单化xn
[基金申请] 看来今天不会放榜了? +8 chengyan1220 2026-08-21 11/550 2026-08-21 17:52 by dcqxinyang
信息提示
请填处理意见