24小时热门版块排行榜    

Znn3bq.jpeg
查看: 3435  |  回复: 9
当前只显示满足指定条件的回帖,点击这里查看本话题的所有回帖

635585968

银虫 (正式写手)

[交流] 求教vasp中的PBS脚本如何实现循环? 已有4人参与

比如我想实现以下的循环,用PBS脚本提交任务的话,应该怎么编写?
新人,没金币,不好意思了
#!/bin/sh
rm WAVECAR
for i in 150 200 250 300 350 400
do
cat > INCAR <<!
SYSTEM = Si-Diamond
ENCUT = $i
ISTART = 0 ; ICHARG = 2
ISMEAR = -5
PREC = Accurate
!
echo "ENCUT = $i eV" ; time vasp
E=‘grep "TOTEN" OUTCAR | tail -1 | awk ’{printf "%12.6f \n", $5 }’‘
echo $i $E >>comment
done
回复此楼

» 猜你喜欢

已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

635585968

银虫 (正式写手)

引用回帖:
7楼: Originally posted by jiangph at 2015-12-16 09:58:00
PBS脚本不是shell脚本么?
这是我们用来测试K点的脚本,题主可以参考一下

#!/bin/bash
#PBS -N kpoints
#PBS -j oe
#PBS -l nodes=2:ppn=20
#PBS -l walltime=800:00:00
#PBS -q lhj

nprocs=`wc -l &l ...

谢了,我去算下
8楼2015-12-16 22:03:42
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
查看全部 10 个回答

afan0012

木虫 (小有名气)


小木虫: 金币+0.5, 给个红包,谢谢回帖
cat > INCAR <<!,这里我都是写成cat > INCAR <<EOF,不知道有什么区别。准备好输入文件,再加上qsub命令就可以了。比如cat INCAR 结束后,加上qsub job.pbs(即提交任务用的脚本)。
2楼2015-12-11 08:44:56
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

635585968

银虫 (正式写手)

引用回帖:
2楼: Originally posted by afan0012 at 2015-12-11 08:44:56
cat > INCAR <<!,这里我都是写成cat > INCAR <<EOF,不知道有什么区别。准备好输入文件,再加上qsub命令就可以了。比如cat INCAR 结束后,加上qsub job.pbs(即提交任务用的脚本)。

没太看懂,到底qsub job.pbs加在哪呢?
3楼2015-12-14 19:39:49
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

jiangph

铁虫 (正式写手)


小木虫: 金币+0.5, 给个红包,谢谢回帖
大致就是你写的这样,但是要加vasp运行的命令
手机回复,不方便添加我自己的脚本,如果有需要的话回头给你贴一个

发自小木虫IOS客户端
5楼2015-12-15 21:22:25
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
普通表情 高级回复 (可上传附件)
最具人气热帖推荐 [查看全部] 作者 回/看 最后发表
[考研] 化学070300 求调剂 +12 哈哈哈^_^ 2026-04-12 12/600 2026-04-12 22:08 by 独醉梦孤城
[考研] 一志愿085502,267分求调剂 +13 再忙也要吃饭啊 2026-04-08 14/700 2026-04-12 18:40 by laoshidan
[考研] 286求调剂 +26 Faune 2026-04-06 26/1300 2026-04-12 10:24 by lhj2009
[基金申请] 山东省基金2026 +5 jerry681 2026-04-08 6/300 2026-04-12 08:33 by kudofaye
[考研] 085404 293求调剂 +9 勇远库爱314 2026-04-08 9/450 2026-04-12 02:24 by 秋豆菜芽
[考研] 一志愿郑州大学 22408 305分求调剂 +5 安小满zzz 2026-04-08 5/250 2026-04-12 00:41 by 蓝云思雨
[考研] 考研求调剂 +3 ban班小七 2026-04-11 3/150 2026-04-11 20:48 by may_新宇
[考研] 求调剂 +3 胃痉挛累了 2026-04-11 5/250 2026-04-11 14:13 by luhong1990
[考研] 300分求调剂 (085501机械专硕,本科扬大) +8 xu@841019 2026-04-11 8/400 2026-04-11 10:46 by qingpingzhu
[考研] 本科211 工科085400 280分求调剂 可跨专业 +11 LZH(等待调剂中 2026-04-10 11/550 2026-04-11 08:39 by zhq0425
[考研] 中科院总分315求调剂 +8 lallalh 2026-04-09 8/400 2026-04-10 19:30 by dick_runner
[考研] 301求调剂 +5 149. 2026-04-10 5/250 2026-04-10 15:45 by 柴小白
[考研] 一志愿211 0703化学 346分求调剂 +22 土豆er? 2026-04-09 23/1150 2026-04-10 10:58 by 高维春
[考研] 08工学 309分求调剂 +6 Yin DY 2026-04-08 6/300 2026-04-10 09:18 by Delta2012
[考研] 生物学求调剂 一志愿沪9,326分 +7 刘墨墨 2026-04-06 7/350 2026-04-10 08:11 by kangsm
[考研] 求调剂 +13 柒luck 2026-04-07 13/650 2026-04-08 22:46 by 猪会飞
[考研] 材料考研求调剂总分280 +30 mkjlz1 2026-04-06 35/1750 2026-04-08 21:25 by cyh—315
[考研] 307求调剂 +14 超级伊昂大王 2026-04-06 14/700 2026-04-08 07:03 by 无际的草原
[考研] 11408 325分 +3 jgtxuxgkx 2026-04-07 3/150 2026-04-07 23:10 by lbsjt
[考研] 材料调剂 +13 汉123456 2026-04-07 14/700 2026-04-07 22:53 by 来看流星雨10
信息提示
请填处理意见