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pxjdal

新虫 (小有名气)

[求助] Lammps read data后给原子分组的问题 已有1人参与

请教大家一个问题,我看lammps例句大多数是直接建结构,然后根据region block来分区域,分group。我想问如果是read data得到初始结构,怎么根据region来分区域,分group呢?我在手册上看到group 可以是id< number.来分。可以根据x坐标的大小来分吗?如果我想将读出来的结构x小于A分一组,大于等于A分一组要如何写in文件呢?
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leijincheng

金虫 (小有名气)

只需要在region 1 block INF -55 INF INF INF INF后面加上units box这个keyword和value就好了。
region这个命令默认是拥有  units lattice,因为你没有设置lattice parameter所以会报错。默认情况下你这里的-55指的是-55*lattice constant,而不是绝对坐标-55.0 angstrom。
当然用了units box后你这里边的-55就指的是绝对坐标了。
一起面对?
7楼2016-01-27 23:26:30
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zhuuyaoo

金虫 (著名写手)

» 本帖已获得的红花(最新10朵)

2楼2016-01-24 14:43:50
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lx_PICO

铁虫 (正式写手)

【答案】应助回帖

★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★
感谢参与,应助指数 +1
pxjdal: 金币+20, ★★★很有帮助 2016-01-24 21:39:22
读了data后再分组不是一样的么?也是先region在group啊
3楼2016-01-24 18:18:44
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pxjdal

新虫 (小有名气)

引用回帖:
3楼: Originally posted by lx_PICO at 2016-01-24 18:18:44
读了data后再分组不是一样的么?也是先region在group啊

再请教一下,我用read_data读入坐标后,用region分组,输入指令为:
region 1 block INF -55 INF INF INF INF
region 2 block -54 INF INF INF INF INF

结果报错 ERROR: Use of region with undefined lattice.
这是为什么呢?
4楼2016-01-24 21:57:52
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