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tianflame金虫 (小有名气)
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[求助]
求助 对受体蛋白做定向进化/虚拟氨基酸突变以提高与配体的亲和力 哪个软件好 已有1人参与
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大家好: 目前我在研究一个配体-受体结合的体系,配体结构固定,我需要将受体的binding site氨基酸进行饱和突变(大概6、7个氨基酸),从中筛选出能够增强与配体亲和力的突变组合,请问以下软件哪个最好:DS,MOE,Schrodinger,或者还有其他更好的软件推荐也行,最好是Windows系统下的。 我查到文献上用MM/PBSA的方法计算binding energy以此判断亲和力的大小,请问这个方法是目前为止最好的方法吗?是否有更好的方法?以上软件哪个可以使用这种方法? 谢谢大家! |
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