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小周zj123

新虫 (初入文坛)

[求助] MS分子晶体结构优化 已有1人参与

各位大神，小弟想请教一下如何能够将构建的有机分子直接拉进一个晶格内，请大神们指点。多谢了。
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1楼 2015-11-23 22:40:18
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橙子学术

银虫 (小有名气)
引用回帖:
18楼: Originally posted by hnurenkui at 2015-11-24 21:40:54
我上面写的很清楚了，只能帮楼主到这了……

你好，还是麻烦你看一下指出问题哈
1，建立一个空的晶胞。build.......crystals......build crystals......选默认1p1 ...build.....即为一个没有任何对称性的盒子。 然后把你的碳纳米管放进去，调整相对大小和位置。
2，建立一个碳纳米管。build......Nanostructure.......build single-wall Nanostructure，如下图
3，左键拉动全选生成的碳纳米管，复制。激活空晶胞，黏贴，然后就出现了四个对称分布的碳纳米管，我一直没选四个啊

还有一个问题，为什么选中一个删掉，结果都删了呢，也如下图？

还望告知，感谢感谢！
MS分子晶体结构优化
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MS分子晶体结构优化-1
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20楼2015-11-24 22:02:24
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hnurenkui

木虫 (正式写手)

【答案】应助回帖

感谢参与，应助指数 +1
没太看懂你的问题，是想计算分子的大小，还是要计算有机分子与金属之间的相互作用。如果是计算分子大小，就先构建一个盒子，然后把有机物分子复制过去。操作上一般是选中有机物分子，然后按住ctrl和shift，鼠标右键移动；按住shift，鼠标右键旋转分子。相互作用的话就几何优化然后计算能量的变化。
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难的不是事情本身，而是开始行动的勇气！
2楼2015-11-23 23:02:01
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橙子学术

银虫 (小有名气)
引用回帖:
2楼: Originally posted by hnurenkui at 2015-11-23 23:02:01
没太看懂你的问题，是想计算分子的大小，还是要计算有机分子与金属之间的相互作用。如果是计算分子大小，就先构建一个盒子，然后把有机物分子复制过去。操作上一般是选中有机物分子，然后按住ctrl和shift，鼠标右键 ...

你好，怎么建一个空盒子呢，我再建碳纳米管的时候没有出现盒子，不知道怎么给它田间一个盒子？谢谢
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3楼2015-11-24 10:57:51
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橙子学术

银虫 (小有名气)
引用回帖:
2楼: Originally posted by hnurenkui at 2015-11-23 23:02:01
没太看懂你的问题，是想计算分子的大小，还是要计算有机分子与金属之间的相互作用。如果是计算分子大小，就先构建一个盒子，然后把有机物分子复制过去。操作上一般是选中有机物分子，然后按住ctrl和shift，鼠标右键 ...

你好，怎么建一个空盒子呢，我在建碳纳米管的时候没有出现盒子，不知道怎么给它添加一个盒子？谢谢
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4楼2015-11-24 10:58:54
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