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求教vasp中的PBS脚本如何实现循环？ 已有4人参与
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比如我想实现以下的循环，用PBS脚本提交任务的话，应该怎么编写？ 新人，没金币，不好意思了  #!/bin/sh rm WAVECAR for i in 150 200 250 300 350 400 do cat > INCAR <<! SYSTEM = Si-Diamond ENCUT = $i ISTART = 0 ; ICHARG = 2 ISMEAR = -5 PREC = Accurate ! echo "ENCUT = $i eV" ; time vasp E=‘grep "TOTEN" OUTCAR | tail -1 | awk ’{printf "%12.6f \n", $5 }’‘ echo $i $E >>comment done |
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PBS脚本不是shell脚本么？ 这是我们用来测试K点的脚本，题主可以参考一下 #!/bin/bash #PBS -N kpoints #PBS -j oe #PBS -l nodes=2:ppn=20 #PBS -l walltime=800:00:00 #PBS -q lhj nprocs=`wc -l < $PBS_NODEFILE` cd $PBS_O_WORKDIR for i in 3 5 7 9 11 13 15 do cat >KPOINTS <<! auto generate 0 M $i $i 1 0 0 0 ! /public/intel/impi/4.1.0.024/intel64/bin/mpirun -np $nprocs ~/bin/vasp.5.3 E=`grep "entropy =" OUTCAR |tail -1| awk '{printf "%12.6f \n",$5}'` echo $i $E >>newkpoints rm WAVECAR CHG* done |
7楼2015-12-16 09:58:00
2楼2015-12-11 08:44:56
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jiangph
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5楼2015-12-15 21:22:25
