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汕头大学海洋科学接受调剂
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小周zj123

新虫 (初入文坛)

[求助] MS分子晶体结构优化 已有1人参与

各位大神,小弟想请教一下如何能够将构建的有机分子直接拉进一个晶格内,请大神们指点。多谢了。
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橙子学术

银虫 (小有名气)

引用回帖:
18楼: Originally posted by hnurenkui at 2015-11-24 21:40:54
我上面写的很清楚了,只能帮楼主到这了……

你好,还是麻烦你看一下指出问题哈
1,建立一个空的晶胞。build.......crystals......build crystals......选默认1p1 ...build.....即为一个没有任何对称性的盒子。 然后把你的碳纳米管放进去,调整相对大小和位置。
2,建立一个碳纳米管。build......Nanostructure.......build single-wall Nanostructure,如下图
3,左键拉动全选生成的碳纳米管,复制。激活空晶胞,黏贴,然后就出现了四个对称分布的碳纳米管,我一直没选四个啊

还有一个问题,为什么选中一个删掉,结果都删了呢,也如下图?

还望告知,感谢感谢!
MS分子晶体结构优化
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MS分子晶体结构优化-1
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20楼2015-11-24 22:02:24
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查看全部 22 个回答

hnurenkui

木虫 (正式写手)

【答案】应助回帖

感谢参与,应助指数 +1
没太看懂你的问题,是想计算分子的大小,还是要计算有机分子与金属之间的相互作用。如果是计算分子大小,就先构建一个盒子,然后把有机物分子复制过去。操作上一般是选中有机物分子,然后按住ctrl和shift,鼠标右键移动;按住shift,鼠标右键旋转分子。相互作用的话就几何优化然后计算能量的变化。
难的不是事情本身,而是开始行动的勇气!
2楼2015-11-23 23:02:01
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橙子学术

银虫 (小有名气)

引用回帖:
2楼: Originally posted by hnurenkui at 2015-11-23 23:02:01
没太看懂你的问题,是想计算分子的大小,还是要计算有机分子与金属之间的相互作用。如果是计算分子大小,就先构建一个盒子,然后把有机物分子复制过去。操作上一般是选中有机物分子,然后按住ctrl和shift,鼠标右键 ...

你好,怎么建一个空盒子呢,我再建碳纳米管的时候没有出现盒子,不知道怎么给它田间一个盒子?谢谢
3楼2015-11-24 10:57:51
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橙子学术

银虫 (小有名气)

引用回帖:
2楼: Originally posted by hnurenkui at 2015-11-23 23:02:01
没太看懂你的问题,是想计算分子的大小,还是要计算有机分子与金属之间的相互作用。如果是计算分子大小,就先构建一个盒子,然后把有机物分子复制过去。操作上一般是选中有机物分子,然后按住ctrl和shift,鼠标右键 ...

你好,怎么建一个空盒子呢,我在建碳纳米管的时候没有出现盒子,不知道怎么给它添加一个盒子?谢谢
4楼2015-11-24 10:58:54
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