24小时热门版块排行榜    

查看: 4626  |  回复: 6
当前只显示满足指定条件的回帖,点击这里查看本话题的所有回帖

wyysunshine

木虫 (知名作家)

[求助] BEAST软件计算分化时间求助!

用BEAST软件计算物种分化时间,看了两天教程,遇到几个问题,打滚求助!cry:
1 NEXUS文件设置
#NEXUS
begin data;
dimensions ntax=148 nchar=646;
format datatype=DNA missing=? gap=-;
format datatype=DNA interleave=no gap=-;
这两种设置有差别吗?我用后一种设置的时候,文件就无法导入BEAUti了,并显示如第1张图所示。

是否需要定义序列区段分割(这个是例子里显示的)?如果需要,依据什么进行分割?
begin assumptions;
charset firsthalf = 1-449;
charset secondhalf = 450-898;
end;
end;

2 Taxon sets
是不是设置一个ingroup和一个outgroup就可以了,都设置成mono?

3 Priors参数
我按照教程来看,不同的例子各种参数设置也不一样。请问我这个设置是否有问题,各种参数设置的标准是什么?不同的教程也存在差异,把我弄懵了。
另外可能由于软件版本的原因,我的设置里面都有一项initial,这个也不知道该是多少?还有一个无穷大的符号,也不知道该怎么加进去。。第2张图。

第3张图是教程的例子。


BEAST软件计算分化时间求助!
错误.png


BEAST软件计算分化时间求助!-1
priors参数.jpg


BEAST软件计算分化时间求助!-2
例子.png
回复此楼
顺其自然~~
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

chenyuqi9494

新虫 (初入文坛)

跪求一份教程!万分感谢!chenyuqi1994@yeah.net
5楼2017-06-05 16:27:42
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
查看全部 7 个回答

童话人

木虫 (小有名气)

跪求楼主发一份教程啊 邮箱:zgongz@163.com
I exist only in my world.
2楼2017-02-27 17:46:58
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

wyyiscute

新虫 (初入文坛)

树画好之后下面可以显示具体年份而不是年份距离么?

发自小木虫Android客户端
3楼2017-02-28 15:16:10
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

llyy119

新虫 (初入文坛)

求教程一份lyykfeng@126.com。谢谢!
4楼2017-05-14 13:08:56
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
最具人气热帖推荐 [查看全部] 作者 回/看 最后发表
[考研] 303求调剂 +4 元夕元 2026-03-20 5/250 2026-03-25 00:20 by 元夕元
[有机交流] 有机合成求助 20+3 FENGSHUJEI 2026-03-23 5/250 2026-03-24 19:31 by 88817753
[考研] 求调剂 +6 研研,接电话 2026-03-24 7/350 2026-03-24 17:01 by barlinike
[考研] 291求调剂 +8 hhhhxn.. 2026-03-23 8/400 2026-03-23 23:15 by peike
[考研] 一志愿武理材料工程348求调剂 +6  ̄^ ̄゜汗 2026-03-19 9/450 2026-03-23 19:53 by pswait
[考研] 0703化学求调剂 +4 奶油草莓. 2026-03-22 5/250 2026-03-23 19:37 by pswait
[考研] 298求调剂一志愿211 +3 上岸6666@ 2026-03-20 3/150 2026-03-22 15:50 by ColorlessPI
[考研] 求调剂 +7 Auroracx 2026-03-22 7/350 2026-03-22 12:38 by 素颜倾城1988
[考研] 材料与化工(0856)304求 B区 调剂 +3 邱gl 2026-03-21 3/150 2026-03-21 13:47 by lature00
[考研] 085601调剂 358分 +3 zzzzggh 2026-03-20 4/200 2026-03-21 10:21 by luoyongfeng
[考研] 一志愿 西北大学 ,070300化学学硕,总分287,双非一本,求调剂。 +3 晨昏线与星海 2026-03-18 3/150 2026-03-21 00:46 by JourneyLucky
[考研] 一志愿西南交大,求调剂 +5 材化逐梦人 2026-03-18 5/250 2026-03-21 00:26 by JourneyLucky
[考研] 南京大学化学376求调剂 +3 hisfailed 2026-03-19 6/300 2026-03-20 23:43 by hisfailed
[考研] 329求调剂 +9 想上学吖吖 2026-03-19 9/450 2026-03-20 22:01 by luoyongfeng
[考研] 中南大学化学学硕337求调剂 +3 niko- 2026-03-19 6/300 2026-03-20 21:58 by luoyongfeng
[考研] A区线材料学调剂 +5 周周无极 2026-03-20 5/250 2026-03-20 21:33 by laoshidan
[考研] 295材料求调剂,一志愿武汉理工085601专硕 +5 Charlieyq 2026-03-19 5/250 2026-03-20 20:35 by JourneyLucky
[考研] 一志愿 南京航空航天大学大学 ,080500材料科学与工程学硕 +5 @taotao 2026-03-20 5/250 2026-03-20 20:16 by JourneyLucky
[考研] 一志愿南理工085701环境302求调剂院校 +3 葵梓卫队 2026-03-20 3/150 2026-03-20 19:28 by zhukairuo
[考研] 一志愿福大288有机化学,求调剂 +3 小木虫200408204 2026-03-18 3/150 2026-03-19 13:31 by houyaoxu
信息提示
请填处理意见