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北京石油化工学院2026年研究生招生接收调剂公告
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lavwu

铜虫 (初入文坛)

[求助] 求助：关于氨基酸序列比对 已有2人参与

最近表达和纯化了一个酯酶，通过和其它菌的酯酶比对后发现有一个连续三个氨基酸同源的情况，这样是否能说明它们是同一族的酯酶啊？

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1楼 2015-12-04 18:24:45
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lavwu

铜虫 (初入文坛)
来人啊！!！

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2楼2015-12-04 21:59:25
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stone2239

铁杆木虫 (著名写手)

【答案】应助回帖

感谢参与，应助指数 +1
最好能贴个图上来，除了比对，还要看下是否有酯酶结构域。
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3楼2015-12-04 23:19:40
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lavwu

铜虫 (初入文坛)
引用回帖:
3楼: Originally posted by stone2239 at 2015-12-04 23:19:40
最好能贴个图上来，除了比对，还要看下是否有酯酶结构域。

像这样的，麻烦大神给分析一下，因为要写论文了，不知道怎么分析
求助：关于氨基酸序列比对
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    • 2015-12-05 13:52:01, 96.21 K
4楼2015-12-05 13:53:38
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lavwu

铜虫 (初入文坛)
引用回帖:
3楼: Originally posted by stone2239 at 2015-12-04 23:19:40
最好能贴个图上来，除了比对，还要看下是否有酯酶结构域。

对了，我分离的蛋白的保守区是202到最后，比对的那个蛋白的保守区是135到最后
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5楼2015-12-05 17:39:41
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stone2239

铁杆木虫 (著名写手)

【答案】应助回帖

感觉你比对的这两条序列相似性很低呀，你确定都是酯酶吗？从你比对的情况看，两条序列也没有类似的结构域，你用你的序列做过blastp比对吗？
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6楼2015-12-05 18:35:54
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lavwu

铜虫 (初入文坛)
引用回帖:
6楼: Originally posted by stone2239 at 2015-12-05 18:35:54
感觉你比对的这两条序列相似性很低呀，你确定都是酯酶吗？从你比对的情况看，两条序列也没有类似的结构域，你用你的序列做过blastp比对吗？

做过blast确定是酯酶

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7楼2015-12-06 11:36:57
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lavwu

铜虫 (初入文坛)
引用回帖:
6楼: Originally posted by stone2239 at 2015-12-05 18:35:54
感觉你比对的这两条序列相似性很低呀，你确定都是酯酶吗？从你比对的情况看，两条序列也没有类似的结构域，你用你的序列做过blastp比对吗？

比对了一下结构域相似性只有13.6%，还和其它几个酯水解酶比对了，都是差不多的结果，我都不知道怎么分析了

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8楼2015-12-06 12:09:33
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湖南戴鹏辉

新虫 (初入文坛)

【答案】应助回帖

直接用DNAMAN软件就能比对啊
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好好生活，好好工作
9楼2015-12-11 07:58:53
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