| 查看: 1590 | 回复: 10 | |||
[求助]
关于siesta-3.0-b安装并行 编译的问题已有2人参与
|
|
请教大家： 我在虚拟机上(Centos6.5)安装intel并行后，再安装siesta-3.0-b,前面都没有问题，再修改完arch.make后，make时出现问题  make.jpg |
回复此楼» 猜你喜欢
博士读完未来一定会好吗
已经有6人回复
-
小论文投稿
已经有3人回复
-
Bioresource Technology期刊，第一次返修的时候被退回好几次了
已经有9人回复
-
心脉受损
已经有3人回复
-
到新单位后，换了新的研究方向，没有团队，持续积累2区以上论文，能申请到面上吗
已经有8人回复
-
申请2026年博士
已经有6人回复
-
请问哪里可以有青B申请的本子可以借鉴一下。
已经有5人回复
» 本主题相关价值贴推荐，对您同样有帮助:
我向求助关于siesta模拟H2O中总能量与晶格常数之间的关系，我是初学者，谢谢帮助！
已经有4人回复- 关于使用siesta计算ordern的参数设置和问题解决
已经有4人回复
- 关于siesta-3.2的范德瓦尔斯作用的问题
已经有3人回复
- 关于在siesta中C18结构原子坐标的输入输入问题
已经有0人回复
- 手册中计算能带时k点设置的问题
已经有12人回复
- 关于siesta里的constant_volume。fdf的输入文件是算什么的？？？
已经有2人回复
- 关于siesta计算铁的结合能的问题
已经有4人回复
- Parallel options设置求助
已经有1人回复
- 有关吸附能的计算，求助各位大侠
已经有1人回复
- 关于siesta动力学问题
已经有1人回复
- 关于SIESTA中如何计算功函数的一种做法探讨
已经有8人回复
- 【求助】呼叫zhangguangping...关于态密度的计算
已经有11人回复
- 【已解决】siesta-3.0-rc2中几何结构优化时DM的extrapolation问题
已经有1人回复
- 【求助】求助一下：关于dmol3的收敛问题
已经有2人回复
- 【原创】第一原理计算的一些心得
已经有160人回复
- 【求助】transiesta关闭后可以接着原来的迭代继续算么
已经有5人回复
- 【求助】siesta中关于几何结构优化的问题【完结】
已经有17人回复
- 【求助】关于siesta的几何结构优化中断后继续的问题【完结】
已经有6人回复
- 【求助】关于siesta 注册问题【完结】
已经有5人回复
- 【分享】世界上讲述电子结构计算的最权威和实用的网站
已经有22人回复
- 【求助】关于siesta中赝势价电子轨道的问题
已经有10人回复
|
我（楼主）在arch.make中修改的内容 18 FC=mpif90 38 BLAS_LIBS=-L/opt/intel/composerxe/mkl/lib/intel64/libmkl_intel_lp64.so 39 BLAS_LIBS=-L/opt/intel/composer_xe_2015.0.090/mkl/include/mkl_solver.* 40 LAPACK_LIBS=-L/opt/intel/composerxe/mkl/lib/intel64/libmkl_sequential.so 41 LAPACK_LIBS=-L/opt/intel/composerxe/mkl/lib/intel64/libmkl_core.so 42 BLACS_LIBS=-L/opt/intel/composerxe/mkl/lib/intel64/libmkl_blacs_intelmpi_lp64.so 43 SCALAPACK_LIBS=-L/opt/intel/composerxe/mkl/lib/intel64/libmkl_scalapack_lp64.so 57 MPI_INCLUDE=/opt/intel/impi/5.0.1.035/intel64/include |
2楼2015-12-21 10:01:53
|
刚才写错了，在arch.make中第38行-43行 38 BLAS_LIBS=-L/opt/intel/composerxe/mkl/lib/intel64/libmkl_intel_lp64.a 39 BLAS_LIBS=-L/opt/intel/composer_xe_2013.1.117/mkl/include/mkl_solver.* 40 LAPACK_LIBS=-L/opt/intel/composerxe/mkl/lib/intel64/libmkl_sequential.a 41 LAPACK_LIBS=-L/opt/intel/composerxe/mkl/lib/intel64/libmkl_core.a 42 BLACS_LIBS=-L/opt/intel/composerxe/mkl/lib/intel64/libmkl_blacs_intelmpi_lp64.a 43 SCALAPACK_LIBS=-L/opt/intel/composerxe/mkl/lib/intel64/libmkl_scalapack_lp64.a 望大家海涵  |
3楼2015-12-21 10:29:16
ljw4010
荣誉版主 (职业作家)
小木虫从头派教主
- 应助: 116 (高中生)
- 贵宾: 5.434
- 金币: 26571.7
- 散金: 4305
- 红花: 69
- 沙发: 10
- 帖子: 4104
- 在线: 889.1小时
- 虫号: 3019479
- 注册: 2014-03-05
- 专业: 半导体微纳机电器件与系统
- 管辖: 计算模拟
taofumu
4楼2015-12-21 11:15:46
5楼2015-12-21 13:10:46
ljw4010
荣誉版主 (职业作家)
小木虫从头派教主
- 应助: 116 (高中生)
- 贵宾: 5.434
- 金币: 26571.7
- 散金: 4305
- 红花: 69
- 沙发: 10
- 帖子: 4104
- 在线: 889.1小时
- 虫号: 3019479
- 注册: 2014-03-05
- 专业: 半导体微纳机电器件与系统
- 管辖: 计算模拟
6楼2015-12-21 13:39:26
|
没有fortran，有gfortran可以吗 # which fortran /usr/bin/which: no fortran in (/opt/intel//impi/5.0.1.035/intel64/bin:/opt/intel//impi/5.0.1.035/intel64/bin:/opt/intel/composer_xe_2015.0.090/bin/intel64:/opt/intel/composer_xe_2015.0.090/mpirt/bin/intel64:/opt/intel/composer_xe_2015.0.090/debugger/gdb/intel64_mic/bin:/opt/intel//impi/5.0.1.035/intel64/bin:/opt/intel/composer_xe_2015.0.090/bin/intel64:/opt/intel/composer_xe_2015.0.090/mpirt/bin/intel64:/opt/intel/composer_xe_2015.0.090/debugger/gdb/intel64_mic/bin:/usr/lib64/qt-3.3/bin:/usr/kerberos/sbin:/usr/kerberos/bin:/usr/local/sbin:/usr/local/bin:/sbin:/bin:/usr/sbin:/usr/bin:/root/bin:/root/bin) # which gfortran /usr/bin/gfortran # find / -name fortran* /opt/siesta-3.0-b/Src/m4/fortran.m4 /opt/intel/advisor_xe_2015.1.0.367266/config/tc/fortran.ant /opt/intel/inspector_xe_2015.1.0.366509/config/tc/fortran.ant /usr/share/emacs/23.1/lisp/progmodes/fortran.elc /usr/share/autoconf/autoconf/fortran.m4 /usr/share/gtksourceview-2.0/language-specs/fortran.lang /usr/share/enscript/hl/fortran.st /usr/share/enscript/hl/fortran_pp.st /usr/share/kde4/apps/katepart/syntax/fortran.xml /usr/share/doc/mvapich-common-1.2.0/examples/perftest/config/confdb/fortran90.m4 /usr/share/apps/katepart/syntax/fortran.xml /usr/share/vim/vim72/ftplugin/fortran.vim /usr/share/vim/vim72/compiler/fortran_elf90.vim /usr/share/vim/vim72/compiler/fortran_g77.vim /usr/share/vim/vim72/compiler/fortran_F.vim /usr/share/vim/vim72/compiler/fortran_lf95.vim /usr/share/vim/vim72/compiler/fortran_cv.vim /usr/share/vim/vim72/indent/fortran.vim /usr/share/vim/vim72/syntax/fortran.vim /usr/share/gedit-2/plugins/snippets/fortran.xml /usr/share/mc/syntax/fortran.syntax /usr/lib64/python2.6/site-packages/numpy/f2py/src/fortranobject.c /usr/lib64/python2.6/site-packages/numpy/f2py/src/fortranobject.h [root@node01 Obj]# find / -name ifort* /opt/siesta-3.0-b/Src/Sys/ifort-netcdf.make /opt/intel/composer_xe_2015/bin/ifort /opt/intel/bin/ifort /opt/intel/bin/ifortvars.csh /opt/intel/bin/ifortvars.sh /opt/intel/composer_xe_2015.0.090/bin/ia32/ifort_libFNP.so /opt/intel/composer_xe_2015.0.090/bin/ia32/ifort /opt/intel/composer_xe_2015.0.090/bin/ia32/ifort.cfg /opt/intel/composer_xe_2015.0.090/bin/intel64_mic/ifort /opt/intel/composer_xe_2015.0.090/bin/intel64_mic/ifort.cfg /opt/intel/composer_xe_2015.0.090/bin/intel64/ifort_libFNP.so /opt/intel/composer_xe_2015.0.090/bin/intel64/ifort /opt/intel/composer_xe_2015.0.090/bin/intel64/ifort.cfg /opt/intel/composer_xe_2015.0.090/bin/ifortvars.csh /opt/intel/composer_xe_2015.0.090/bin/ifortvars.sh /opt/intel/composer_xe_2015.0.090/man/en_US/man1/ifort.1 可以帮我看一下有什么不对吗 |
7楼2015-12-21 14:05:20
8楼2015-12-21 15:28:57
ljw4010
荣誉版主 (职业作家)
小木虫从头派教主
- 应助: 116 (高中生)
- 贵宾: 5.434
- 金币: 26571.7
- 散金: 4305
- 红花: 69
- 沙发: 10
- 帖子: 4104
- 在线: 889.1小时
- 虫号: 3019479
- 注册: 2014-03-05
- 专业: 半导体微纳机电器件与系统
- 管辖: 计算模拟
9楼2015-12-21 19:27:47
binarec
木虫 (小有名气)
- 应助: 5 (幼儿园)
- 金币: 3512.3
- 红花: 4
- 帖子: 167
- 在线: 171.7小时
- 虫号: 893268
- 注册: 2009-11-04
- 性别: GG
- 专业: 金属材料表面科学与工程
10楼2015-12-21 23:16:07