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upgo123金虫 (小有名气)
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[求助]
关于DNAMAN点矩阵序列比对的问题,小菜来求助,寻帮忙!谢啦!已有1人参与
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我用DNAMAN软件,在点矩阵比对两序列,且进行双链比对时,黑色点表示Sequence 2正链与Sequence 1比对结果,红色点表示Sequence 2负链与Sequence 1比对结果。 如图,两序列的点矩阵比对结果图,请问我的结果说明了什么信息?怎么黑的红的呈垂直分布?怎么看?另外,在什么时候用“点矩阵比对”呢? 请大侠们不吝赐教,非常感谢! 点矩阵比较结果图.PNG |
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upgo123
金虫 (小有名气)
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5楼2015-12-04 23:51:17
【答案】应助回帖
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感谢参与,应助指数 +1
upgo123: 金币+30, ★★★★★最佳答案, 非常感谢! 2015-12-05 08:54:35
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X轴Y轴分别代表序列1、2,黑色小线代表的是保留序列(相同序列),红色线代表的是反向序列(序列反向相同) 发自小木虫Android客户端 |
2楼2015-12-04 11:53:07
upgo123
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3楼2015-12-04 13:48:52
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对角线也是相同序列,如果序列1和2完全相同的话,对角线对从0至结束完全对角。相同的功能有个网页工具叫Jdottor,这个比较好用,但是需要简单注册和下载Java,当你把鼠标指针对着序列的时候会显示序列位置,这样你就可以知道那些黑色线和红色的具体起止点了。 发自小木虫Android客户端 |
4楼2015-12-04 20:04:05













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