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upgo123金虫 (小有名气)
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[求助]
关于DNAMAN点矩阵序列比对的问题，小菜来求助，寻帮忙！谢啦！ 已有1人参与
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我用DNAMAN软件，在点矩阵比对两序列，且进行双链比对时，黑色点表示Sequence 2正链与Sequence 1比对结果，红色点表示Sequence 2负链与Sequence 1比对结果。 如图，两序列的点矩阵比对结果图，请问我的结果说明了什么信息？怎么黑的红的呈垂直分布？怎么看？另外，在什么时候用“点矩阵比对”呢？ 请大侠们不吝赐教，非常感谢！  点矩阵比较结果图.PNG |
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【答案】应助回帖
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X轴Y轴分别代表序列1、2，黑色小线代表的是保留序列（相同序列），红色线代表的是反向序列（序列反向相同） 发自小木虫Android客户端 |
2楼2015-12-04 11:53:07
upgo123
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3楼2015-12-04 13:48:52
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对角线也是相同序列，如果序列1和2完全相同的话，对角线对从0至结束完全对角。相同的功能有个网页工具叫Jdottor，这个比较好用，但是需要简单注册和下载Java，当你把鼠标指针对着序列的时候会显示序列位置，这样你就可以知道那些黑色线和红色的具体起止点了。 发自小木虫Android客户端 |
4楼2015-12-04 20:04:05
upgo123
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5楼2015-12-04 23:51:17
6楼2015-12-05 07:00:31