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heihei2866铁虫 (正式写手)
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基因组测序结果提交NCBI的困惑 已有1人参与
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| 各位大神，本人前期委托公司对一个细菌的基因组进行了测序，想在genome announcement上发表一个小文章，但是前提是要公布基因组，在提交的过程中遇到了几个问题，1. 是否需要在SRA提交原始数据？2. 我拿到的数据是拼接到scaffold的，论文里面也提到了scaffold，我现在只想提交contig，可以吗？因为公司没有提供AGP文件，我无法将contig和scaffold对应；3. 是否必须要提交基因组注释文件，要是提供的话需要转化成sqn吗？怎么转化啊？本人纯外行一个，所以问题比较多，希望高手能提供帮助，不胜感激啊 |
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我去年提交的部分全基因组序列。序列可以提交至ncbi，我采用的在线提交，未提交的原始序列，可以仅仅提交contig。可以不注释。 发自小木虫Android客户端 |
4楼2015-11-20 02:42:11
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就是提取了出来，然后去跑液相，用乙腈:水15:85跑出来比较好的峰形，有大概八个峰，然后用凝胶柱接了100瓶，可是只在32瓶得到了比较纯的亚油酸，不是我需要的活性产物，我现在就想知道里面有哪些东西，大神有办法吗？ 发自小木虫Android客户端 |
8楼2015-11-20 09:29:12
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液质联用还没做，可是做了好像也只知道分子量，制备色谱上只有一个峰，不知道是不是我们这边的制备色谱坏了，亚油酸是过凝胶柱分离出来了单体做ei鉴定出来的，可是过凝胶柱其他的样都是混合的，无法鉴别啊！ 发自小木虫Android客户端 |
10楼2015-11-20 14:47:03