应《网络安全法》要求，自2017年10月1日起，未进行实名认证将不得使用互联网跟帖服务。为保障您的帐号能够正常使用，请尽快对帐号进行手机号验证，感谢您的理解与支持！

24小时热门版块排行榜    

小木虫论坛-学术科研互动平台 » 生物医药区 » 分子生物 » 生物信息 » 关于DNAMAN点矩阵序列比对的问题，小菜来求助，寻帮忙！谢啦！
北京石油化工学院2026年研究生招生接收调剂公告
51/1返回列表
查看: 1763  |  回复: 5
只看楼主 @他人 存档 新回复提醒 (忽略) 收藏    在APP中查看
当前只显示满足指定条件的回帖，点击这里查看本话题的所有回帖

upgo123

金虫 (小有名气)

[求助] 关于DNAMAN点矩阵序列比对的问题，小菜来求助，寻帮忙！谢啦！ 已有1人参与

我用DNAMAN软件，在点矩阵比对两序列，且进行双链比对时，黑色点表示Sequence 2正链与Sequence 1比对结果，红色点表示Sequence 2负链与Sequence 1比对结果。
如图，两序列的点矩阵比对结果图，请问我的结果说明了什么信息？怎么黑的红的呈垂直分布？怎么看？另外，在什么时候用“点矩阵比对”呢？
请大侠们不吝赐教，非常感谢！

关于DNAMAN点矩阵序列比对的问题，小菜来求助，寻帮忙！谢啦！
点矩阵比较结果图.PNG
回复此楼

» 猜你喜欢
选择，然后坚持
1楼 2015-12-04 11:37:54
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

hanfusu

新虫 (初入文坛)
引用回帖:
3楼: Originally posted by upgo123 at 2015-12-04 13:48:52
如果黑色小线代表的是保留序列（相同序列），那么从哪儿能读出他的信息，比如序列长度、包含的碱基之类的？还有，那条较长的对角线也表示相同序列吗？
有没有相关的文章介绍？谢谢！...

对角线也是相同序列，如果序列1和2完全相同的话，对角线对从0至结束完全对角。相同的功能有个网页工具叫Jdottor，这个比较好用，但是需要简单注册和下载Java，当你把鼠标指针对着序列的时候会显示序列位置，这样你就可以知道那些黑色线和红色的具体起止点了。

发自小木虫Android客户端
赞一下 回复此楼
4楼2015-12-04 20:04:05
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
查看全部 6 个回答

hanfusu

新虫 (初入文坛)

【答案】应助回帖

★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★
感谢参与，应助指数 +1
upgo123: 金币+30, ★★★★★最佳答案, 非常感谢！ 2015-12-05 08:54:35
X轴Y轴分别代表序列1、2，黑色小线代表的是保留序列（相同序列），红色线代表的是反向序列（序列反向相同）

发自小木虫Android客户端
赞一下 回复此楼
2楼2015-12-04 11:53:07
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

upgo123

金虫 (小有名气)
引用回帖:
2楼: Originally posted by hanfusu at 2015-12-04 11:53:07
X轴Y轴分别代表序列1、2，黑色小线代表的是保留序列（相同序列），红色线代表的是反向序列（序列反向相同）

如果黑色小线代表的是保留序列（相同序列），那么从哪儿能读出他的信息，比如序列长度、包含的碱基之类的？还有，那条较长的对角线也表示相同序列吗？
有没有相关的文章介绍？谢谢！
赞一下 回复此楼
选择，然后坚持
3楼2015-12-04 13:48:52
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

upgo123

金虫 (小有名气)
引用回帖:
4楼: Originally posted by hanfusu at 2015-12-04 20:04:05
对角线也是相同序列，如果序列1和2完全相同的话，对角线对从0至结束完全对角。相同的功能有个网页工具叫Jdottor，这个比较好用，但是需要简单注册和下载Java，当你把鼠标指针对着序列的时候会显示序列位置，这样你 ...

会不会有时候，或着在某些地方，某种文章报道中 特别要求 用点矩阵比对 对两序列进行分析的情况呢？谢谢！
赞一下 回复此楼
选择，然后坚持
5楼2015-12-04 23:51:17
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
查看全部 6 个回答
普通表情 龙 兔 虎 猫
最具人气热帖推荐 [查看全部] 作者 回/看 最后发表
[考研] 085600 295分求调剂 +16 W55j 2026-03-30 20/1000 2026-04-02 22:22 by chran16
[考研] 环境科学与工程334分求调剂 +7 王一一依依 2026-03-30 9/450 2026-04-02 21:15 by 1104338198
[考研] 085602化工求调剂（331分） +9 111@127 2026-03-30 9/450 2026-04-02 20:00 by dick_runner
[考研] 265求调剂 +12 林深温澜 2026-04-01 15/750 2026-04-02 19:14 by 一只好果子?
[考研] 一志愿厦门大学材料工程专硕354找调剂！！！ +7 贝呗钡钡 2026-03-30 7/350 2026-04-02 12:19 by 1753564080
[考研] 材料工程322分 +8 哈哈哈吼吼吼哈 2026-04-01 8/400 2026-04-02 11:53 by 3041
[考研] 一志愿北交大材料工程总分358 +3 cs0106 2026-04-02 5/250 2026-04-02 11:37 by olim
[考研] 085600，材料与化工321分，求调剂 +13 大馋小子 2026-03-27 13/650 2026-04-02 10:48 by sanrepian
[考研] 【求调剂】085601材料工程专硕 | 总分272 | +10 脚滑的守法公民 2026-03-27 10/500 2026-04-01 17:23 by pies112
[考研] 070300化学专业279调剂 +10 哈哈哈^_^ 2026-03-31 10/500 2026-03-31 23:13 by liu823948201
[考研] 求调剂 生物学 377分 +6 zzll03 2026-03-31 6/300 2026-03-31 17:33 by 唐沐儿
[考研] 材料工程专硕求调剂 +10 hyl3153942 2026-03-29 10/500 2026-03-31 16:31 by hypershenger
[考研] 求调剂 +8 11ggg 2026-03-30 8/400 2026-03-31 13:56 by nanaliuyun
[考研] 370求调剂 +3 080700调剂 2026-03-30 3/150 2026-03-31 01:09 by A_Zhe
[考研] 083000环境科学与工程调剂，总分281 +4 橙子（胜意） 2026-03-30 4/200 2026-03-31 00:44 by Linzejun
[考研] 322求调剂 +10 宋明欣 2026-03-27 10/500 2026-03-30 18:47 by 544594351
[考研] 材料专硕 085600求调剂 +7 BBQ233 2026-03-30 7/350 2026-03-30 17:44 by oooqiao
[考研] 一志愿中南大学化学0703总分337求调剂 +6 niko- 2026-03-27 6/300 2026-03-30 10:25 by herarysara
[考研] 求调剂 +7 争取九点睡 2026-03-28 8/400 2026-03-28 21:07 by 争取九点睡
[考研] 283求调剂 +3 A child 2026-03-28 3/150 2026-03-28 15:41 by ms629
信息提示
关闭
请填处理意见
关闭