应《网络安全法》要求，自2017年10月1日起，未进行实名认证将不得使用互联网跟帖服务。为保障您的帐号能够正常使用，请尽快对帐号进行手机号验证，感谢您的理解与支持！

24小时热门版块排行榜    

小木虫论坛-学术科研互动平台 » 生物医药区 » 分子生物 » 生物信息 » 基因组测序结果提交NCBI的困惑
51/1返回列表
查看: 4680  |  回复: 12
只看楼主 @他人 存档 新回复提醒 (忽略) 收藏    在APP中查看
当前只显示满足指定条件的回帖，点击这里查看本话题的所有回帖

heihei2866

铁虫 (正式写手)

[求助] 基因组测序结果提交NCBI的困惑 已有1人参与

各位大神，本人前期委托公司对一个细菌的基因组进行了测序，想在genome announcement上发表一个小文章，但是前提是要公布基因组，在提交的过程中遇到了几个问题，1. 是否需要在SRA提交原始数据？2. 我拿到的数据是拼接到scaffold的，论文里面也提到了scaffold，我现在只想提交contig，可以吗？因为公司没有提供AGP文件，我无法将contig和scaffold对应；3. 是否必须要提交基因组注释文件，要是提供的话需要转化成sqn吗？怎么转化啊？本人纯外行一个，所以问题比较多，希望高手能提供帮助，不胜感激啊
回复此楼

» 猜你喜欢

» 本主题相关价值贴推荐，对您同样有帮助:
1楼 2015-11-19 09:29:12
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

dsrocean

木虫 (小有名气)

【答案】应助回帖

★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★
感谢参与，应助指数 +1
heihei2866: 金币+50, ★★★★★最佳答案 2015-12-23 17:31:25
我去年提交的部分全基因组序列。序列可以提交至ncbi，我采用的在线提交，未提交的原始序列，可以仅仅提交contig。可以不注释。

发自小木虫Android客户端
赞一下(1人) 回复此楼
4楼2015-11-20 02:42:11
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
查看全部 13 个回答

y3211512

银虫 (初入文坛)
大神你好，我看您去年发布了一个求未知化合物分离和结构鉴定的帖子，请问你后来是否解决问题了呢，我最近也在做这个，也是一个微生物的天然产物，做了很久没做出来，想请教一下你！！
赞一下 回复此楼
新人求教
2楼2015-11-19 11:35:03
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

heihei2866

铁虫 (正式写手)
引用回帖:
2楼: Originally posted by y3211512 at 2015-11-19 11:35:03
大神你好，我看您去年发布了一个求未知化合物分离和结构鉴定的帖子，请问你后来是否解决问题了呢，我最近也在做这个，也是一个微生物的天然产物，做了很久没做出来，想请教一下你！！

嘿嘿，我们实验室后来来了位做分离和结构鉴定的专家，他帮我把问题解决了
赞一下 回复此楼
3楼2015-11-19 20:40:35
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

y3211512

银虫 (初入文坛)
引用回帖:
3楼: Originally posted by heihei2866 at 2015-11-19 20:40:35
嘿嘿，我们实验室后来来了位做分离和结构鉴定的专家，他帮我把问题解决了...

那能不能大概给我说下是怎么做的啊。。因为我现在也卡在这一块好久了。。做不出来啊！大神，拜托你了！救命啊！

发自小木虫Android客户端
赞一下 回复此楼
新人求教
5楼2015-11-20 08:34:02
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
查看全部 13 个回答
普通表情 龙 兔 虎 猫
最具人气热帖推荐 [查看全部] 作者 回/看 最后发表
[公派出国] 售SCI一区T0P文章，我:8O.55.1.O.5.4,科目齐全,可+急 +3 vZfe6xYu34yj 2026-09-14 3/150 2026-09-18 02:30 by cITaGg3p5edr
[考博] 售SCI一区T0P文章，我:8.O.55.1.O.5.4,科目全,可+急 +3 Aj1rhIDL5ixY 2026-09-14 3/150 2026-09-18 01:40 by cITaGg3p5edr
[考研] 售SCI一区T0P文章，我:8.O.55.1.O.5.4,科目全,可+急 +3 6F5UbRU2I5hL 2026-09-14 3/150 2026-09-18 00:28 by cITaGg3p5edr
[考研] 售SCI文章，我:8O5.5.1.O.54,科目齐全,可+急 +8 LwdutQ8HoqWP 2026-09-13 8/400 2026-09-17 22:53 by cuPZTDXS3VOd
[硕博家园] 售SCI-T0P文章，我:8O.5.5.1.O.54,科目齐全,可+急 +6 3n8v2C8RimXI 2026-09-13 6/300 2026-09-17 22:29 by cuPZTDXS3VOd
[硕博家园] 售SCI一区文章，我:8.O.55.1.O.54,科目齐全,可伽急 +6 40ms4Wlo4umh 2026-09-14 6/300 2026-09-17 13:53 by ObVzqQQh1rrE
[考研] 售SCI一区文章，我:8O5.5.1.O5.4,科目全,可伽急 +5 23jxep3nCNZb 2026-09-14 5/250 2026-09-17 13:29 by ObVzqQQh1rrE
[公派出国] 售SCI文章，我:8O5.5.1.O.54,科目齐全,可+急 +5 6F5UbRU2I5hL 2026-09-14 5/250 2026-09-17 13:17 by ObVzqQQh1rrE
[找工作] 售SCI一区T0P文章，我:8.O.55.1.O54,科目全,可伽急 +5 s3fFTmArrBt6 2026-09-14 6/300 2026-09-17 12:29 by ObVzqQQh1rrE
[考研] 售SCI一区T0P文章，我:8.O55.1.O.54,科目全,可十急 +4 Aj1rhIDL5ixY 2026-09-14 4/200 2026-09-17 04:52 by k06BKNblrGRH
[找工作] 售SCI一区T0P文章，我:8.O.55.1.O.5.4,科目全,可+急 +4 40ms4Wlo4umh 2026-09-14 4/200 2026-09-17 04:28 by k06BKNblrGRH
[公派出国] 售SCI文章，我:8O5.5.1.O.54,科目齐全,可+急 +3 23jxep3nCNZb 2026-09-14 3/150 2026-09-17 03:52 by k06BKNblrGRH
[找工作] 售SCI一区T0P文章，我:8.O.55.1.O54,科目全,可伽急 +6 s3fFTmArrBt6 2026-09-13 6/300 2026-09-17 02:14 by Tql5LQhh5rLK
[公派出国] 售SCI-T0P文章，我:8O.5.5.1.O.54,科目齐全,可+急 +4 LwdutQ8HoqWP 2026-09-13 7/350 2026-09-17 02:02 by Tql5LQhh5rLK
[考研] 售SCI一区文章，我:8.O.551.O.5.4,科目全,可伽急 +7 QUjhNVAcOSff 2026-09-13 8/400 2026-09-17 01:16 by Tql5LQhh5rLK
[公派出国] 售SCI一区T0P文章，我:8O.55.1.O.5.4,科目齐全,可+急 +3 6F5UbRU2I5hL 2026-09-14 3/150 2026-09-16 17:12 by i3KBRD19ERkG
[考研] 售SCI文章，我:8O5.5.1.O.54,科目齐全,可+急 +4 40ms4Wlo4umh 2026-09-14 4/200 2026-09-16 06:36 by LH5NkK5Ud4bh
[硕博家园] 售SCI一区T0P文章，我:8.O55.1.O.54,科目全,可十急 +5 s3fFTmArrBt6 2026-09-14 5/250 2026-09-15 16:35 by CgyNCDVNhGVg
[硕博家园] 售SCI一区T0P文章，我:8.O.55.1.O.5.4,科目全,可+急 +4 6F5UbRU2I5hL 2026-09-14 4/200 2026-09-15 08:02 by C79jjtjAKjEn
[教师之家] 售SCI一区T0P文章，我:8O.55.1.O.54,科目全,可伽急 +4 6F5UbRU2I5hL 2026-09-14 4/200 2026-09-15 07:50 by C79jjtjAKjEn
信息提示
关闭
请填处理意见
关闭