| 查看: 4451 | 回复: 12 | |||
| 当前只显示满足指定条件的回帖，点击这里查看本话题的所有回帖 | |||
heihei2866铁虫 (正式写手)
|
[求助]
基因组测序结果提交NCBI的困惑 已有1人参与
|
||
| 各位大神，本人前期委托公司对一个细菌的基因组进行了测序，想在genome announcement上发表一个小文章，但是前提是要公布基因组，在提交的过程中遇到了几个问题，1. 是否需要在SRA提交原始数据？2. 我拿到的数据是拼接到scaffold的，论文里面也提到了scaffold，我现在只想提交contig，可以吗？因为公司没有提供AGP文件，我无法将contig和scaffold对应；3. 是否必须要提交基因组注释文件，要是提供的话需要转化成sqn吗？怎么转化啊？本人纯外行一个，所以问题比较多，希望高手能提供帮助，不胜感激啊 |
回复此楼» 猜你喜欢
蛋白质检测：精准分析，解锁生物分子的密码
已经有0人回复
-
不合理蛙科研实验之小鼠实验：严谨设计，解析生命机制的重要载体
已经有0人回复
-
化学工程及工业化学论文润色/翻译怎么收费?
已经有270人回复
-
不合理蛙科研实验之重金属检测：精准筛查，守护健康与环境的防线
已经有0人回复
-
不合理蛙科研实验之“蛙测重金属我背锅三千”
已经有0人回复
-
不合理蛙科研实验之“鼠逃三次我发三篇SCI”
已经有0人回复
-
纳米粒度分析
已经有3人回复
-
林科院林化所招收材料与化工专业硕士，坐标南京
已经有0人回复
-
留学--博士招生
已经有14人回复
-
化学工程，本211，求调剂，ab区不限
已经有4人回复
» 本主题相关价值贴推荐，对您同样有帮助:
dsrocean
木虫 (小有名气)
- 应助: 4 (幼儿园)
- 金币: 2398.7
- 散金: 30
- 帖子: 88
- 在线: 97.5小时
- 虫号: 2292064
- 注册: 2013-02-21
- 性别: GG
- 专业: 微生物资源与分类学
【答案】应助回帖
★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★
感谢参与，应助指数 +1
heihei2866: 金币+50, ★★★★★最佳答案 2015-12-23 17:31:25
感谢参与，应助指数 +1
heihei2866: 金币+50, ★★★★★最佳答案 2015-12-23 17:31:25
|
我去年提交的部分全基因组序列。序列可以提交至ncbi，我采用的在线提交，未提交的原始序列，可以仅仅提交contig。可以不注释。 发自小木虫Android客户端 |
4楼2015-11-20 02:42:11
y3211512
银虫 (初入文坛)
- 应助: 0 (幼儿园)
- 金币: 329.5
- 散金: 66
- 帖子: 21
- 在线: 8.9小时
- 虫号: 3763686
- 注册: 2015-03-25
- 性别: GG
- 专业: 微生物资源与分类学
2楼2015-11-19 11:35:03
heihei2866
铁虫 (正式写手)
- 应助: 0 (幼儿园)
- 金币: 200.9
- 散金: 541
- 红花: 2
- 帖子: 396
- 在线: 87.7小时
- 虫号: 401586
- 注册: 2007-06-13
- 性别: MM
- 专业: 生物大分子结构与功能
3楼2015-11-19 20:40:35
y3211512
银虫 (初入文坛)
- 应助: 0 (幼儿园)
- 金币: 329.5
- 散金: 66
- 帖子: 21
- 在线: 8.9小时
- 虫号: 3763686
- 注册: 2015-03-25
- 性别: GG
- 专业: 微生物资源与分类学
5楼2015-11-20 08:34:02
