| 查看: 6528 | 回复: 31 | ||
| 当前只显示满足指定条件的回帖，点击这里查看本话题的所有回帖 | ||
明-明-金虫 (小有名气)
|
[求助]
cif文件中的原子电荷分配已有2人参与
|
|
|
我在数据库中找到了伊利石的cif文件，导入MS后，先点击calculate bonds，每个原子的电荷为零，然后没有进行手动分配电荷，构建超胞后，根据文献，采用UFF力场，Qeq算法来对其进行优化，然后就出现报错了。 This periodic system bears a net charge (-64.000000e) and the QEq calculation cannot be performed. This periodic system bears a net charge (-64.000000e) and the QEq calculation cannot be performed. Unable to calculate energy and gradients. Geometry optimization finished with an error condition. 查看报错后的晶体文件，每个原子的力场类型都分配了，但是charge还是为零，用compass力场就不会出现这种现象，优化后原子的电荷、力场均分配了。但查文献，一般是用UFF+Qeq来进行优化以及后续的吸附计算，请问这是什么原因？新人求助。。。是找来的cif文件构建晶体模型时都必须先手动分配原子电荷信息吗？ |
回复此楼» 猜你喜欢
康复大学泰山学者周祺惠团队招收博士研究生
已经有6人回复
-
AI论文写作工具：是科研加速器还是学术作弊器？
已经有3人回复
-
孩子确诊有中度注意力缺陷
已经有6人回复
-
2026博士申请-功能高分子，水凝胶方向
已经有6人回复
-
论文投稿，期刊推荐
已经有4人回复
-
硕士和导师闹得不愉快
已经有13人回复
-
请问2026国家基金面上项目会启动申2停1吗
已经有5人回复
-
同一篇文章，用不同账号投稿对编辑决定是否送审有没有影响？
已经有3人回复
-
ACS Applied Polymer Materials投稿
已经有10人回复
-
RSC ADV状态问题
已经有4人回复
明-明-
金虫 (小有名气)
- 应助: 0 (幼儿园)
- 金币: 1066.5
- 红花: 1
- 帖子: 111
- 在线: 80.7小时
- 虫号: 3796591
- 注册: 2015-04-08
- 性别: GG
- 专业: 能源化工
12楼2016-03-22 16:30:12
xie158795
金虫 (小有名气)
- 应助: 1 (幼儿园)
- 金币: 1313.1
- 散金: 520
- 红花: 13
- 帖子: 198
- 在线: 102.8小时
- 虫号: 4168815
- 注册: 2015-10-23
- 性别: GG
- 专业: 无机化学
【答案】应助回帖
★
感谢参与，应助指数 +1
明-明-: 金币+1, ★有帮助 2015-11-19 16:22:22
感谢参与，应助指数 +1
明-明-: 金币+1, ★有帮助 2015-11-19 16:22:22
|
你好！应该先初始化既先赋予电荷，再去优化！你有没有学过雅可比迭代，也要先赋予初始值的！同是想问问你的cif文件是在哪找到的？？？ 发自小木虫Android客户端 |
2楼2015-11-19 15:00:15
明-明-
金虫 (小有名气)
- 应助: 0 (幼儿园)
- 金币: 1066.5
- 红花: 1
- 帖子: 111
- 在线: 80.7小时
- 虫号: 3796591
- 注册: 2015-04-08
- 性别: GG
- 专业: 能源化工
3楼2015-11-19 16:21:49
xie158795
金虫 (小有名气)
- 应助: 1 (幼儿园)
- 金币: 1313.1
- 散金: 520
- 红花: 13
- 帖子: 198
- 在线: 102.8小时
- 虫号: 4168815
- 注册: 2015-10-23
- 性别: GG
- 专业: 无机化学
4楼2015-11-20 08:18:12