24小时热门版块排行榜    

北京石油化工学院2026年研究生招生接收调剂公告
查看: 1946  |  回复: 8

lavwu

铜虫 (初入文坛)

[求助] 求助:关于氨基酸序列比对 已有2人参与

最近表达和纯化了一个酯酶,通过和其它菌的酯酶比对后发现有一个连续三个氨基酸同源的情况,这样是否能说明它们是同一族的酯酶啊?

发自小木虫IOS客户端
回复此楼

» 猜你喜欢

» 本主题相关价值贴推荐,对您同样有帮助:

已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

lavwu

铜虫 (初入文坛)

2楼2015-12-04 21:59:25
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

stone2239

铁杆木虫 (著名写手)

【答案】应助回帖

感谢参与,应助指数 +1
最好能贴个图上来,除了比对,还要看下是否有酯酶结构域。
3楼2015-12-04 23:19:40
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

lavwu

铜虫 (初入文坛)

引用回帖:
3楼: Originally posted by stone2239 at 2015-12-04 23:19:40
最好能贴个图上来,除了比对,还要看下是否有酯酶结构域。

像这样的,麻烦大神给分析一下,因为要写论文了,不知道怎么分析
求助:关于氨基酸序列比对
pytz.gif

» 本帖附件资源列表

  • 欢迎监督和反馈:小木虫仅提供交流平台,不对该内容负责。
    本内容由用户自主发布,如果其内容涉及到知识产权问题,其责任在于用户本人,如对版权有异议,请联系邮箱:xiaomuchong@tal.com
  • 附件 1 : pytz.emf
  • 2015-12-05 13:52:01, 96.21 K
4楼2015-12-05 13:53:38
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

lavwu

铜虫 (初入文坛)

引用回帖:
3楼: Originally posted by stone2239 at 2015-12-04 23:19:40
最好能贴个图上来,除了比对,还要看下是否有酯酶结构域。

对了,我分离的蛋白的保守区是202到最后,比对的那个蛋白的保守区是135到最后
5楼2015-12-05 17:39:41
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

stone2239

铁杆木虫 (著名写手)

【答案】应助回帖

感觉你比对的这两条序列相似性很低呀,你确定都是酯酶吗?从你比对的情况看,两条序列也没有类似的结构域,你用你的序列做过blastp比对吗?
6楼2015-12-05 18:35:54
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

lavwu

铜虫 (初入文坛)

引用回帖:
6楼: Originally posted by stone2239 at 2015-12-05 18:35:54
感觉你比对的这两条序列相似性很低呀,你确定都是酯酶吗?从你比对的情况看,两条序列也没有类似的结构域,你用你的序列做过blastp比对吗?

做过blast确定是酯酶

发自小木虫IOS客户端
7楼2015-12-06 11:36:57
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

lavwu

铜虫 (初入文坛)

引用回帖:
6楼: Originally posted by stone2239 at 2015-12-05 18:35:54
感觉你比对的这两条序列相似性很低呀,你确定都是酯酶吗?从你比对的情况看,两条序列也没有类似的结构域,你用你的序列做过blastp比对吗?

比对了一下结构域相似性只有13.6%,还和其它几个酯水解酶比对了,都是差不多的结果,我都不知道怎么分析了

发自小木虫IOS客户端
8楼2015-12-06 12:09:33
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

湖南戴鹏辉

新虫 (初入文坛)

【答案】应助回帖

直接用DNAMAN软件就能比对啊
好好生活,好好工作
9楼2015-12-11 07:58:53
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
相关版块跳转 我要订阅楼主 lavwu 的主题更新
最具人气热帖推荐 [查看全部] 作者 回/看 最后发表
[考研] 一志愿双非085502,267分,过四级求调剂 +3 再忙也要吃饭啊 2026-04-03 3/150 2026-04-04 05:03 by gswylq
[考研] 一志愿085404,总分291,四级已过,求调剂 +3 阿俊阿俊阿俊 2026-04-04 4/200 2026-04-04 04:58 by gswylq
[考研] 305求调剂 +3 77Qi 2026-04-03 3/150 2026-04-03 23:01 by qzxyhcsy
[考研] 344材料与化工调剂 +8 调剂上岸玘 2026-04-03 8/400 2026-04-03 21:38 by Demonsssss
[考研] 321求调剂 +3 认真求上学 2026-04-03 3/150 2026-04-03 21:12 by 科研小专家
[考研] 22408,264求调剂 +3 ywh729 2026-04-03 3/150 2026-04-03 20:50 by zhq0425
[考研] 材料与化工306分找调剂 +22 沧海轻舟e 2026-04-02 23/1150 2026-04-03 15:08 by hypershenger
[考研] 333求调剂 +9 wfh030413@ 2026-04-03 9/450 2026-04-03 14:20 by 啊俊!
[考研] 11408,284分,二战真诚求调剂 +4 12.27 2026-04-02 4/200 2026-04-03 14:14 by dxiaoxin
[考研] 368求调剂 +4 今华习 2026-04-03 6/300 2026-04-03 13:46 by 今华习
[考研] 282求调剂 +5 呼吸都是减肥 2026-03-31 5/250 2026-04-03 12:03 by 1753564080
[考研] 081200-11408-276学硕求调剂 +6 崔wj 2026-04-02 6/300 2026-04-03 10:19 by 蓝云思雨
[考研] 交通运输考试264分求工科调剂 +4 jike777 2026-04-02 4/200 2026-04-02 21:53 by zllcz
[考研] +4 雾与海 2026-04-02 5/250 2026-04-02 19:16 by 土木硕士招生
[考研] 一志愿北京科技大学085601材料工程英一数二初试总分335求调剂 +8 双马尾痞老板2 2026-04-02 9/450 2026-04-02 14:45 by 5896
[考研] 290求调剂 +5 dfffsar 2026-03-29 5/250 2026-04-01 19:45 by 6781022
[考研] 求0861交通运输专硕or材料专硕调剂 +4 勒布朗@ 2026-03-31 4/200 2026-04-01 09:54 by 一只好果子?
[考研] 物理学调剂 +4 小羊36 2026-03-30 4/200 2026-03-31 16:16 by lishahe
[考研] 293分求调剂,外语为俄语 +5 加一一九 2026-03-31 5/250 2026-03-31 09:39 by zhshch
[考研] 291求调剂 +5 Y-cap 2026-03-29 6/300 2026-03-29 13:18 by mumin1990
信息提示
请填处理意见