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wyysunshine木虫 (知名作家)
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[求助]
BEAST软件计算分化时间求助！
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用BEAST软件计算物种分化时间，看了两天教程，遇到几个问题，打滚求助！cry: 1 NEXUS文件设置 #NEXUS begin data; dimensions ntax=148 nchar=646; format datatype=DNA missing=? gap=-; format datatype=DNA interleave=no gap=-; 这两种设置有差别吗？我用后一种设置的时候，文件就无法导入BEAUti了，并显示如第1张图所示。 是否需要定义序列区段分割（这个是例子里显示的）？如果需要，依据什么进行分割？ begin assumptions; charset firsthalf = 1-449; charset secondhalf = 450-898; end; end; 2 Taxon sets 是不是设置一个ingroup和一个outgroup就可以了，都设置成mono？ 3 Priors参数 我按照教程来看，不同的例子各种参数设置也不一样。请问我这个设置是否有问题，各种参数设置的标准是什么？不同的教程也存在差异，把我弄懵了。 另外可能由于软件版本的原因，我的设置里面都有一项initial，这个也不知道该是多少？还有一个无穷大的符号，也不知道该怎么加进去。。第2张图。 第3张图是教程的例子。  错误.png  priors参数.jpg  例子.png |
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ticktickcai
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