24小时热门版块排行榜    

北京石油化工学院2026年研究生招生接收调剂公告
查看: 559  |  回复: 4
当前主题已经存档。
【有奖交流】积极回复本帖子,参与交流,就有机会分得作者 gamma337 的 10 个金币
当前只显示满足指定条件的回帖,点击这里查看本话题的所有回帖

gamma337

银虫 (小有名气)

[交流] 【咨询】分子动力学模拟的周期边界程序

有没有写周期边界条件程序的模友?

怎么加上去边界条件,周期边界条件怎么用程序实现?

[ Last edited by kuhailangyu on 2008-12-9 at 10:49 ]
回复此楼

» 猜你喜欢

» 本主题相关商家推荐: (我也要在这里推广)

美元一起赚: http://usearn.5d6d.com/index.php
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

sheath

至尊木虫 (知名作家)

如果以box表示正方形周期性边长,rx为原子i与j的x方向的距离,
则在程序中可以用一个简单的语句来实现求rx:

rx=rx-box*nint(rx/box)
3楼2008-10-04 10:46:15
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
查看全部 5 个回答

yma

木虫 (正式写手)

definition of variables: xl: length of the perodic box
xi, xj: position of i and j atoms

when calculating foreces:
xl2=2/xl
x10=xi-xj
mx10=x10*xl2
x10=x10-mx10*xl

when updating new positions:
xli=1/xl
        xx = xi * xli
        m1 = xx
        m2 = xx - 1 d0
        xi = ( xx - m1 - m2 ) * xl

Hope it helps
2楼2008-10-04 10:00:49
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

yijun0516

铜虫 (小有名气)

太高深了,俺不懂,还得好好学习才行,MS不是有建周期边界的命令么,为什么还要写程序呢?不懂!
4楼2008-10-04 11:41:30
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
普通表情 高级回复 (可上传附件)
最具人气热帖推荐 [查看全部] 作者 回/看 最后发表
[考研] 一志愿西北农林畜牧专硕336分求调剂 +3 5ourr 2026-04-03 3/150 2026-04-05 10:40 by JOKER0401
[考研] 0703化学调剂325分 +8 15771691647 2026-04-04 8/400 2026-04-05 10:21 by 戴维ING
[考研] 一志愿华中农业大学0710(A)初试329分 求调剂 +4 一名26考研生 2026-04-04 4/200 2026-04-05 10:01 by barlinike
[考研] 材料专硕322分 +11 哈哈哈吼吼吼哈 2026-04-02 11/550 2026-04-04 23:37 by 永字号
[考研] 288环境专硕,求调材料方向 +13 lllllos 2026-04-04 14/700 2026-04-04 23:34 by lqwchd
[考研] 086000生物与医药298调剂求助 +6 元元青青 2026-03-31 8/400 2026-04-04 22:15 by lys0704
[考研] 277工科求调剂 +7 1915668 2026-04-04 7/350 2026-04-04 17:21 by 啊俊!
[考研] 266求调剂 +18 阳阳哇塞 2026-04-01 18/900 2026-04-03 18:38 by zllcz
[考研] 326分求调剂 +3 于是乎呢 2026-04-01 5/250 2026-04-03 14:23 by 于是乎呢
[考研] 生物学求调剂 +3 15064154688 2026-04-03 3/150 2026-04-03 10:28 by macy2011
[考研] 一志愿北京科技大学085601材料工程英一数二初试总分335求调剂 +9 双马尾痞老板2 2026-04-01 9/450 2026-04-02 12:14 by oooqiao
[考研] 0856初试324分求调剂 +6 想上学求调 2026-04-01 6/300 2026-04-02 11:42 by 星空星月
[考研] 0805求调剂 +8 是水分 2026-03-31 8/400 2026-04-02 10:46 by guanxin1001
[考研] 324求调剂 +5 想上学求调 2026-04-01 6/300 2026-04-02 10:16 by sanrepian
[考研] 279求调剂 +7 莫xiao 2026-04-01 7/350 2026-04-01 22:05 by 客尔美德
[考研] 296求调剂 +4 汪!?! 2026-03-31 7/350 2026-04-01 22:04 by 客尔美德
[考研] 070300化学279求调剂 +15 哈哈哈^_^ 2026-03-31 17/850 2026-04-01 21:37 by 给你你注意休息
[考研] 085600,321分求调剂 +13 大馋小子 2026-03-31 13/650 2026-04-01 12:35 by chemdavid
[考研] 0710生物学求调剂! +6 叙述文 2026-03-31 6/300 2026-04-01 09:39 by JourneyLucky
[考研] 080500-315分复试调剂 +9 上岸3821 2026-03-31 9/450 2026-03-31 17:29 by 唐沐儿
信息提示
请填处理意见