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虫卜1988

新虫 (著名写手)

[求助] 求大神~启动子研究,gus表达,用的pbi121 已有1人参与

大家好,本人准备做不同材料的同一个基因启动子研究。序列我已知道,存在差异。所以要比较两个材料的启动子是不是活性不一样。目前手头可以用的载体是pbi 121,15000bp左右,打算把自己的启动子置换掉载体gus报告基因前面的35s启动子。我目前有两个问题不清楚。求大神们指导。1. 使用plantcare预测时,有+-链的结果,我是考虑正义链就可以了还是正义链反义链都需要看???我问了我身边几个做过的,他们也没有说清。2.构建载体时看论坛有人说考虑移码突变。我是这么想的,克隆时F引物只要不打断前面的元件,后面的R引物刚好设计到我的目的基因ATg前面的一个碱基,这样子启动子再整到121载体上,后面的gus应该不会导致移码突变了对吗?我的启动子有atg,但是在网上查只要启动子有转录起始位点,里面的atg不会作为翻译起始位点的,所以就没有考虑它们和gus前的碱基是不是3的倍数。这样子想对吗?

[ 发自手机版 http://muchong.com/3g ]
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浩二

新虫 (小有名气)

我也做跟你差不多的,能交流一下么?QQ或者其他什么的
如果我还有快乐。。!~~
4楼2016-12-22 18:40:03
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xiangbchen

金虫 (正式写手)

【答案】应助回帖

感谢参与,应助指数 +1
1. 看正义链。
2. 不存在移码突变的问题。
3. 确定你所用启动子对应基因的转录起始位点(一般是5'UTR顶端),对该转录起始位点开始转录包含GUS的融合mRNA进行ORF分析,检测是否影响GUS的翻译。

发自小木虫Android客户端
2楼2016-01-18 13:12:48
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gongming2199

铁虫 (初入文坛)

你好,我是南京林业大学的,我们实验室的pbi121找不到了,方便的话你能给我点吗?买公司的太贵,我们质粒都是找别人要的,不会让你白辛苦的,你看可以吗?

发自小木虫Android客户端

» 本帖已获得的红花(最新10朵)

努力做成功的自己!
3楼2016-09-08 06:50:09
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浩二

新虫 (小有名气)

引用回帖:
2楼: Originally posted by xiangbchen at 2016-01-18 13:12:48
1. 看正义链。
2. 不存在移码突变的问题。
3. 确定你所用启动子对应基因的转录起始位点(一般是5'UTR顶端),对该转录起始位点开始转录包含GUS的融合mRNA进行ORF分析,检测是否影响GUS的翻译。
...

大神,我有好多启动子方面的问题想找找专家问问,可以跟你联系么、?
如果我还有快乐。。!~~
5楼2016-12-22 18:41:32
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