| 查看: 4610 | 回复: 12 | ||
heihei2866铁虫 (正式写手)
|
[求助]
基因组测序结果提交NCBI的困惑 已有1人参与
|
|
| 各位大神，本人前期委托公司对一个细菌的基因组进行了测序，想在genome announcement上发表一个小文章，但是前提是要公布基因组，在提交的过程中遇到了几个问题，1. 是否需要在SRA提交原始数据？2. 我拿到的数据是拼接到scaffold的，论文里面也提到了scaffold，我现在只想提交contig，可以吗？因为公司没有提供AGP文件，我无法将contig和scaffold对应；3. 是否必须要提交基因组注释文件，要是提供的话需要转化成sqn吗？怎么转化啊？本人纯外行一个，所以问题比较多，希望高手能提供帮助，不胜感激啊 |
回复此楼» 猜你喜欢
含氟糖皮质激素的外用抗炎利器醋酸氟轻松
已经有0人回复
-
阿莫奈韦（Amenamevir）：解旋酶-引物酶靶向分子的结构特征与合成路径全解析
已经有0人回复
-
化学工程及工业化学论文润色/翻译怎么收费?
已经有157人回复
-
利瑞鲁单抗：靶向KIR的NK细胞检查点工具抗体，结构基础与科研应用全解析
已经有0人回复
-
Wnt-C59：PORCN靶向化学探针，Wnt信号通路阻断机制与科研应用全解析
已经有0人回复
-
Fexaramine：肠道限制性FXR化学探针，结构特征与信号通路研究全解析
已经有0人回复
-
NVS-STG2：靶向STING跨膜域的分子胶类激动剂，结构特征与寡聚化机制研究全解析
已经有0人回复
-
DOTA-GPC3肽（CAS 3066439-94-6）：双功能分子探针前体的结构特征与标记应用解析
已经有0人回复
-
科研用 TLR7/8 双激动剂怎么选？现货与质控要点
已经有0人回复
-
SEL120-34A HCl：CDK8/CDK19高选择性激酶抑制剂
已经有0人回复
» 本主题相关价值贴推荐，对您同样有帮助:
dsrocean
木虫 (小有名气)
- 应助: 4 (幼儿园)
- 金币: 2398.7
- 散金: 30
- 帖子: 88
- 在线: 97.5小时
- 虫号: 2292064
- 注册: 2013-02-21
- 性别: GG
- 专业: 微生物资源与分类学
【答案】应助回帖
★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★
感谢参与，应助指数 +1
heihei2866: 金币+50, ★★★★★最佳答案 2015-12-23 17:31:25
感谢参与，应助指数 +1
heihei2866: 金币+50, ★★★★★最佳答案 2015-12-23 17:31:25
|
我去年提交的部分全基因组序列。序列可以提交至ncbi，我采用的在线提交，未提交的原始序列，可以仅仅提交contig。可以不注释。 发自小木虫Android客户端 |
4楼2015-11-20 02:42:11
y3211512
银虫 (初入文坛)
- 应助: 0 (幼儿园)
- 金币: 329.5
- 散金: 66
- 帖子: 21
- 在线: 8.9小时
- 虫号: 3763686
- 注册: 2015-03-25
- 性别: GG
- 专业: 微生物资源与分类学
2楼2015-11-19 11:35:03
heihei2866
铁虫 (正式写手)
- 应助: 0 (幼儿园)
- 金币: 200.9
- 散金: 541
- 红花: 2
- 帖子: 396
- 在线: 87.9小时
- 虫号: 401586
- 注册: 2007-06-13
- 性别: MM
- 专业: 生物大分子结构与功能
3楼2015-11-19 20:40:35
y3211512
银虫 (初入文坛)
- 应助: 0 (幼儿园)
- 金币: 329.5
- 散金: 66
- 帖子: 21
- 在线: 8.9小时
- 虫号: 3763686
- 注册: 2015-03-25
- 性别: GG
- 专业: 微生物资源与分类学
5楼2015-11-20 08:34:02
heihei2866
铁虫 (正式写手)
- 应助: 0 (幼儿园)
- 金币: 200.9
- 散金: 541
- 红花: 2
- 帖子: 396
- 在线: 87.9小时
- 虫号: 401586
- 注册: 2007-06-13
- 性别: MM
- 专业: 生物大分子结构与功能
6楼2015-11-20 08:41:49
heihei2866
铁虫 (正式写手)
- 应助: 0 (幼儿园)
- 金币: 200.9
- 散金: 541
- 红花: 2
- 帖子: 396
- 在线: 87.9小时
- 虫号: 401586
- 注册: 2007-06-13
- 性别: MM
- 专业: 生物大分子结构与功能
7楼2015-11-20 08:44:19
y3211512
银虫 (初入文坛)
- 应助: 0 (幼儿园)
- 金币: 329.5
- 散金: 66
- 帖子: 21
- 在线: 8.9小时
- 虫号: 3763686
- 注册: 2015-03-25
- 性别: GG
- 专业: 微生物资源与分类学
|
就是提取了出来，然后去跑液相，用乙腈:水15:85跑出来比较好的峰形，有大概八个峰，然后用凝胶柱接了100瓶，可是只在32瓶得到了比较纯的亚油酸，不是我需要的活性产物，我现在就想知道里面有哪些东西，大神有办法吗？ 发自小木虫Android客户端 |
8楼2015-11-20 09:29:12
heihei2866
铁虫 (正式写手)
- 应助: 0 (幼儿园)
- 金币: 200.9
- 散金: 541
- 红花: 2
- 帖子: 396
- 在线: 87.9小时
- 虫号: 401586
- 注册: 2007-06-13
- 性别: MM
- 专业: 生物大分子结构与功能
9楼2015-11-20 14:33:27
y3211512
银虫 (初入文坛)
- 应助: 0 (幼儿园)
- 金币: 329.5
- 散金: 66
- 帖子: 21
- 在线: 8.9小时
- 虫号: 3763686
- 注册: 2015-03-25
- 性别: GG
- 专业: 微生物资源与分类学
|
液质联用还没做，可是做了好像也只知道分子量，制备色谱上只有一个峰，不知道是不是我们这边的制备色谱坏了，亚油酸是过凝胶柱分离出来了单体做ei鉴定出来的，可是过凝胶柱其他的样都是混合的，无法鉴别啊！ 发自小木虫Android客户端 |
10楼2015-11-20 14:47:03