24小时热门版块排行榜    

查看: 3600  |  回复: 9
当前只显示满足指定条件的回帖,点击这里查看本话题的所有回帖

635585968

银虫 (正式写手)

[交流] 求教vasp中的PBS脚本如何实现循环? 已有4人参与

比如我想实现以下的循环,用PBS脚本提交任务的话,应该怎么编写?
新人,没金币,不好意思了
#!/bin/sh
rm WAVECAR
for i in 150 200 250 300 350 400
do
cat > INCAR <<!
SYSTEM = Si-Diamond
ENCUT = $i
ISTART = 0 ; ICHARG = 2
ISMEAR = -5
PREC = Accurate
!
echo "ENCUT = $i eV" ; time vasp
E=‘grep "TOTEN" OUTCAR | tail -1 | awk ’{printf "%12.6f \n", $5 }’‘
echo $i $E >>comment
done
回复此楼
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

635585968

银虫 (正式写手)

引用回帖:
5楼: Originally posted by jiangph at 2015-12-15 21:22:25
大致就是你写的这样,但是要加vasp运行的命令
手机回复,不方便添加我自己的脚本,如果有需要的话回头给你贴一个

不是啊,我这是sh的脚本,我们提交作业用的是PBS脚本
6楼2015-12-15 23:59:00
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
查看全部 10 个回答

afan0012

木虫 (小有名气)


小木虫: 金币+0.5, 给个红包,谢谢回帖
cat > INCAR <<!,这里我都是写成cat > INCAR <<EOF,不知道有什么区别。准备好输入文件,再加上qsub命令就可以了。比如cat INCAR 结束后,加上qsub job.pbs(即提交任务用的脚本)。
2楼2015-12-11 08:44:56
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

635585968

银虫 (正式写手)

引用回帖:
2楼: Originally posted by afan0012 at 2015-12-11 08:44:56
cat > INCAR <<!,这里我都是写成cat > INCAR <<EOF,不知道有什么区别。准备好输入文件,再加上qsub命令就可以了。比如cat INCAR 结束后,加上qsub job.pbs(即提交任务用的脚本)。

没太看懂,到底qsub job.pbs加在哪呢?
3楼2015-12-14 19:39:49
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

jiangph

铁虫 (正式写手)


小木虫: 金币+0.5, 给个红包,谢谢回帖
大致就是你写的这样,但是要加vasp运行的命令
手机回复,不方便添加我自己的脚本,如果有需要的话回头给你贴一个

发自小木虫IOS客户端
5楼2015-12-15 21:22:25
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
普通表情 高级回复 (可上传附件)
最具人气热帖推荐 [查看全部] 作者 回/看 最后发表
[硕博家园] 售SCI一区文章,我:8.O.55.1.O.54,科目齐全,可伽急 +3 ASdOkHsho7FD 2026-08-28 3/150 2026-08-29 03:03 by gy1nBQXYQJqL
[基金申请] 我就是申请一个面上项目而已,这评审意见是按照杰青的条件评的吧? +3 gouxfjh 2026-08-28 3/150 2026-08-29 01:01 by jurkat.1640
[基金申请] 国自然评审意见 +11 wangmingqi 2026-08-28 15/750 2026-08-29 00:17 by fangyl2005
[基金申请] 系统查不到 +11 董八千 2026-08-26 11/550 2026-08-28 18:06 by Leogzhya
[基金申请] 2026年叶企孙基金 +3 bud_bud 2026-08-27 6/300 2026-08-28 11:53 by bud_bud
[基金申请] 怎么查啊 +6 huang1991js 2026-08-26 6/300 2026-08-28 08:42 by winsaint
[基金申请] 哪位高人中了,把查询到的截图贴出来让我看看,让我长长见识 +5 yuleib84 2026-08-26 6/300 2026-08-28 00:02 by yudaoqian88
[基金申请] 看板上这么多中的,有点像50人群里49个人都是骗子的那种感觉…… +5 a089 2026-08-26 6/300 2026-08-27 14:05 by jonewore
[基金申请] 怎么看青基中了没有啊 +5 叶九微 2026-08-26 5/250 2026-08-27 10:35 by l_zh2008
[文学芳草园] 梦想 +3 myrtle 2026-08-26 3/150 2026-08-27 10:01 by angelyueyi
[基金申请] 范进中举一文的中心思想 +9 炎黄贵胄 2026-08-22 10/500 2026-08-26 15:40 by semaglutide
[基金申请] 2026年8月25日国自然放榜前突然收到列入评审专家邮件,有关系吗? +25 木水思豆 2026-08-25 28/1400 2026-08-26 14:53 by draco1987
[基金申请] 能否退出参与的面上项目解除限项 +23 koalala 2026-08-24 26/1300 2026-08-26 14:29 by 宝贝虫子
[基金申请] 出来了 +9 trojank 2026-08-26 9/450 2026-08-26 14:25 by 宝贝虫子
[基金申请] 为什么国自然不能直接公布 +4 bjdxyxy 2026-08-26 4/200 2026-08-26 13:12 by qingmu1201
[基金申请] 国合里面能看到了 +7 一怀馨秋 2026-08-26 7/350 2026-08-26 11:23 by zhaosm1982
[基金申请] 国合可查了 +3 paperzjh 2026-08-26 3/150 2026-08-26 10:41 by LemmonTr
[基金申请] 在坚冰还盖着北海的时候,我看到了怒放的梅花。 (金币+10) +6 ziyangfang 2026-08-25 9/450 2026-08-25 20:26 by huagongfeihu
[基金申请] 某些机构,以效率低为荣,以效率低作为存在感 +9 yuleib84 2026-08-25 10/500 2026-08-25 17:14 by alexon
[教师之家] 跳槽后在研项目怎么办? +5 简单化xn 2026-08-22 10/500 2026-08-23 12:38 by 简单化xn
信息提示
请填处理意见