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小木虫论坛-学术科研互动平台 » 生物医药区 » 分子生物 » PCR相关 » SSR分子标记的pcr扩增产物跑电泳求助
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木易Vivi

新虫 (初入文坛)

[求助] SSR分子标记的pcr扩增产物跑电泳求助 已有9人参与

本人小白，刚开始做实验，根据设计的引物跑出来的pcr扩增产物。在跑电泳时电泳图总是歪歪的，已经连续好几次这样了，不晓得为什么？求万能的虫友指点迷津，基本上跑电泳出来的结果都是像下面的图片一样

SSR分子标记的pcr扩增产物跑电泳求助


SSR分子标记的pcr扩增产物跑电泳求助-1


SSR分子标记的pcr扩增产物跑电泳求助-2


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1楼 2016-01-12 18:27:35
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回帖支持 ( 显示支持度最高的前 50 名 )

第五平原

木虫 (正式写手)

【答案】应助回帖

感谢参与，应助指数 +1
做胶的问题，你跑出来的条带歪歪扭扭的可能是两块玻璃板没放好，或者是固定的时候板子两端力度不一样就会这样。
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勤勉
7楼2016-01-12 22:40:52
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石磊1234vera

新虫 (初入文坛)

【答案】应助回帖

感谢参与，应助指数 +1
应该是胶没有做好，没有等琼脂变成透明的时候就拿出来了吧。

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木易Vivi
8楼2016-01-12 23:03:06
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普通回帖

蓝莓好吃吗87

铁虫 (正式写手)
胶没制好吧

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木易Vivi
2楼2016-01-12 18:37:11
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木易Vivi

新虫 (初入文坛)
送红花一朵
引用回帖:
2楼: Originally posted by 蓝莓好吃吗87 at 2016-01-12 18:37:11
胶没制好吧

胶的问题吗？可是制胶都是同样的步骤，怎么会出现问题了？

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3楼2016-01-12 18:54:50
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匿名

用户注销 (初入文坛)
本帖仅楼主可见
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4楼2016-01-12 19:26:00
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upgo123

金虫 (小有名气)

【答案】应助回帖

感谢参与，应助指数 +1
请问你用的是什么胶？就是跑常规PCR产物用的胶吗？百分之多少的胶？电压和电流是多少呢？谢谢！
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木易Vivi
选择，然后坚持
5楼2016-01-12 21:31:47
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小虫子666

铁杆木虫 (正式写手)

【答案】应助回帖

感谢参与，应助指数 +1
胶没有溶解完全还有细小颗粒，或者没有彻底凝固，电泳液及时更换，恒电压跑，自己考虑这几方面。
SSR引物扩增产物，若用琼脂糖电泳最好2%以上才能较好的区分多态性，其实跑SSR标记还是建议做非变性PAGE或者变性PAGE。
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木易Vivi
6楼2016-01-12 22:02:21
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木易Vivi

新虫 (初入文坛)
送红花一朵
引用回帖:
5楼: Originally posted by upgo123 at 2016-01-12 21:31:47
请问你用的是什么胶？就是跑常规PCR产物用的胶吗？百分之多少的胶？电压和电流是多少呢？谢谢！

对啊，就是制的普通的，比例是1%，电压是150
V

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9楼2016-01-13 00:01:49
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木易Vivi

新虫 (初入文坛)
送红花一朵
引用回帖:
8楼: Originally posted by 石磊1234vera at 2016-01-12 23:03:06
应该是胶没有做好，没有等琼脂变成透明的时候就拿出来了吧。

放了一个多小时呀

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10楼2016-01-13 00:02:04
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