24小时热门版块排行榜

返回列表

当前只显示满足指定条件的回帖，点击这里查看本话题的所有回帖

wyysunshine

木虫 (知名作家)

应助: 34 (小学生)
金币: 1292.9
散金: 6905
红花: 32
帖子: 5026
在线: 510.4小时
虫号: 2525526
注册: 2013-06-29
专业: 植物遗传学

[求助] BEAST软件计算分化时间求助！

用BEAST软件计算物种分化时间，看了两天教程，遇到几个问题，打滚求助！cry:

1 NEXUS文件设置
#NEXUS
begin data;
dimensions ntax=148 nchar=646;
format datatype=DNA missing=? gap=-;
format datatype=DNA interleave=no gap=-;
这两种设置有差别吗？我用后一种设置的时候，文件就无法导入BEAUti了，并显示如第1张图所示。

是否需要定义序列区段分割（这个是例子里显示的）？如果需要，依据什么进行分割？
begin assumptions;
charset firsthalf = 1-449;
charset secondhalf = 450-898;
end;
end;

2 Taxon sets
是不是设置一个ingroup和一个outgroup就可以了，都设置成mono？

3 Priors参数
我按照教程来看，不同的例子各种参数设置也不一样。请问我这个设置是否有问题，各种参数设置的标准是什么？不同的教程也存在差异，把我弄懵了。
另外可能由于软件版本的原因，我的设置里面都有一项initial，这个也不知道该是多少？还有一个无穷大的符号，也不知道该怎么加进去。。第2张图。

第3张图是教程的例子。