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zhangguangping木虫 (著名写手)
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【已解决】siesta-3.0-rc2中几何结构优化时DM的extrapolation问题 已有1人参与
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我使用的是siesta-3.0-rc2,做几何结构优化，在输入文件对SCF和MD做了如下设置： # SCF options DM.Tolerance 1.d-4 # Tolerance in maximum difference between input and output DM MaxSCFIterations 300 # Maximum number of SCF iter DM.UseSaveDM T # to use continuation files DM.MixingWeight 0.05 # New DM amount for next SCF cycle DM.NumberPulay 5 DM.MixSCF1 F DM.PulayOnFile F # Store in memory ('F') or in files ('T') # NeglNonOverlapInt T # 'F'=do not neglect SolutionMethod Diagon # OrderN or Diagon ElectronicTemperature 300 K # Temp. for Fermi smearing # MD options MD.TypeOfRun CG # Type of dynamics: MD.VariableCell F MD.NumCGsteps 300 # Number of CG steps for coordinate optimization ZM.UnitsLength Ang #the units of length used during Z-matrix input ZM.UnitsAngle deg #the units of angles used during Z-matrix input ZM.ForceTolLength 0.02 eV/Ang #controls the convergence with respect to forces on Z-matrix lengths ZM.ForceTolAngle 0.00356549 Ry/rad #controls the convergence with respect to forces on Z-matrix angles ZM.MaxDisplLength 0.1 Ang # controls the maximum change in a Zmatrix length during an optimisation step ZM.MaxDisplAngle 0.003 rad # controls the maximum change in a Z-matrix angle during an optimisation step ZM.CalcAllForces T # Default value 但是在计算的时候，为什么每一个 CG move的时候关于新的DM出现如下的输出： New_DM. Step: 5 Re-using DM from previous geometry... Re-using DM without extrapolation (not allowed) Density Matrix sparsity pattern changed. 为什么出现： Re-using DM without extrapolation (not allowed) 我没有限制进行外推啊？ 怎么设置能够进行外推呢？ 我使用3.0-b的时候正常的外推，同样的设置 New_DM. Step: 85 Re-using DM from previous geometry... Extrapolating Density Matrix... Density Matrix sparsity pattern changed. 请教高手！ [ Last edited by zzy870720z on 2010-12-3 at 20:28 ] |
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 siesta问题 |
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zhangguangping
木虫 (著名写手)
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zzy870720z(金币+2):谢谢总结，请标明已解决，谢谢合作 2010-12-03 17:53:38
zzy870720z(金币+2):谢谢总结，请标明已解决，谢谢合作 2010-12-03 17:53:38
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问题得到解决。虽然手册上关于DM.AllowReuse,DM.AllowExtrapolation 的设置默认都是true，但是在new_dm.F中写道： ! For "CG" calculations, the default is not to extrapolate the ! DM (unless requested by setting 'DM.AllowExtrapolation' to ! "true"  . The previous step's DM is reused.也就说当你的做CG方法的几何优化的时候，除非你明确写道 DM.AllowExtrapolation T 否则，对该方法这个选项为：F |
2楼2010-12-03 17:47:30